Protein–RNA interactions for Protein: P51688

SGSH, N-sulphoglucosamine sulphohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSHP51688 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGSHP51688 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SGSHP51688 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGSHP51688 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGSHP51688 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGSHP51688 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGSHP51688 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGSHP51688 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGSHP51688 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGSHP51688 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGSHP51688 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGSHP51688 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGSHP51688 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGSHP51688 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGSHP51688 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGSHP51688 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGSHP51688 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SGSHP51688 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SGSHP51688 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SGSHP51688 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SGSHP51688 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGSHP51688 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGSHP51688 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SGSHP51688 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGSHP51688 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGSHP51688 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGSHP51688 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGSHP51688 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGSHP51688 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGSHP51688 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGSHP51688 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGSHP51688 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGSHP51688 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGSHP51688 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGSHP51688 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGSHP51688 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGSHP51688 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGSHP51688 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGSHP51688 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SGSHP51688 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGSHP51688 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGSHP51688 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGSHP51688 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGSHP51688 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGSHP51688 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGSHP51688 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGSHP51688 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGSHP51688 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGSHP51688 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGSHP51688 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGSHP51688 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGSHP51688 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGSHP51688 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SGSHP51688 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SGSHP51688 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGSHP51688 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGSHP51688 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGSHP51688 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGSHP51688 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGSHP51688 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGSHP51688 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGSHP51688 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGSHP51688 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGSHP51688 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGSHP51688 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGSHP51688 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGSHP51688 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGSHP51688 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SGSHP51688 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGSHP51688 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGSHP51688 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGSHP51688 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SGSHP51688 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGSHP51688 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SGSHP51688 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGSHP51688 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGSHP51688 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGSHP51688 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGSHP51688 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGSHP51688 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGSHP51688 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGSHP51688 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGSHP51688 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SGSHP51688 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGSHP51688 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGSHP51688 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGSHP51688 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGSHP51688 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGSHP51688 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGSHP51688 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGSHP51688 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGSHP51688 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGSHP51688 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGSHP51688 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGSHP51688 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGSHP51688 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGSHP51688 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGSHP51688 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGSHP51688 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGSHP51688 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms