RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.99■■■■■ 7.35
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABCC9O60706 1549 aa53.22■■■■■ 6.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.06■■■■■ 5.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.01■■■■■ 5.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NACADO15069 1562 aa50.99■■■■■ 5.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.78■■■■■ 5.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.67■■■■■ 5.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.42■■■■■ 5.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.91■■■■■ 5.58
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.77■■■■■ 5.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.62■■■■■ 5.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCRIBQ14160 1630 aa49.49■■■■■ 5.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.06■■■■■ 5.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.97■■■■■ 5.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.27■■■■■ 5.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.1■■■■■ 5.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.81■■■■■ 5.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMARCA4P51532 1647 aa47.32■■■■■ 5.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.23■■■■■ 5.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.14■■■■■ 5.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NCAPD3P42695 1498 aa47.11■■■■■ 5.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.04■■■■■ 5.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMARCA2P51531 1590 aa46.99■■■■■ 5.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.86■■■■■ 5.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HMGXB3Q12766 1538 aa46.82■■■■■ 5.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.7■■■■■ 5.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WIZO95785 1651 aa46.49■■■■■ 5.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.47■■■■■ 5.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NESP48681 1621 aa46.05■■■■■ 4.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.97■■■■■ 4.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.82■■■■■ 4.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERCC6Q03468 1493 aa45.81■■■■■ 4.92
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.74■■■■■ 4.91
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.53■■■■■ 4.88
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.49■■■■■ 4.87
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CFTRP13569 1480 aa45.44■■■■■ 4.87
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.41■■■■■ 4.86
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CUX2O14529 1486 aa45.37■■■■■ 4.85
HOXD-AS2-201ENST00000426965 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.32■■■■■ 4.85
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.2■■■■■ 4.83
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.12■■■■■ 4.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.1■■■■■ 4.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WDR62O43379 1518 aa44.96■■■■■ 4.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRDM2Q13029 1718 aa44.95■■■■■ 4.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TOPBP1Q92547 1522 aa44.46■■■■■ 4.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABCC8Q09428 1581 aa44.38■■■■■ 4.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.38■■■■■ 4.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IFT140Q96RY7 1462 aa44.19■■■■■ 4.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.17■■■■■ 4.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CUX1P39880 1505 aa44.12■■■■■ 4.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.09■■■■■ 4.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.07■■■■■ 4.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.99■■■■■ 4.63
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.96■■■■■ 4.63
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.94■■■■■ 4.62
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SOGA1O94964 1423 aa43.9■■■■■ 4.62
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.81■■■■■ 4.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.81■■■■■ 4.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.77■■■■■ 4.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SYNJ1O43426 1573 aa43.69■■■■■ 4.58
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TOP2BQ02880 1626 aa43.66■■■■■ 4.58
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.64■■■■■ 4.58
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WDR97A6NE52 1622 aa43.56■■■■■ 4.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.53■■■■■ 4.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OSCARQ8IYS5 282 aa43.51■■■■■ 4.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.38■■■■■ 4.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GRIN2BQ13224 1484 aa43.38■■■■■ 4.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.36■■■■■ 4.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.35■■■■■ 4.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.26■■■■■ 4.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FBLN2P98095 1184 aa43.25■■■■■ 4.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHD1O14646 1710 aa43.25■■■■■ 4.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PBRM1Q86U86 1689 aa43.23■■■■■ 4.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SYNJ2O15056 1496 aa43.12■■■■■ 4.49
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADAMTS12P58397 1594 aa42.94■■■■■ 4.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.88■■■■■ 4.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.84■■■■■ 4.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIF27Q86VH2 1401 aa42.84■■■■■ 4.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GRIN2AQ12879 1464 aa42.83■■■■■ 4.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.8■■■■■ 4.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.8■■■■■ 4.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.8■■■■■ 4.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARHGEF11O15085 1522 aa42.8■■■■■ 4.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGF1RP08069 1367 aa42.77■■■■■ 4.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NUP160Q12769 1436 aa42.67■■■■■ 4.42
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRIM41Q8WV44 630 aa42.67■■■■■ 4.42
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CEP170Q5SW79 1584 aa42.65■■■■■ 4.42
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.53■■■■■ 4.4
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CUL7Q14999 1698 aa42.52■■■■■ 4.4
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARAP1Q96P48 1450 aa42.48■■■■■ 4.39
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.46■■■■■ 4.39
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.45■■■■■ 4.39
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SHROOM2Q13796 1616 aa42.32■■■■■ 4.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.3■■■■■ 4.36
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