Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRKAB2O43741 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRKAB2O43741 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRKAB2O43741 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRKAB2O43741 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRKAB2O43741 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKAB2O43741 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKAB2O43741 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKAB2O43741 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKAB2O43741 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKAB2O43741 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKAB2O43741 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKAB2O43741 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKAB2O43741 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRKAB2O43741 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKAB2O43741 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKAB2O43741 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKAB2O43741 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms