Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
J3QR89 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
J3QR89 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
J3QR89 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
J3QR89 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
J3QR89 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
J3QR89 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
J3QR89 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
J3QR89 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
J3QR89 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
J3QR89 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms