RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432651.5

PTPA-216, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 2 BASIC

Gene PTPA, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-216	ENST00000432651	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		46.3	■■■■■ 5
PTPA-216	ENST00000432651	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		41.06	■■■■■ 4.16
PTPA-216	ENST00000432651	ABCC9	O60706	1549 aa		39.7	■■■■□ 3.95
PTPA-216	ENST00000432651	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	38.67	■■■■□ 3.78
PTPA-216	ENST00000432651	NACAD	O15069	1562 aa		38.49	■■■■□ 3.75
PTPA-216	ENST00000432651	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		38.45	■■■■□ 3.75
PTPA-216	ENST00000432651	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		38.43	■■■■□ 3.74
PTPA-216	ENST00000432651	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		38.4	■■■■□ 3.74
PTPA-216	ENST00000432651	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		38.37	■■■■□ 3.73
PTPA-216	ENST00000432651	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		37.52	■■■■□ 3.6
PTPA-216	ENST00000432651	SCRIB	Q14160	1630 aa		37.39	■■■■□ 3.58
PTPA-216	ENST00000432651	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		37.23	■■■■□ 3.55
PTPA-216	ENST00000432651	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	37.1	■■■■□ 3.53
PTPA-216	ENST00000432651	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.99	■■■■□ 3.51
PTPA-216	ENST00000432651	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	36.23	■■■■□ 3.39
PTPA-216	ENST00000432651	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		36.05	■■■■□ 3.36
PTPA-216	ENST00000432651	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.98	■■■■□ 3.35
PTPA-216	ENST00000432651	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		35.97	■■■■□ 3.35
PTPA-216	ENST00000432651	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	35.89	■■■■□ 3.34
PTPA-216	ENST00000432651	SMARCA4	P51532	1647 aa		35.85	■■■■□ 3.33
PTPA-216	ENST00000432651	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		35.66	■■■■□ 3.3
PTPA-216	ENST00000432651	SMARCA2	P51531	1590 aa		35.56	■■■■□ 3.28
PTPA-216	ENST00000432651	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		35.55	■■■■□ 3.28
PTPA-216	ENST00000432651	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		35.55	■■■■□ 3.28
PTPA-216	ENST00000432651	NCAPD3	P42695	1498 aa		35.5	■■■■□ 3.27
PTPA-216	ENST00000432651	HMGXB3	Q12766	1538 aa		35.39	■■■■□ 3.26
PTPA-216	ENST00000432651	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	35.39	■■■■□ 3.26
PTPA-216	ENST00000432651	WIZ	O95785	1651 aa		35.28	■■■■□ 3.24
PTPA-216	ENST00000432651	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	35.28	■■■■□ 3.24
PTPA-216	ENST00000432651	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	34.99	■■■■□ 3.19
PTPA-216	ENST00000432651	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	34.66	■■■■□ 3.14
PTPA-216	ENST00000432651	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		34.53	■■■■□ 3.12
PTPA-216	ENST00000432651	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		34.52	■■■■□ 3.12
PTPA-216	ENST00000432651	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		34.47	■■■■□ 3.11
PTPA-216	ENST00000432651	NES	P48681	1621 aa		34.45	■■■■□ 3.11
PTPA-216	ENST00000432651	CFTR	P13569	1480 aa		34.36	■■■■□ 3.09
PTPA-216	ENST00000432651	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		34.25	■■■■□ 3.07
PTPA-216	ENST00000432651	ERCC6	Q03468	1493 aa		34.2	■■■■□ 3.07
PTPA-216	ENST00000432651	PRDM2	Q13029	1718 aa		34.15	■■■■□ 3.06
PTPA-216	ENST00000432651	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		34.09	■■■■□ 3.05
PTPA-216	ENST00000432651	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		34.06	■■■■□ 3.04
PTPA-216	ENST00000432651	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		34	■■■■□ 3.03
PTPA-216	ENST00000432651	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.93	■■■■□ 3.02
PTPA-216	ENST00000432651	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.88	■■■■□ 3.01
PTPA-216	ENST00000432651	CUX2	O14529	1486 aa		33.78	■■■■□ 3
PTPA-216	ENST00000432651	WDR62	O43379	1518 aa		33.78	■■■■□ 3
PTPA-216	ENST00000432651	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33.69	■■■□□ 2.98
PTPA-216	ENST00000432651	ABCC8	Q09428	1581 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PTPA-216	ENST00000432651	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PTPA-216	ENST00000432651	TOPBP1	Q92547	1522 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PTPA-216	ENST00000432651	CUX1	P39880	1505 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PTPA-216	ENST00000432651	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	33.36	■■■□□ 2.93	1e-6	■■□□□ 12
PTPA-216	ENST00000432651	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
PTPA-216	ENST00000432651	IFT140	Q96RY7	1462 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PTPA-216	ENST00000432651	TOP2B	Q02880	1626 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PTPA-216	ENST00000432651	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PTPA-216	ENST00000432651	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		33.27	■■■□□ 2.92
PTPA-216	ENST00000432651	SYNJ1	O43426	1573 aa		33.26	■■■□□ 2.91
PTPA-216	ENST00000432651	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
PTPA-216	ENST00000432651	SOGA1	O94964	1423 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PTPA-216	ENST00000432651	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PTPA-216	ENST00000432651	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
PTPA-216	ENST00000432651	WDR97	A6NE52	1622 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PTPA-216	ENST00000432651	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PTPA-216	ENST00000432651	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
PTPA-216	ENST00000432651	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.89	■■■□□ 2.86	3e-7	■■■■■ 30.5
PTPA-216	ENST00000432651	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
PTPA-216	ENST00000432651	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PTPA-216	ENST00000432651	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PTPA-216	ENST00000432651	TRIM41	Q8WV44	630 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PTPA-216	ENST00000432651	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PTPA-216	ENST00000432651	PBRM1	Q86U86	1689 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PTPA-216	ENST00000432651	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
PTPA-216	ENST00000432651	KIF27	Q86VH2	1401 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PTPA-216	ENST00000432651	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PTPA-216	ENST00000432651	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PTPA-216	ENST00000432651	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PTPA-216	ENST00000432651	SYNJ2	O15056	1496 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PTPA-216	ENST00000432651	ADAMTS12	P58397	1594 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PTPA-216	ENST00000432651	CHD1	O14646	1710 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PTPA-216	ENST00000432651	IGF1R	P08069	1367 aa		32.45	■■■□□ 2.78
PTPA-216	ENST00000432651	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PTPA-216	ENST00000432651	CUL7	Q14999	1698 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PTPA-216	ENST00000432651	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
PTPA-216	ENST00000432651	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PTPA-216	ENST00000432651	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PTPA-216	ENST00000432651	FBLN2	P98095	1184 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PTPA-216	ENST00000432651	GRIN2A	Q12879	1464 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PTPA-216	ENST00000432651	EEA1	Q15075	1411 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PTPA-216	ENST00000432651	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PTPA-216	ENST00000432651	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PTPA-216	ENST00000432651	NUP160	Q12769	1436 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PTPA-216	ENST00000432651	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PTPA-216	ENST00000432651	CEP170	Q5SW79	1584 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PTPA-216	ENST00000432651	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PTPA-216	ENST00000432651	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PTPA-216	ENST00000432651	PRX	Q9BXM0	1461 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PTPA-216	ENST00000432651	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.71
PTPA-216	ENST00000432651	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PTPA-216	ENST00000432651	KIF21B	O75037	1637 aa		31.93	■■■□□ 2.7

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