Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PRKAB2O43741 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PRKAB2O43741 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
PRKAB2O43741 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
PRKAB2O43741 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
PRKAB2O43741 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
PRKAB2O43741 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
PRKAB2O43741 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PRKAB2O43741 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
PRKAB2O43741 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
PRKAB2O43741 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
PRKAB2O43741 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PRKAB2O43741 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PRKAB2O43741 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
PRKAB2O43741 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
PRKAB2O43741 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PRKAB2O43741 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PRKAB2O43741 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PRKAB2O43741 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PRKAB2O43741 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PRKAB2O43741 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PRKAB2O43741 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PRKAB2O43741 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PRKAB2O43741 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PRKAB2O43741 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PRKAB2O43741 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PRKAB2O43741 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PRKAB2O43741 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PRKAB2O43741 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PRKAB2O43741 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRKAB2O43741 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PRKAB2O43741 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PRKAB2O43741 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRKAB2O43741 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PRKAB2O43741 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PRKAB2O43741 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PRKAB2O43741 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PRKAB2O43741 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PRKAB2O43741 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PRKAB2O43741 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PRKAB2O43741 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PRKAB2O43741 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PRKAB2O43741 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PRKAB2O43741 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PRKAB2O43741 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
PRKAB2O43741 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PRKAB2O43741 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PRKAB2O43741 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PRKAB2O43741 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRKAB2O43741 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRKAB2O43741 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
PRKAB2O43741 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PRKAB2O43741 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PRKAB2O43741 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRKAB2O43741 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
PRKAB2O43741 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PRKAB2O43741 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PRKAB2O43741 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PRKAB2O43741 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRKAB2O43741 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
PRKAB2O43741 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRKAB2O43741 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PRKAB2O43741 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PRKAB2O43741 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PRKAB2O43741 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PRKAB2O43741 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PRKAB2O43741 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRKAB2O43741 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRKAB2O43741 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PRKAB2O43741 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PRKAB2O43741 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRKAB2O43741 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRKAB2O43741 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRKAB2O43741 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRKAB2O43741 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PRKAB2O43741 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRKAB2O43741 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PRKAB2O43741 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PRKAB2O43741 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRKAB2O43741 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PRKAB2O43741 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
PRKAB2O43741 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PRKAB2O43741 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PRKAB2O43741 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PRKAB2O43741 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PRKAB2O43741 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
PRKAB2O43741 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PRKAB2O43741 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PRKAB2O43741 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRKAB2O43741 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRKAB2O43741 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRKAB2O43741 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRKAB2O43741 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRKAB2O43741 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PRKAB2O43741 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRKAB2O43741 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PRKAB2O43741 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRKAB2O43741 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRKAB2O43741 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
PRKAB2O43741 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms