Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EFNA3P52797 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA3P52797 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms