RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445150.3

SRP19-202, Transcript of signal recognition particle 19, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP19, Length 833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP19-202ENST00000445150 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.09■■■■■ 4.33
SRP19-202ENST00000445150 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.32■■■■□ 3.57
SRP19-202ENST00000445150 ABCC9O60706 1549 aa36.32■■■■□ 3.4
SRP19-202ENST00000445150 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.2■■■■□ 3.23
SRP19-202ENST00000445150 NACADO15069 1562 aa35.12■■■■□ 3.21
SRP19-202ENST00000445150 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.1■■■■□ 3.21
SRP19-202ENST00000445150 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
SRP19-202ENST00000445150 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.99■■■■□ 3.19
SRP19-202ENST00000445150 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.89■■■■□ 3.18
SRP19-202ENST00000445150 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.08■■■■□ 3.05
SRP19-202ENST00000445150 SCRIBQ14160 1630 aa34.01■■■■□ 3.04
SRP19-202ENST00000445150 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34■■■■□ 3.03
SRP19-202ENST00000445150 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.89■■■■□ 3.02
SRP19-202ENST00000445150 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.75■■■□□ 2.99
SRP19-202ENST00000445150 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.12■■■□□ 2.89
SRP19-202ENST00000445150 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
SRP19-202ENST00000445150 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.84■■■□□ 2.85
SRP19-202ENST00000445150 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.69■■■□□ 2.82
SRP19-202ENST00000445150 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
SRP19-202ENST00000445150 SMARCA4P51532 1647 aa32.58■■■□□ 2.81
SRP19-202ENST00000445150 SMARCA2P51531 1590 aa32.42■■■□□ 2.78
SRP19-202ENST00000445150 NCAPD3P42695 1498 aa32.4■■■□□ 2.78
SRP19-202ENST00000445150 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.4■■■□□ 2.78
SRP19-202ENST00000445150 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.37■■■□□ 2.77
SRP19-202ENST00000445150 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.28■■■□□ 2.76
SRP19-202ENST00000445150 HMGXB3Q12766 1538 aa32.22■■■□□ 2.75
SRP19-202ENST00000445150 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
SRP19-202ENST00000445150 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
SRP19-202ENST00000445150 WIZO95785 1651 aa32.01■■■□□ 2.71
SRP19-202ENST00000445150 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.68
SRP19-202ENST00000445150 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
SRP19-202ENST00000445150 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.51■■■□□ 2.63
SRP19-202ENST00000445150 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.48■■■□□ 2.63
SRP19-202ENST00000445150 NESP48681 1621 aa31.43■■■□□ 2.62
SRP19-202ENST00000445150 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.4■■■□□ 2.62
SRP19-202ENST00000445150 ERCC6Q03468 1493 aa31.39■■■□□ 2.62
SRP19-202ENST00000445150 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.36■■■□□ 2.61
SRP19-202ENST00000445150 CFTRP13569 1480 aa31.29■■■□□ 2.6
SRP19-202ENST00000445150 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.08■■■□□ 2.57
SRP19-202ENST00000445150 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.04■■■□□ 2.56
SRP19-202ENST00000445150 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.03■■■□□ 2.56
SRP19-202ENST00000445150 CUX2O14529 1486 aa30.99■■■□□ 2.55
SRP19-202ENST00000445150 PRDM2Q13029 1718 aa30.97■■■□□ 2.55
SRP19-202ENST00000445150 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.95■■■□□ 2.54
SRP19-202ENST00000445150 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
SRP19-202ENST00000445150 WDR62O43379 1518 aa30.79■■■□□ 2.52
SRP19-202ENST00000445150 ABCC8Q09428 1581 aa30.73■■■□□ 2.51
SRP19-202ENST00000445150 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
SRP19-202ENST00000445150 TOPBP1Q92547 1522 aa30.57■■■□□ 2.49
SRP19-202ENST00000445150 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.57■■■□□ 2.48
SRP19-202ENST00000445150 IFT140Q96RY7 1462 aa30.41■■■□□ 2.46
SRP19-202ENST00000445150 CUX1P39880 1505 aa30.37■■■□□ 2.45
SRP19-202ENST00000445150 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.34■■■□□ 2.45
SRP19-202ENST00000445150 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
SRP19-202ENST00000445150 SOGA1O94964 1423 aa30.29■■■□□ 2.44
SRP19-202ENST00000445150 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.28■■■□□ 2.44
SRP19-202ENST00000445150 TOP2BQ02880 1626 aa30.19■■■□□ 2.42
SRP19-202ENST00000445150 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
SRP19-202ENST00000445150 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.17■■■□□ 2.42
SRP19-202ENST00000445150 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.16■■■□□ 2.42
SRP19-202ENST00000445150 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
SRP19-202ENST00000445150 SYNJ1O43426 1573 aa30.12■■■□□ 2.41
SRP19-202ENST00000445150 WDR97A6NE52 1622 aa30.08■■■□□ 2.41
SRP19-202ENST00000445150 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.04■■■□□ 2.43e-6■□□□□ 9.4
SRP19-202ENST00000445150 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
SRP19-202ENST00000445150 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.03■■■□□ 2.4
SRP19-202ENST00000445150 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
SRP19-202ENST00000445150 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.92■■■□□ 2.38
SRP19-202ENST00000445150 GRIN2BQ13224 1484 aa29.9■■■□□ 2.38
SRP19-202ENST00000445150 TRIM41Q8WV44 630 aa29.84■■■□□ 2.37
SRP19-202ENST00000445150 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.83■■■□□ 2.37
SRP19-202ENST00000445150 OSCARQ8IYS5 282 aa29.82■■■□□ 2.36
SRP19-202ENST00000445150 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.81■■■□□ 2.36
SRP19-202ENST00000445150 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
SRP19-202ENST00000445150 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.76■■■□□ 2.35
SRP19-202ENST00000445150 FBLN2P98095 1184 aa29.75■■■□□ 2.35
SRP19-202ENST00000445150 KIF27Q86VH2 1401 aa29.75■■■□□ 2.35
SRP19-202ENST00000445150 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
SRP19-202ENST00000445150 PBRM1Q86U86 1689 aa29.72■■■□□ 2.35
SRP19-202ENST00000445150 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.7■■■□□ 2.34
SRP19-202ENST00000445150 SYNJ2O15056 1496 aa29.67■■■□□ 2.34
SRP19-202ENST00000445150 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.61■■■□□ 2.33
SRP19-202ENST00000445150 CHD1O14646 1710 aa29.57■■■□□ 2.32
SRP19-202ENST00000445150 IGF1RP08069 1367 aa29.54■■■□□ 2.32
SRP19-202ENST00000445150 ADAMTS12P58397 1594 aa29.52■■■□□ 2.32
SRP19-202ENST00000445150 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.52■■■□□ 2.32
SRP19-202ENST00000445150 GRIN2AQ12879 1464 aa29.47■■■□□ 2.31
SRP19-202ENST00000445150 CUL7Q14999 1698 aa29.44■■■□□ 2.3
SRP19-202ENST00000445150 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.42■■■□□ 2.3
SRP19-202ENST00000445150 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.35■■■□□ 2.29
SRP19-202ENST00000445150 EEA1Q15075 1411 aa29.35■■■□□ 2.29
SRP19-202ENST00000445150 NUP160Q12769 1436 aa29.33■■■□□ 2.29
SRP19-202ENST00000445150 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.3■■■□□ 2.28
SRP19-202ENST00000445150 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.27■■■□□ 2.28
SRP19-202ENST00000445150 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.25■■■□□ 2.27
SRP19-202ENST00000445150 CEP170Q5SW79 1584 aa29.24■■■□□ 2.27
SRP19-202ENST00000445150 ARHGEF11O15085 1522 aa29.18■■■□□ 2.26
SRP19-202ENST00000445150 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.15■■■□□ 2.26
SRP19-202ENST00000445150 PRXQ9BXM0 1461 aa29.14■■■□□ 2.26
SRP19-202ENST00000445150 JPH4Q96JJ6 628 aa29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.2 ms