Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUL3

STAU2, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAU2Q9NUL3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.277e-7■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 SYMPK-204ENST00000593959 546 ntTSL 416.56■□□□□ 0.241e-7■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 SYMPK-202ENST00000593504 5107 ntTSL 215.96■□□□□ 0.151e-7■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.071e-7■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.077e-7■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.241e-7■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 SYMPK-218ENST00000602061 503 ntTSL 412.61□□□□□ -0.391e-7■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.147e-7■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.317e-7■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 MLLT10-208ENST00000438473 1085 ntTSL 55.05□□□□□ -1.67e-7■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 MLLT10-206ENST00000420525 538 ntTSL 32.46□□□□□ -2.027e-7■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.65e-9■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 FCGRT-208ENST00000595881 2681 ntTSL 220.42■□□□□ 0.865e-9■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 FCGRT-205ENST00000593431 582 ntTSL 319.74■□□□□ 0.755e-9■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 FCGRT-214ENST00000598927 1616 ntTSL 518.82■□□□□ 0.65e-9■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.65e-9■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.65e-9■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.565e-9■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 FCGRT-203ENST00000452439 1351 ntTSL 218.09■□□□□ 0.495e-9■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 FCGRT-209ENST00000596147 383 ntTSL 317.99■□□□□ 0.475e-9■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 FCGRT-212ENST00000598319 1888 ntTSL 516.79■□□□□ 0.285e-9■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 FCGRT-215ENST00000598936 870 ntTSL 315.84■□□□□ 0.135e-9■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 FCGRT-206ENST00000594823 819 ntTSL 515.24■□□□□ 0.035e-9■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 FCGRT-204ENST00000593381 566 ntTSL 413.73□□□□□ -0.215e-9■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 FCGRT-211ENST00000598076 676 ntTSL 313.68□□□□□ -0.225e-9■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 GM2A-201ENST00000357164 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.034e-7■□□□□ 9.6
STAU2Q9NUL3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 25e-7■□□□□ 9.5
STAU2Q9NUL3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.315e-7■□□□□ 9.5
STAU2Q9NUL3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.065e-7■□□□□ 9.5
STAU2Q9NUL3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.321e-9■□□□□ 9.4
STAU2Q9NUL3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.493e-6■□□□□ 9.4
STAU2Q9NUL3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.683e-6■□□□□ 9.4
STAU2Q9NUL3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.023e-6■□□□□ 9.4
STAU2Q9NUL3 FCGRT-207ENST00000595677 714 ntTSL 514.73□□□□□ -0.057e-9■□□□□ 9.3
STAU2Q9NUL3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.579e-7■□□□□ 9.3
STAU2Q9NUL3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.279e-7■□□□□ 9.3
STAU2Q9NUL3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.029e-7■□□□□ 9.3
STAU2Q9NUL3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.779e-7■□□□□ 9.3
STAU2Q9NUL3 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.039e-7■□□□□ 9.3
STAU2Q9NUL3 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.049e-7■□□□□ 9.3
STAU2Q9NUL3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.069e-7■□□□□ 9.3
STAU2Q9NUL3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.089e-7■□□□□ 9.3
STAU2Q9NUL3 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.099e-7■□□□□ 9.3
STAU2Q9NUL3 SH3PXD2A-201ENST00000315994 5504 ntTSL 1 (best)13.43□□□□□ -0.269e-7■□□□□ 9.3
STAU2Q9NUL3 PCMTD2-203ENST00000308824 3843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.619e-7■□□□□ 9.3
STAU2Q9NUL3 PCMTD2-209ENST00000609818 551 ntTSL 46.93□□□□□ -1.39e-7■□□□□ 9.3
STAU2Q9NUL3 CCNI-205ENST00000507788 595 ntTSL 417.2■□□□□ 0.342e-7■□□□□ 9.3
STAU2Q9NUL3 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.152e-7■□□□□ 9.3
STAU2Q9NUL3 CCNI-202ENST00000504697 610 ntTSL 411.04□□□□□ -0.642e-7■□□□□ 9.3
STAU2Q9NUL3 CCNI-207ENST00000513774 517 ntTSL 48.11□□□□□ -1.112e-7■□□□□ 9.3
STAU2Q9NUL3 CCNI-203ENST00000505609 541 ntTSL 46.61□□□□□ -1.352e-7■□□□□ 9.3
STAU2Q9NUL3 CCNI-206ENST00000511943 576 ntTSL 33.28□□□□□ -1.882e-7■□□□□ 9.3
STAU2Q9NUL3 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.052e-9■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.182e-9■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.543e-6■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.143e-6■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.113e-7■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.083e-7■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 SH3BP2-210ENST00000505941 917 ntTSL 221.46■■□□□ 1.033e-7■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.713e-7■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 SH3BP2-220ENST00000511663 966 ntTSL 519.28■□□□□ 0.683e-7■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 SH3BP2-218ENST00000511185 1071 ntTSL 219.04■□□□□ 0.643e-7■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 SH3BP2-228ENST00000515737 2579 ntTSL 217.68■□□□□ 0.423e-7■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 TNRC18-206ENST00000434361 577 ntTSL 316.45■□□□□ 0.221e-6■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.183e-7■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.033e-7■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 SEC16A-208ENST00000467838 1988 ntTSL 215.06■□□□□ 03e-7■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 SH3BP2-208ENST00000504294 557 ntTSL 514.91□□□□□ -0.023e-7■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 SH3BP2-213ENST00000508385 876 ntTSL 314.88□□□□□ -0.033e-7■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 SH3BP2-227ENST00000515183 566 ntTSL 414.54□□□□□ -0.083e-7■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.333e-7■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 SH3BP2-222ENST00000512014 688 ntTSL 312.87□□□□□ -0.353e-7■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 SEC16A-207ENST00000453963 4834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.49□□□□□ -0.413e-7■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 SEC16A-205ENST00000371706 8093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.643e-7■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 SH3BP2-201ENST00000356331 9211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.683e-7■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 SEC16A-203ENST00000313050 8806 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.73e-7■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 SEC16A-204ENST00000313084 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.733e-7■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 SEC16A-201ENST00000277537 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)9.47□□□□□ -0.893e-7■□□□□ 9.2
STAU2Q9NUL3 PAICS-207ENST00000512576 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.92e-8■□□□□ 9.1
STAU2Q9NUL3 PAICS-202ENST00000399688 3297 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.052e-8■□□□□ 9.1
STAU2Q9NUL3 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.282e-8■□□□□ 9.1
STAU2Q9NUL3 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.382e-8■□□□□ 9.1
STAU2Q9NUL3 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.057e-7■□□□□ 9.1
STAU2Q9NUL3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.027e-7■□□□□ 9.1
STAU2Q9NUL3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.053e-10■□□□□ 9.1
STAU2Q9NUL3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.53e-10■□□□□ 9.1
STAU2Q9NUL3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.13e-10■□□□□ 9.1
STAU2Q9NUL3 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.163e-10■□□□□ 9.1
STAU2Q9NUL3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.832e-6■□□□□ 9.1
STAU2Q9NUL3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.732e-6■□□□□ 9.1
STAU2Q9NUL3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.652e-6■□□□□ 9.1
STAU2Q9NUL3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.62e-6■□□□□ 9.1
STAU2Q9NUL3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.442e-6■□□□□ 9.1
STAU2Q9NUL3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.22e-6■□□□□ 9.1
STAU2Q9NUL3 EIF5-205ENST00000558506 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.272e-6■□□□□ 9.1
STAU2Q9NUL3 HIPK2-203ENST00000428878 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.552e-6■□□□□ 9.1
STAU2Q9NUL3 HIPK2-201ENST00000342645 2937 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.912e-6■□□□□ 9.1
STAU2Q9NUL3 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.372e-6■□□□□ 9.1
STAU2Q9NUL3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.661e-8■□□□□ 9
STAU2Q9NUL3 SHANK3-202ENST00000414786 7394 ntTSL 519.15■□□□□ 0.661e-8■□□□□ 9
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