RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283474.11

UBALD1-201, Transcript of UBA like domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBALD1, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBALD1-201ENST00000283474 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.52■■■■■ 6.64
UBALD1-201ENST00000283474 ABCC9O60706 1549 aa51.13■■■■■ 5.78
UBALD1-201ENST00000283474 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.79■■■■■ 5.72
UBALD1-201ENST00000283474 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.53■■■■■ 5.36
UBALD1-201ENST00000283474 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.24■■■■■ 5.31
UBALD1-201ENST00000283474 NACADO15069 1562 aa48.12■■■■■ 5.29
UBALD1-201ENST00000283474 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.9■■■■■ 5.26
UBALD1-201ENST00000283474 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.59■■■■■ 5.21
UBALD1-201ENST00000283474 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.36■■■■■ 5.17
UBALD1-201ENST00000283474 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.36■■■■■ 5.17
UBALD1-201ENST00000283474 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.11■■■■■ 5.13
UBALD1-201ENST00000283474 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.77■■■■■ 5.08
UBALD1-201ENST00000283474 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.66■■■■■ 5.06
UBALD1-201ENST00000283474 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.46■■■■■ 5.03
UBALD1-201ENST00000283474 SCRIBQ14160 1630 aa46.29■■■■■ 5
UBALD1-201ENST00000283474 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.15■■■■■ 4.98
UBALD1-201ENST00000283474 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.1■■■■■ 4.97
UBALD1-201ENST00000283474 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.99■■■■■ 4.95
UBALD1-201ENST00000283474 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.51■■■■■ 4.72
UBALD1-201ENST00000283474 NCAPD3P42695 1498 aa44.45■■■■■ 4.71
UBALD1-201ENST00000283474 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.27■■■■■ 4.68
UBALD1-201ENST00000283474 ERCC6Q03468 1493 aa44.19■■■■■ 4.66
UBALD1-201ENST00000283474 CUX2O14529 1486 aa44.18■■■■■ 4.66
UBALD1-201ENST00000283474 SMARCA2P51531 1590 aa44.13■■■■■ 4.65
UBALD1-201ENST00000283474 SMARCA4P51532 1647 aa44.12■■■■■ 4.65
UBALD1-201ENST00000283474 HMGXB3Q12766 1538 aa44.07■■■■■ 4.65
UBALD1-201ENST00000283474 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.89■■■■■ 4.62
UBALD1-201ENST00000283474 NESP48681 1621 aa43.83■■■■■ 4.61
UBALD1-201ENST00000283474 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.83■■■■■ 4.61
UBALD1-201ENST00000283474 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.7■■■■■ 4.59
UBALD1-201ENST00000283474 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.54■■■■■ 4.56
UBALD1-201ENST00000283474 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.47■■■■■ 4.55
UBALD1-201ENST00000283474 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.42■■■■■ 4.54
UBALD1-201ENST00000283474 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.27■■■■■ 4.52
UBALD1-201ENST00000283474 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.21■■■■■ 4.51
UBALD1-201ENST00000283474 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.1■■■■■ 4.49
UBALD1-201ENST00000283474 WIZO95785 1651 aa42.98■■■■■ 4.47
UBALD1-201ENST00000283474 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.89■■■■■ 4.46
UBALD1-201ENST00000283474 WDR62O43379 1518 aa42.78■■■■■ 4.44
UBALD1-201ENST00000283474 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.67■■■■■ 4.42
UBALD1-201ENST00000283474 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.6■■■■■ 4.41
UBALD1-201ENST00000283474 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
UBALD1-201ENST00000283474 CFTRP13569 1480 aa42.53■■■■■ 4.4
UBALD1-201ENST00000283474 TRIM41Q8WV44 630 aa42.46■■■■■ 4.39
UBALD1-201ENST00000283474 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
UBALD1-201ENST00000283474 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.36
UBALD1-201ENST00000283474 OSCARQ8IYS5 282 aa42.16■■■■■ 4.34
UBALD1-201ENST00000283474 PRDM2Q13029 1718 aa42■■■■■ 4.31
UBALD1-201ENST00000283474 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.98■■■■■ 4.31
UBALD1-201ENST00000283474 IFT140Q96RY7 1462 aa41.83■■■■■ 4.29
UBALD1-201ENST00000283474 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
UBALD1-201ENST00000283474 TOPBP1Q92547 1522 aa41.75■■■■■ 4.27
UBALD1-201ENST00000283474 ABCC8Q09428 1581 aa41.66■■■■■ 4.26
UBALD1-201ENST00000283474 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.58■■■■■ 4.25
UBALD1-201ENST00000283474 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.58■■■■■ 4.25
UBALD1-201ENST00000283474 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.58■■■■■ 4.25
UBALD1-201ENST00000283474 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.56■■■■■ 4.24
UBALD1-201ENST00000283474 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
UBALD1-201ENST00000283474 ARHGEF11O15085 1522 aa41.44■■■■■ 4.22
UBALD1-201ENST00000283474 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.39■■■■■ 4.22
UBALD1-201ENST00000283474 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.22
UBALD1-201ENST00000283474 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
UBALD1-201ENST00000283474 CHD1O14646 1710 aa41.24■■■■■ 4.19
UBALD1-201ENST00000283474 FBLN2P98095 1184 aa41.21■■■■■ 4.19
UBALD1-201ENST00000283474 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.2■■■■■ 4.19
UBALD1-201ENST00000283474 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.17■■■■■ 4.18
UBALD1-201ENST00000283474 SOGA1O94964 1423 aa41.14■■■■■ 4.18
UBALD1-201ENST00000283474 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
UBALD1-201ENST00000283474 ARAP1Q96P48 1450 aa41.01■■■■■ 4.16
UBALD1-201ENST00000283474 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.01■■■■■ 4.16
UBALD1-201ENST00000283474 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.94■■■■■ 4.15
UBALD1-201ENST00000283474 WDR97A6NE52 1622 aa40.94■■■■■ 4.14
UBALD1-201ENST00000283474 CUX1P39880 1505 aa40.93■■■■■ 4.14
UBALD1-201ENST00000283474 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
UBALD1-201ENST00000283474 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
UBALD1-201ENST00000283474 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.13
UBALD1-201ENST00000283474 GRIN2BQ13224 1484 aa40.81■■■■■ 4.12
UBALD1-201ENST00000283474 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.79■■■■■ 4.12
UBALD1-201ENST00000283474 SYNJ1O43426 1573 aa40.75■■■■■ 4.11
UBALD1-201ENST00000283474 SYNJ2O15056 1496 aa40.7■■■■■ 4.11
UBALD1-201ENST00000283474 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.63■■■■■ 4.09
UBALD1-201ENST00000283474 PBRM1Q86U86 1689 aa40.56■■■■■ 4.08
UBALD1-201ENST00000283474 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.53■■■■■ 4.08
UBALD1-201ENST00000283474 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.5■■■■■ 4.07
UBALD1-201ENST00000283474 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.46■■■■■ 4.07
UBALD1-201ENST00000283474 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.34■■■■■ 4.05
UBALD1-201ENST00000283474 GRIN2AQ12879 1464 aa40.27■■■■■ 4.04
UBALD1-201ENST00000283474 ADAMTS12P58397 1594 aa40.19■■■■■ 4.02
UBALD1-201ENST00000283474 TOP2BQ02880 1626 aa40.18■■■■■ 4.02
UBALD1-201ENST00000283474 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.16■■■■■ 4.02
UBALD1-201ENST00000283474 NUP160Q12769 1436 aa40.15■■■■■ 4.02
UBALD1-201ENST00000283474 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.14■■■■■ 4.02
UBALD1-201ENST00000283474 CEP170Q5SW79 1584 aa40.13■■■■■ 4.01
UBALD1-201ENST00000283474 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.1■■■■■ 4.01
UBALD1-201ENST00000283474 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.01■■■■■ 4
UBALD1-201ENST00000283474 SHROOM2Q13796 1616 aa39.97■■■■□ 3.99
UBALD1-201ENST00000283474 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
UBALD1-201ENST00000283474 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
UBALD1-201ENST00000283474 JPH4Q96JJ6 628 aa39.78■■■■□ 3.96
UBALD1-201ENST00000283474 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.63■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms