RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.12■■□□□ 1.77
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PTPRN-201ENST00000295718 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.02■■□□□ 1.44
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PTPRN-201ENST00000295718 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.25■■□□□ 1.31
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PTPRN-201ENST00000295718 TRIM41Q8WV44 630 aa22.66■■□□□ 1.22
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PTPRN-201ENST00000295718 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRN-201ENST00000295718 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRN-201ENST00000295718 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
PTPRN-201ENST00000295718 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRN-201ENST00000295718 NACADO15069 1562 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRN-201ENST00000295718 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.93■□□□□ 0.78
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