RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425225.1

SOHLH1-202, Transcript of spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SOHLH1, Length 1,411 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1-202ENST00000425225 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.75■■■■■ 6.99
SOHLH1-202ENST00000425225 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.57■■■■■ 6.01
SOHLH1-202ENST00000425225 ABCC9O60706 1549 aa52.4■■■■■ 5.98
SOHLH1-202ENST00000425225 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.94■■■■■ 5.59
SOHLH1-202ENST00000425225 NACADO15069 1562 aa49.67■■■■■ 5.54
SOHLH1-202ENST00000425225 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.5■■■■■ 5.51
SOHLH1-202ENST00000425225 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.09■■■■■ 5.45
SOHLH1-202ENST00000425225 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.07■■■■■ 5.45
SOHLH1-202ENST00000425225 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.87■■■■■ 5.41
SOHLH1-202ENST00000425225 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.87■■■■■ 5.41
SOHLH1-202ENST00000425225 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.71■■■■■ 5.39
SOHLH1-202ENST00000425225 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.55■■■■■ 5.36
SOHLH1-202ENST00000425225 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.53■■■■■ 5.36
SOHLH1-202ENST00000425225 SCRIBQ14160 1630 aa47.92■■■■■ 5.26
SOHLH1-202ENST00000425225 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.83■■■■■ 5.25
SOHLH1-202ENST00000425225 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.35■■■■■ 5.17
SOHLH1-202ENST00000425225 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.3■■■■■ 5.16
SOHLH1-202ENST00000425225 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.18■■■■■ 5.14
SOHLH1-202ENST00000425225 NCAPD3P42695 1498 aa45.89■■■■■ 4.94
SOHLH1-202ENST00000425225 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.78■■■■■ 4.92
SOHLH1-202ENST00000425225 SMARCA4P51532 1647 aa45.76■■■■■ 4.92
SOHLH1-202ENST00000425225 SMARCA2P51531 1590 aa45.62■■■■■ 4.89
SOHLH1-202ENST00000425225 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.54■■■■■ 4.88
SOHLH1-202ENST00000425225 HMGXB3Q12766 1538 aa45.52■■■■■ 4.88
SOHLH1-202ENST00000425225 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.33■■■■■ 4.85
SOHLH1-202ENST00000425225 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.3■■■■■ 4.84
SOHLH1-202ENST00000425225 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.28■■■■■ 4.84
SOHLH1-202ENST00000425225 ERCC6Q03468 1493 aa45.18■■■■■ 4.82
SOHLH1-202ENST00000425225 NESP48681 1621 aa45.11■■■■■ 4.81
SOHLH1-202ENST00000425225 CUX2O14529 1486 aa45.05■■■■■ 4.8
SOHLH1-202ENST00000425225 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.87■■■■■ 4.77
SOHLH1-202ENST00000425225 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.78■■■■■ 4.76
SOHLH1-202ENST00000425225 WIZO95785 1651 aa44.74■■■■■ 4.75
SOHLH1-202ENST00000425225 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
SOHLH1-202ENST00000425225 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.52■■■■■ 4.72
SOHLH1-202ENST00000425225 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.5■■■■■ 4.71
SOHLH1-202ENST00000425225 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.49■■■■■ 4.71
SOHLH1-202ENST00000425225 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.44■■■■■ 4.7
SOHLH1-202ENST00000425225 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
SOHLH1-202ENST00000425225 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.12■■■■■ 4.65
SOHLH1-202ENST00000425225 CFTRP13569 1480 aa44.04■■■■■ 4.64
SOHLH1-202ENST00000425225 WDR62O43379 1518 aa44.01■■■■■ 4.64
SOHLH1-202ENST00000425225 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.98■■■■■ 4.63
SOHLH1-202ENST00000425225 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.98■■■■■ 4.63
SOHLH1-202ENST00000425225 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.71■■■■■ 4.59
SOHLH1-202ENST00000425225 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.62■■■■■ 4.57
SOHLH1-202ENST00000425225 PRDM2Q13029 1718 aa43.56■■■■■ 4.56
SOHLH1-202ENST00000425225 TOPBP1Q92547 1522 aa43.18■■■■■ 4.5
SOHLH1-202ENST00000425225 IFT140Q96RY7 1462 aa43.1■■■■■ 4.49
SOHLH1-202ENST00000425225 OSCARQ8IYS5 282 aa43.09■■■■■ 4.49
SOHLH1-202ENST00000425225 ABCC8Q09428 1581 aa43.07■■■■■ 4.49
SOHLH1-202ENST00000425225 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
SOHLH1-202ENST00000425225 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.01■■■■■ 4.48
SOHLH1-202ENST00000425225 TRIM41Q8WV44 630 aa42.94■■■■■ 4.46
SOHLH1-202ENST00000425225 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.79■■■■■ 4.44
SOHLH1-202ENST00000425225 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
SOHLH1-202ENST00000425225 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.75■■■■■ 4.43
SOHLH1-202ENST00000425225 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.7■■■■■ 4.43
SOHLH1-202ENST00000425225 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
SOHLH1-202ENST00000425225 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.61■■■■■ 4.41
SOHLH1-202ENST00000425225 SOGA1O94964 1423 aa42.57■■■■■ 4.41
SOHLH1-202ENST00000425225 CUX1P39880 1505 aa42.52■■■■■ 4.4
SOHLH1-202ENST00000425225 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.5■■■■■ 4.39
SOHLH1-202ENST00000425225 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
SOHLH1-202ENST00000425225 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.47■■■■■ 4.39
SOHLH1-202ENST00000425225 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.47■■■■■ 4.39
SOHLH1-202ENST00000425225 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.47■■■■■ 4.39
SOHLH1-202ENST00000425225 CHD1O14646 1710 aa42.43■■■■■ 4.38
SOHLH1-202ENST00000425225 FBLN2P98095 1184 aa42.35■■■■■ 4.37
SOHLH1-202ENST00000425225 ARHGEF11O15085 1522 aa42.35■■■■■ 4.37
SOHLH1-202ENST00000425225 WDR97A6NE52 1622 aa42.3■■■■■ 4.36
SOHLH1-202ENST00000425225 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.23■■■■■ 4.35
SOHLH1-202ENST00000425225 GRIN2BQ13224 1484 aa42.15■■■■■ 4.34
SOHLH1-202ENST00000425225 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.12■■■■■ 4.33
SOHLH1-202ENST00000425225 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.08■■■■■ 4.33
SOHLH1-202ENST00000425225 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.08■■■■■ 4.33
SOHLH1-202ENST00000425225 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.04■■■■■ 4.32
SOHLH1-202ENST00000425225 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.04■■■■■ 4.32
SOHLH1-202ENST00000425225 SYNJ2O15056 1496 aa41.98■■■■■ 4.31
SOHLH1-202ENST00000425225 PBRM1Q86U86 1689 aa41.97■■■■■ 4.31
SOHLH1-202ENST00000425225 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.97■■■■■ 4.31
SOHLH1-202ENST00000425225 ARAP1Q96P48 1450 aa41.97■■■■■ 4.31
SOHLH1-202ENST00000425225 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.94■■■■■ 4.3
SOHLH1-202ENST00000425225 SYNJ1O43426 1573 aa41.92■■■■■ 4.3
SOHLH1-202ENST00000425225 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.9■■■■■ 4.3
SOHLH1-202ENST00000425225 TOP2BQ02880 1626 aa41.88■■■■■ 4.29
SOHLH1-202ENST00000425225 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.87■■■■■ 4.29
SOHLH1-202ENST00000425225 GRIN2AQ12879 1464 aa41.61■■■■■ 4.25
SOHLH1-202ENST00000425225 ADAMTS12P58397 1594 aa41.6■■■■■ 4.25
SOHLH1-202ENST00000425225 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.52■■■■■ 4.24
SOHLH1-202ENST00000425225 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.49■■■■■ 4.23
SOHLH1-202ENST00000425225 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
SOHLH1-202ENST00000425225 NUP160Q12769 1436 aa41.48■■■■■ 4.23
SOHLH1-202ENST00000425225 CEP170Q5SW79 1584 aa41.46■■■■■ 4.23
SOHLH1-202ENST00000425225 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.36■■■■■ 4.21
SOHLH1-202ENST00000425225 SHROOM2Q13796 1616 aa41.27■■■■■ 4.2
SOHLH1-202ENST00000425225 JPH4Q96JJ6 628 aa41.1■■■■■ 4.17
SOHLH1-202ENST00000425225 IGF1RP08069 1367 aa41.09■■■■■ 4.17
SOHLH1-202ENST00000425225 KIF27Q86VH2 1401 aa41.06■■■■■ 4.16
SOHLH1-202ENST00000425225 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms