RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615792.1

CAMK1D-203, Transcript of calcium/calmodulin dependent protein kinase ID, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAMK1D, Length 1,725 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK1D-203ENST00000615792 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.4■■■■■ 6.78
CAMK1D-203ENST00000615792 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.36■■■■■ 5.65
CAMK1D-203ENST00000615792 ABCC9O60706 1549 aa48.36■■■■■ 5.33
CAMK1D-203ENST00000615792 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.03■■■■■ 5.28
CAMK1D-203ENST00000615792 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.73■■■■■ 5.23
CAMK1D-203ENST00000615792 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.44■■■■■ 5.19
CAMK1D-203ENST00000615792 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.18■■■■■ 5.14
CAMK1D-203ENST00000615792 NACADO15069 1562 aa47.13■■■■■ 5.13
CAMK1D-203ENST00000615792 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.89■■■■■ 5.1
CAMK1D-203ENST00000615792 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.29■■■■■ 5
CAMK1D-203ENST00000615792 SCRIBQ14160 1630 aa46.21■■■■■ 4.99
CAMK1D-203ENST00000615792 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.88■■■■■ 4.94
CAMK1D-203ENST00000615792 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.49■■■■■ 4.87
CAMK1D-203ENST00000615792 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.49■■■■■ 4.87
CAMK1D-203ENST00000615792 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.67■■■■■ 4.74
CAMK1D-203ENST00000615792 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.36■■■■■ 4.69
CAMK1D-203ENST00000615792 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.31■■■■■ 4.68
CAMK1D-203ENST00000615792 SMARCA4P51532 1647 aa44.25■■■■■ 4.67
CAMK1D-203ENST00000615792 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.24■■■■■ 4.67
CAMK1D-203ENST00000615792 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.2■■■■■ 4.67
CAMK1D-203ENST00000615792 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
CAMK1D-203ENST00000615792 WIZO95785 1651 aa43.89■■■■■ 4.62
CAMK1D-203ENST00000615792 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.75■■■■■ 4.59
CAMK1D-203ENST00000615792 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.75■■■■■ 4.59
CAMK1D-203ENST00000615792 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.73■■■■■ 4.59
CAMK1D-203ENST00000615792 SMARCA2P51531 1590 aa43.69■■■■■ 4.58
CAMK1D-203ENST00000615792 NCAPD3P42695 1498 aa43.52■■■■■ 4.56
CAMK1D-203ENST00000615792 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
CAMK1D-203ENST00000615792 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
CAMK1D-203ENST00000615792 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.4■■■■■ 4.54
CAMK1D-203ENST00000615792 HMGXB3Q12766 1538 aa43.35■■■■■ 4.53
CAMK1D-203ENST00000615792 CCDC88BA6NC98 1476 aa43■■■■■ 4.47
CAMK1D-203ENST00000615792 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.37■■■■■ 4.37
CAMK1D-203ENST00000615792 CFTRP13569 1480 aa42.33■■■■■ 4.37
CAMK1D-203ENST00000615792 NESP48681 1621 aa42.21■■■■■ 4.35
CAMK1D-203ENST00000615792 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.13■■■■■ 4.33
CAMK1D-203ENST00000615792 PRDM2Q13029 1718 aa41.99■■■■■ 4.31
CAMK1D-203ENST00000615792 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.91■■■■■ 4.3
CAMK1D-203ENST00000615792 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.87■■■■■ 4.29
CAMK1D-203ENST00000615792 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.87■■■■■ 4.29
CAMK1D-203ENST00000615792 ABCC8Q09428 1581 aa41.81■■■■■ 4.28
CAMK1D-203ENST00000615792 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.67■■■■■ 4.26
CAMK1D-203ENST00000615792 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.66■■■■■ 4.26
CAMK1D-203ENST00000615792 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.66■■■■■ 4.26
CAMK1D-203ENST00000615792 TRIM41Q8WV44 630 aa41.62■■■■■ 4.25
CAMK1D-203ENST00000615792 ERCC6Q03468 1493 aa41.54■■■■■ 4.24
CAMK1D-203ENST00000615792 SYNJ1O43426 1573 aa41.49■■■■■ 4.23
CAMK1D-203ENST00000615792 CUX1P39880 1505 aa41.47■■■■■ 4.23
CAMK1D-203ENST00000615792 TOP2BQ02880 1626 aa41.38■■■■■ 4.22
CAMK1D-203ENST00000615792 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
CAMK1D-203ENST00000615792 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.35■■■■■ 4.21
CAMK1D-203ENST00000615792 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.34■■■■■ 4.21
CAMK1D-203ENST00000615792 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.33■■■■■ 4.21
CAMK1D-203ENST00000615792 TOPBP1Q92547 1522 aa41.32■■■■■ 4.21
CAMK1D-203ENST00000615792 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
CAMK1D-203ENST00000615792 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.15■■■■■ 4.18
CAMK1D-203ENST00000615792 WDR62O43379 1518 aa41.14■■■■■ 4.18
CAMK1D-203ENST00000615792 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
CAMK1D-203ENST00000615792 SOGA1O94964 1423 aa40.96■■■■■ 4.15
CAMK1D-203ENST00000615792 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.94■■■■■ 4.14
CAMK1D-203ENST00000615792 CUX2O14529 1486 aa40.87■■■■■ 4.13
CAMK1D-203ENST00000615792 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
CAMK1D-203ENST00000615792 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.79■■■■■ 4.12
CAMK1D-203ENST00000615792 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.77■■■■■ 4.12
CAMK1D-203ENST00000615792 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
CAMK1D-203ENST00000615792 IFT140Q96RY7 1462 aa40.73■■■■■ 4.11
CAMK1D-203ENST00000615792 KIF27Q86VH2 1401 aa40.68■■■■■ 4.1
CAMK1D-203ENST00000615792 WDR97A6NE52 1622 aa40.65■■■■■ 4.1
CAMK1D-203ENST00000615792 EEA1Q15075 1411 aa40.65■■■■■ 4.1
CAMK1D-203ENST00000615792 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
CAMK1D-203ENST00000615792 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.56■■■■■ 4.08
CAMK1D-203ENST00000615792 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
CAMK1D-203ENST00000615792 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.5■■■■■ 4.07
CAMK1D-203ENST00000615792 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.47■■■■■ 4.07
CAMK1D-203ENST00000615792 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.47■■■■■ 4.07
CAMK1D-203ENST00000615792 IGF1RP08069 1367 aa40.44■■■■■ 4.06
CAMK1D-203ENST00000615792 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
CAMK1D-203ENST00000615792 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.29■■■■■ 4.04
CAMK1D-203ENST00000615792 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.28■■■■■ 4.04
CAMK1D-203ENST00000615792 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.27■■■■■ 4.04
CAMK1D-203ENST00000615792 GRIN2BQ13224 1484 aa40.27■■■■■ 4.04
CAMK1D-203ENST00000615792 PBRM1Q86U86 1689 aa40.24■■■■■ 4.03
CAMK1D-203ENST00000615792 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.21■■■■■ 4.03
CAMK1D-203ENST00000615792 PRXQ9BXM0 1461 aa40.21■■■■■ 4.03
CAMK1D-203ENST00000615792 KIF21BO75037 1637 aa40.13■■■■■ 4.01
CAMK1D-203ENST00000615792 CUL7Q14999 1698 aa40.11■■■■■ 4.01
CAMK1D-203ENST00000615792 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.09■■■■■ 4.01
CAMK1D-203ENST00000615792 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.08■■■■■ 4.01
CAMK1D-203ENST00000615792 GOLGA3Q08378 1498 aa40.05■■■■■ 4
CAMK1D-203ENST00000615792 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.02■■■■■ 4
CAMK1D-203ENST00000615792 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40■■■■□ 3.99
CAMK1D-203ENST00000615792 ADAMTS12P58397 1594 aa39.99■■■■□ 3.99
CAMK1D-203ENST00000615792 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
CAMK1D-203ENST00000615792 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
CAMK1D-203ENST00000615792 SYNJ2O15056 1496 aa39.86■■■■□ 3.97
CAMK1D-203ENST00000615792 FBLN2P98095 1184 aa39.85■■■■□ 3.97
CAMK1D-203ENST00000615792 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.81■■■■□ 3.96
CAMK1D-203ENST00000615792 GRIN2AQ12879 1464 aa39.77■■■■□ 3.96
CAMK1D-203ENST00000615792 CHD1O14646 1710 aa39.61■■■■□ 3.93
CAMK1D-203ENST00000615792 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.56■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms