RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.41■■■■■ 6.14
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.33■■■■■ 5.17
HOXD4-201ENST00000306324 ABCC9O60706 1549 aa45.9■■■■■ 4.94
HOXD4-201ENST00000306324 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.58■■■■■ 4.73
HOXD4-201ENST00000306324 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.54■■■■■ 4.72
HOXD4-201ENST00000306324 NACADO15069 1562 aa44.35■■■■■ 4.69
HOXD4-201ENST00000306324 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.32■■■■■ 4.69
HOXD4-201ENST00000306324 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.16■■■■■ 4.66
HOXD4-201ENST00000306324 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.16■■■■■ 4.66
HOXD4-201ENST00000306324 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.45■■■■■ 4.55
HOXD4-201ENST00000306324 SCRIBQ14160 1630 aa43.27■■■■■ 4.52
HOXD4-201ENST00000306324 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.96■■■■■ 4.47
HOXD4-201ENST00000306324 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.95■■■■■ 4.47
HOXD4-201ENST00000306324 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.55■■■■■ 4.4
HOXD4-201ENST00000306324 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
HOXD4-201ENST00000306324 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.66■■■■■ 4.26
HOXD4-201ENST00000306324 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.57■■■■■ 4.25
HOXD4-201ENST00000306324 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.55■■■■■ 4.24
HOXD4-201ENST00000306324 SMARCA4P51532 1647 aa41.39■■■■■ 4.22
HOXD4-201ENST00000306324 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.22
HOXD4-201ENST00000306324 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.19■■■■■ 4.19
HOXD4-201ENST00000306324 SMARCA2P51531 1590 aa41■■■■■ 4.15
HOXD4-201ENST00000306324 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41■■■■■ 4.15
HOXD4-201ENST00000306324 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.91■■■■■ 4.14
HOXD4-201ENST00000306324 NCAPD3P42695 1498 aa40.88■■■■■ 4.13
HOXD4-201ENST00000306324 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
HOXD4-201ENST00000306324 WIZO95785 1651 aa40.83■■■■■ 4.13
HOXD4-201ENST00000306324 HMGXB3Q12766 1538 aa40.75■■■■■ 4.11
HOXD4-201ENST00000306324 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
HOXD4-201ENST00000306324 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
HOXD4-201ENST00000306324 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.88■■■■□ 3.97
HOXD4-201ENST00000306324 NESP48681 1621 aa39.85■■■■□ 3.97
HOXD4-201ENST00000306324 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.79■■■■□ 3.96
HOXD4-201ENST00000306324 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.73■■■■□ 3.95
HOXD4-201ENST00000306324 CFTRP13569 1480 aa39.59■■■■□ 3.93
HOXD4-201ENST00000306324 ERCC6Q03468 1493 aa39.53■■■■□ 3.92
HOXD4-201ENST00000306324 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.48■■■■□ 3.91
HOXD4-201ENST00000306324 PRDM2Q13029 1718 aa39.48■■■■□ 3.91
HOXD4-201ENST00000306324 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.46■■■■□ 3.91
HOXD4-201ENST00000306324 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.31■■■■□ 3.88
HOXD4-201ENST00000306324 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.24■■■■□ 3.87
HOXD4-201ENST00000306324 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
HOXD4-201ENST00000306324 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.06■■■■□ 3.84
HOXD4-201ENST00000306324 WDR62O43379 1518 aa38.92■■■■□ 3.82
HOXD4-201ENST00000306324 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
HOXD4-201ENST00000306324 CUX2O14529 1486 aa38.88■■■■□ 3.81
HOXD4-201ENST00000306324 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.74■■■■□ 3.79
HOXD4-201ENST00000306324 TOPBP1Q92547 1522 aa38.74■■■■□ 3.79
HOXD4-201ENST00000306324 ABCC8Q09428 1581 aa38.73■■■■□ 3.79
HOXD4-201ENST00000306324 CUX1P39880 1505 aa38.62■■■■□ 3.77
HOXD4-201ENST00000306324 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.53■■■■□ 3.76
HOXD4-201ENST00000306324 SYNJ1O43426 1573 aa38.45■■■■□ 3.75
HOXD4-201ENST00000306324 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.44■■■■□ 3.74
HOXD4-201ENST00000306324 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.43■■■■□ 3.74
HOXD4-201ENST00000306324 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.43■■■■□ 3.74
HOXD4-201ENST00000306324 TOP2BQ02880 1626 aa38.41■■■■□ 3.74
HOXD4-201ENST00000306324 IFT140Q96RY7 1462 aa38.36■■■■□ 3.73
HOXD4-201ENST00000306324 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.29■■■■□ 3.72
HOXD4-201ENST00000306324 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.29■■■■□ 3.72
HOXD4-201ENST00000306324 SOGA1O94964 1423 aa38.28■■■■□ 3.72
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.18■■■■□ 3.7
HOXD4-201ENST00000306324 WDR97A6NE52 1622 aa38.12■■■■□ 3.69
HOXD4-201ENST00000306324 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.09■■■■□ 3.69
HOXD4-201ENST00000306324 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.04■■■■□ 3.68
HOXD4-201ENST00000306324 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.03■■■■□ 3.68
HOXD4-201ENST00000306324 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.03■■■■□ 3.68
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM41Q8WV44 630 aa37.96■■■■□ 3.67
HOXD4-201ENST00000306324 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.89■■■■□ 3.66
HOXD4-201ENST00000306324 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.86■■■■□ 3.65
HOXD4-201ENST00000306324 PBRM1Q86U86 1689 aa37.84■■■■□ 3.65
HOXD4-201ENST00000306324 GRIN2BQ13224 1484 aa37.78■■■■□ 3.64
HOXD4-201ENST00000306324 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.76■■■■□ 3.63
HOXD4-201ENST00000306324 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.69■■■■□ 3.62
HOXD4-201ENST00000306324 KIF27Q86VH2 1401 aa37.68■■■■□ 3.62
HOXD4-201ENST00000306324 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
HOXD4-201ENST00000306324 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.6■■■■□ 3.61
HOXD4-201ENST00000306324 CHD1O14646 1710 aa37.58■■■■□ 3.61
HOXD4-201ENST00000306324 FBLN2P98095 1184 aa37.53■■■■□ 3.6
HOXD4-201ENST00000306324 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.52■■■■□ 3.6
HOXD4-201ENST00000306324 ADAMTS12P58397 1594 aa37.5■■■■□ 3.59
HOXD4-201ENST00000306324 SYNJ2O15056 1496 aa37.48■■■■□ 3.59
HOXD4-201ENST00000306324 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
HOXD4-201ENST00000306324 IGF1RP08069 1367 aa37.45■■■■□ 3.59
HOXD4-201ENST00000306324 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.41■■■■□ 3.58
HOXD4-201ENST00000306324 CUL7Q14999 1698 aa37.4■■■■□ 3.58
HOXD4-201ENST00000306324 OSCARQ8IYS5 282 aa37.38■■■■□ 3.57
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HOXD4-201ENST00000306324 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.26■■■■□ 3.56
HOXD4-201ENST00000306324 EEA1Q15075 1411 aa37.23■■■■□ 3.55
HOXD4-201ENST00000306324 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
HOXD4-201ENST00000306324 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.15■■■■□ 3.54
HOXD4-201ENST00000306324 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.14■■■■□ 3.54
HOXD4-201ENST00000306324 CEP170Q5SW79 1584 aa37.12■■■■□ 3.53
HOXD4-201ENST00000306324 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.1■■■■□ 3.53
HOXD4-201ENST00000306324 NUP160Q12769 1436 aa37.08■■■■□ 3.53
HOXD4-201ENST00000306324 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.07■■■■□ 3.52
HOXD4-201ENST00000306324 PRXQ9BXM0 1461 aa37.05■■■■□ 3.52
HOXD4-201ENST00000306324 KIF21BO75037 1637 aa36.87■■■■□ 3.49
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.85■■■■□ 3.49
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