RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514495.1

CTBP1-214, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTBP1, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-214ENST00000514495 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.49■■■■■ 8.55
CTBP1-214ENST00000514495 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa61.28■■■■■ 7.4
CTBP1-214ENST00000514495 ABCC9O60706 1549 aa60.79■■■■■ 7.32
CTBP1-214ENST00000514495 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.09■■■■■ 6.89
CTBP1-214ENST00000514495 NACADO15069 1562 aa57.78■■■■■ 6.84
CTBP1-214ENST00000514495 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.65■■■■■ 6.82
CTBP1-214ENST00000514495 MYO15BQ96JP2 1530 aa57.1■■■■■ 6.73
CTBP1-214ENST00000514495 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.89■■■■■ 6.7
CTBP1-214ENST00000514495 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.8■■■■■ 6.68
CTBP1-214ENST00000514495 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.65■■■■■ 6.662e-8■■□□□ 12.2
CTBP1-214ENST00000514495 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.58■■■■■ 6.65
CTBP1-214ENST00000514495 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.46■■■■■ 6.63
CTBP1-214ENST00000514495 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.33■■■■■ 6.61
CTBP1-214ENST00000514495 SCRIBQ14160 1630 aa55.92■■■■■ 6.54
CTBP1-214ENST00000514495 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.63■■■■■ 6.5
CTBP1-214ENST00000514495 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.94■■■■■ 6.39
CTBP1-214ENST00000514495 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.94■■■■■ 6.39
CTBP1-214ENST00000514495 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.69■■■■■ 6.35
CTBP1-214ENST00000514495 SMARCA4P51532 1647 aa53.35■■■■■ 6.13
CTBP1-214ENST00000514495 NCAPD3P42695 1498 aa53.29■■■■■ 6.12
CTBP1-214ENST00000514495 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.24■■■■■ 6.11
CTBP1-214ENST00000514495 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP53.16■■■■■ 6.1
CTBP1-214ENST00000514495 SMARCA2P51531 1590 aa53.15■■■■■ 6.1
CTBP1-214ENST00000514495 HMGXB3Q12766 1538 aa53■■■■■ 6.07
CTBP1-214ENST00000514495 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.8■■■■■ 6.04
CTBP1-214ENST00000514495 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.79■■■■■ 6.04
CTBP1-214ENST00000514495 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.79■■■■■ 6.04
CTBP1-214ENST00000514495 ERCC6Q03468 1493 aa52.49■■■■■ 5.99
CTBP1-214ENST00000514495 NESP48681 1621 aa52.35■■■■■ 5.97
CTBP1-214ENST00000514495 WIZO95785 1651 aa52.22■■■■■ 5.95
CTBP1-214ENST00000514495 CUX2O14529 1486 aa52.16■■■■■ 5.94
CTBP1-214ENST00000514495 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.08■■■■■ 5.93
CTBP1-214ENST00000514495 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.85■■■■■ 5.89
CTBP1-214ENST00000514495 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.75■■■■■ 5.87
CTBP1-214ENST00000514495 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.74■■■■■ 5.87
CTBP1-214ENST00000514495 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.74■■■■■ 5.87
CTBP1-214ENST00000514495 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.72■■■■■ 5.87
CTBP1-214ENST00000514495 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.59■■■■■ 5.85
CTBP1-214ENST00000514495 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.48■■■■■ 5.83
CTBP1-214ENST00000514495 MRC2Q9UBG0 1479 aa51.29■■■■■ 5.8
CTBP1-214ENST00000514495 CFTRP13569 1480 aa51.23■■■■■ 5.79
CTBP1-214ENST00000514495 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.2■■■■■ 5.79
CTBP1-214ENST00000514495 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.17■■■■■ 5.78
CTBP1-214ENST00000514495 WDR62O43379 1518 aa51.13■■■■■ 5.78
CTBP1-214ENST00000514495 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.97■■■■■ 5.75
CTBP1-214ENST00000514495 PRDM2Q13029 1718 aa50.87■■■■■ 5.73
CTBP1-214ENST00000514495 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.71■■■■■ 5.71
CTBP1-214ENST00000514495 TOPBP1Q92547 1522 aa50.26■■■■■ 5.64
CTBP1-214ENST00000514495 ABCC8Q09428 1581 aa50.17■■■■■ 5.62
CTBP1-214ENST00000514495 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.14■■■■■ 5.62
CTBP1-214ENST00000514495 IFT140Q96RY7 1462 aa50.14■■■■■ 5.62
CTBP1-214ENST00000514495 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.01■■■■■ 5.6
CTBP1-214ENST00000514495 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.01■■■■■ 5.6
CTBP1-214ENST00000514495 OSCARQ8IYS5 282 aa49.84■■■■■ 5.57
CTBP1-214ENST00000514495 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.8■■■■■ 5.56
CTBP1-214ENST00000514495 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.77■■■■■ 5.56
CTBP1-214ENST00000514495 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.77■■■■■ 5.56
CTBP1-214ENST00000514495 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.61■■■■■ 5.537e-7■■□□□ 14.1
CTBP1-214ENST00000514495 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.59■■■■■ 5.53
CTBP1-214ENST00000514495 CUX1P39880 1505 aa49.57■■■■■ 5.53
CTBP1-214ENST00000514495 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.56■■■■■ 5.52
CTBP1-214ENST00000514495 SOGA1O94964 1423 aa49.55■■■■■ 5.52
CTBP1-214ENST00000514495 TRIM41Q8WV44 630 aa49.55■■■■■ 5.52
CTBP1-214ENST00000514495 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.39■■■■■ 5.5
CTBP1-214ENST00000514495 CHD1O14646 1710 aa49.35■■■■■ 5.49
CTBP1-214ENST00000514495 WDR97A6NE52 1622 aa49.31■■■■■ 5.48
CTBP1-214ENST00000514495 FBLN2P98095 1184 aa49.23■■■■■ 5.47
CTBP1-214ENST00000514495 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.2■■■■■ 5.47
CTBP1-214ENST00000514495 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.2■■■■■ 5.47
CTBP1-214ENST00000514495 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.2■■■■■ 5.47
CTBP1-214ENST00000514495 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.16■■■■■ 5.46
CTBP1-214ENST00000514495 ARHGEF11O15085 1522 aa49.09■■■■■ 5.45
CTBP1-214ENST00000514495 GRIN2BQ13224 1484 aa49.07■■■■■ 5.45
CTBP1-214ENST00000514495 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49.02■■■■■ 5.44
CTBP1-214ENST00000514495 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49■■■■■ 5.43
CTBP1-214ENST00000514495 PBRM1Q86U86 1689 aa48.99■■■■■ 5.43
CTBP1-214ENST00000514495 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.97■■■■■ 5.43
CTBP1-214ENST00000514495 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.95■■■■■ 5.43
CTBP1-214ENST00000514495 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.95■■■■■ 5.434e-8■■■■■ 27.9
CTBP1-214ENST00000514495 TOP2BQ02880 1626 aa48.94■■■■■ 5.42
CTBP1-214ENST00000514495 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.92■■■■■ 5.42
CTBP1-214ENST00000514495 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.91■■■■■ 5.42
CTBP1-214ENST00000514495 SYNJ1O43426 1573 aa48.9■■■■■ 5.42
CTBP1-214ENST00000514495 SYNJ2O15056 1496 aa48.85■■■■■ 5.41
CTBP1-214ENST00000514495 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.74■■■■■ 5.39
CTBP1-214ENST00000514495 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.66■■■■■ 5.38
CTBP1-214ENST00000514495 ARAP1Q96P48 1450 aa48.62■■■■■ 5.37
CTBP1-214ENST00000514495 ADAMTS12P58397 1594 aa48.52■■■■■ 5.36
CTBP1-214ENST00000514495 GRIN2AQ12879 1464 aa48.45■■■■■ 5.35
CTBP1-214ENST00000514495 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.41■■■■■ 5.34
CTBP1-214ENST00000514495 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.36■■■■■ 5.33
CTBP1-214ENST00000514495 CEP170Q5SW79 1584 aa48.26■■■■■ 5.32
CTBP1-214ENST00000514495 NUP160Q12769 1436 aa48.24■■■■■ 5.31
CTBP1-214ENST00000514495 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.03■■■■■ 5.28
CTBP1-214ENST00000514495 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.01■■■■■ 5.28
CTBP1-214ENST00000514495 SHROOM2Q13796 1616 aa47.99■■■■■ 5.27
CTBP1-214ENST00000514495 KIF27Q86VH2 1401 aa47.98■■■■■ 5.27
CTBP1-214ENST00000514495 IGF1RP08069 1367 aa47.85■■■■■ 5.25
CTBP1-214ENST00000514495 CUL7Q14999 1698 aa47.84■■■■■ 5.25
CTBP1-214ENST00000514495 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.82■■■■■ 5.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms