Protein–RNA interactions for Protein: O60637

TSPAN3, Tetraspanin-3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3O60637 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN3O60637 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN3O60637 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN3O60637 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN3O60637 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN3O60637 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN3O60637 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN3O60637 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN3O60637 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN3O60637 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN3O60637 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN3O60637 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN3O60637 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TSPAN3O60637 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN3O60637 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSPAN3O60637 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN3O60637 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN3O60637 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN3O60637 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN3O60637 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN3O60637 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN3O60637 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN3O60637 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN3O60637 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN3O60637 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN3O60637 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN3O60637 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN3O60637 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN3O60637 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN3O60637 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN3O60637 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms