RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412178.1

HM13-AS1-201, HM13 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HM13-AS1, Length 489 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HM13-AS1-201ENST00000412178 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.84■■■■■ 6.69
HM13-AS1-201ENST00000412178 ABCC9O60706 1549 aa51.24■■■■■ 5.79
HM13-AS1-201ENST00000412178 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.93■■■■■ 5.74
HM13-AS1-201ENST00000412178 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.62■■■■■ 5.37
HM13-AS1-201ENST00000412178 NACADO15069 1562 aa48.26■■■■■ 5.32
HM13-AS1-201ENST00000412178 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.25■■■■■ 5.31
HM13-AS1-201ENST00000412178 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.22■■■■■ 5.31
HM13-AS1-201ENST00000412178 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.78■■■■■ 5.24
HM13-AS1-201ENST00000412178 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.52■■■■■ 5.2
HM13-AS1-201ENST00000412178 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.45■■■■■ 5.19
HM13-AS1-201ENST00000412178 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.23■■■■■ 5.15
HM13-AS1-201ENST00000412178 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.08■■■■■ 5.13
HM13-AS1-201ENST00000412178 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.89■■■■■ 5.1
HM13-AS1-201ENST00000412178 SCRIBQ14160 1630 aa46.53■■■■■ 5.04
HM13-AS1-201ENST00000412178 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.5■■■■■ 5.03
HM13-AS1-201ENST00000412178 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.21■■■■■ 4.99
HM13-AS1-201ENST00000412178 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.14■■■■■ 4.98
HM13-AS1-201ENST00000412178 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.09■■■■■ 4.97
HM13-AS1-201ENST00000412178 NCAPD3P42695 1498 aa44.6■■■■■ 4.73
HM13-AS1-201ENST00000412178 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.47■■■■■ 4.71
HM13-AS1-201ENST00000412178 SMARCA4P51532 1647 aa44.33■■■■■ 4.69
HM13-AS1-201ENST00000412178 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.33■■■■■ 4.69
HM13-AS1-201ENST00000412178 SMARCA2P51531 1590 aa44.28■■■■■ 4.68
HM13-AS1-201ENST00000412178 ERCC6Q03468 1493 aa44.23■■■■■ 4.67
HM13-AS1-201ENST00000412178 HMGXB3Q12766 1538 aa44.19■■■■■ 4.67
HM13-AS1-201ENST00000412178 CUX2O14529 1486 aa44.13■■■■■ 4.65
HM13-AS1-201ENST00000412178 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.1■■■■■ 4.65
HM13-AS1-201ENST00000412178 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.02■■■■■ 4.64
HM13-AS1-201ENST00000412178 NESP48681 1621 aa43.99■■■■■ 4.63
HM13-AS1-201ENST00000412178 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.88■■■■■ 4.61
HM13-AS1-201ENST00000412178 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.84■■■■■ 4.61
HM13-AS1-201ENST00000412178 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.56■■■■■ 4.56
HM13-AS1-201ENST00000412178 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.46■■■■■ 4.55
HM13-AS1-201ENST00000412178 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.38■■■■■ 4.53
HM13-AS1-201ENST00000412178 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.3■■■■■ 4.52
HM13-AS1-201ENST00000412178 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.28■■■■■ 4.52
HM13-AS1-201ENST00000412178 WIZO95785 1651 aa43.27■■■■■ 4.52
HM13-AS1-201ENST00000412178 MRC2Q9UBG0 1479 aa43■■■■■ 4.47
HM13-AS1-201ENST00000412178 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.9■■■■■ 4.46
HM13-AS1-201ENST00000412178 WDR62O43379 1518 aa42.87■■■■■ 4.45
HM13-AS1-201ENST00000412178 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.81■■■■■ 4.44
HM13-AS1-201ENST00000412178 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.77■■■■■ 4.44
HM13-AS1-201ENST00000412178 CFTRP13569 1480 aa42.73■■■■■ 4.43
HM13-AS1-201ENST00000412178 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.7■■■■■ 4.43
HM13-AS1-201ENST00000412178 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.42■■■■■ 4.38
HM13-AS1-201ENST00000412178 TRIM41Q8WV44 630 aa42.42■■■■■ 4.38
HM13-AS1-201ENST00000412178 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.29■■■■■ 4.36
HM13-AS1-201ENST00000412178 OSCARQ8IYS5 282 aa42.2■■■■■ 4.35
HM13-AS1-201ENST00000412178 PRDM2Q13029 1718 aa42.12■■■■■ 4.33
HM13-AS1-201ENST00000412178 IFT140Q96RY7 1462 aa41.95■■■■■ 4.31
HM13-AS1-201ENST00000412178 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
HM13-AS1-201ENST00000412178 TOPBP1Q92547 1522 aa41.94■■■■■ 4.3
HM13-AS1-201ENST00000412178 ABCC8Q09428 1581 aa41.8■■■■■ 4.28
HM13-AS1-201ENST00000412178 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.73■■■■■ 4.27
HM13-AS1-201ENST00000412178 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
HM13-AS1-201ENST00000412178 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.58■■■■■ 4.25
HM13-AS1-201ENST00000412178 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.56■■■■■ 4.24
HM13-AS1-201ENST00000412178 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.56■■■■■ 4.24
HM13-AS1-201ENST00000412178 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.56■■■■■ 4.24
HM13-AS1-201ENST00000412178 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
HM13-AS1-201ENST00000412178 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
HM13-AS1-201ENST00000412178 ARHGEF11O15085 1522 aa41.45■■■■■ 4.23
HM13-AS1-201ENST00000412178 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.41■■■■■ 4.22
HM13-AS1-201ENST00000412178 FBLN2P98095 1184 aa41.39■■■■■ 4.22
HM13-AS1-201ENST00000412178 SOGA1O94964 1423 aa41.35■■■■■ 4.21
HM13-AS1-201ENST00000412178 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.21
HM13-AS1-201ENST00000412178 CHD1O14646 1710 aa41.31■■■■■ 4.2
HM13-AS1-201ENST00000412178 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.27■■■■■ 4.2
HM13-AS1-201ENST00000412178 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.23■■■■■ 4.19
HM13-AS1-201ENST00000412178 CUX1P39880 1505 aa41.18■■■■■ 4.18
HM13-AS1-201ENST00000412178 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.1■■■■■ 4.17
HM13-AS1-201ENST00000412178 ARAP1Q96P48 1450 aa41.05■■■■■ 4.16
HM13-AS1-201ENST00000412178 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
HM13-AS1-201ENST00000412178 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
HM13-AS1-201ENST00000412178 WDR97A6NE52 1622 aa41.03■■■■■ 4.16
HM13-AS1-201ENST00000412178 GRIN2BQ13224 1484 aa40.96■■■■■ 4.15
HM13-AS1-201ENST00000412178 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.95■■■■■ 4.15
HM13-AS1-201ENST00000412178 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.87■■■■■ 4.13
HM13-AS1-201ENST00000412178 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
HM13-AS1-201ENST00000412178 SYNJ2O15056 1496 aa40.83■■■■■ 4.13
HM13-AS1-201ENST00000412178 SYNJ1O43426 1573 aa40.83■■■■■ 4.13
HM13-AS1-201ENST00000412178 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.83■■■■■ 4.13
HM13-AS1-201ENST00000412178 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.73■■■■■ 4.11
HM13-AS1-201ENST00000412178 PBRM1Q86U86 1689 aa40.71■■■■■ 4.11
HM13-AS1-201ENST00000412178 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.64■■■■■ 4.1
HM13-AS1-201ENST00000412178 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.59■■■■■ 4.09
HM13-AS1-201ENST00000412178 TOP2BQ02880 1626 aa40.44■■■■■ 4.06
HM13-AS1-201ENST00000412178 GRIN2AQ12879 1464 aa40.44■■■■■ 4.06
HM13-AS1-201ENST00000412178 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.41■■■■■ 4.06
HM13-AS1-201ENST00000412178 ADAMTS12P58397 1594 aa40.35■■■■■ 4.05
HM13-AS1-201ENST00000412178 NUP160Q12769 1436 aa40.31■■■■■ 4.04
HM13-AS1-201ENST00000412178 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.3■■■■■ 4.04
HM13-AS1-201ENST00000412178 CEP170Q5SW79 1584 aa40.29■■■■■ 4.04
HM13-AS1-201ENST00000412178 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.28■■■■■ 4.04
HM13-AS1-201ENST00000412178 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.2■■■■■ 4.03
HM13-AS1-201ENST00000412178 SHROOM2Q13796 1616 aa40.07■■■■■ 4.01
HM13-AS1-201ENST00000412178 JPH4Q96JJ6 628 aa39.98■■■■□ 3.99
HM13-AS1-201ENST00000412178 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
HM13-AS1-201ENST00000412178 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.78■■■■□ 3.96
HM13-AS1-201ENST00000412178 IGF1RP08069 1367 aa39.76■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.3 ms