Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXB3P14651 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms