RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599988.5

FCGRT-217, Transcript of Fc fragment of IgG receptor and transporter, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene FCGRT, Length 660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRT-217ENST00000599988 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.55■■■■■ 7.28
FCGRT-217ENST00000599988 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.06■■■■■ 6.24
FCGRT-217ENST00000599988 ABCC9O60706 1549 aa52.89■■■■■ 6.06
FCGRT-217ENST00000599988 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.89■■■■■ 5.74
FCGRT-217ENST00000599988 NACADO15069 1562 aa50.79■■■■■ 5.72
FCGRT-217ENST00000599988 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.48■■■■■ 5.67
FCGRT-217ENST00000599988 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.45■■■■■ 5.67
FCGRT-217ENST00000599988 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.33■■■■■ 5.65
FCGRT-217ENST00000599988 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.17■■■■■ 5.62
FCGRT-217ENST00000599988 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.81■■■■■ 5.56
FCGRT-217ENST00000599988 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.4■■■■■ 5.5
FCGRT-217ENST00000599988 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.26■■■■■ 5.48
FCGRT-217ENST00000599988 SCRIBQ14160 1630 aa49.17■■■■■ 5.46
FCGRT-217ENST00000599988 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.93■■■■■ 5.42
FCGRT-217ENST00000599988 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.67■■■■■ 5.38
FCGRT-217ENST00000599988 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.08■■■■■ 5.29
FCGRT-217ENST00000599988 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.92■■■■■ 5.26
FCGRT-217ENST00000599988 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.58■■■■■ 5.21
FCGRT-217ENST00000599988 SMARCA4P51532 1647 aa47.08■■■■■ 5.13
FCGRT-217ENST00000599988 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.96■■■■■ 5.11
FCGRT-217ENST00000599988 NCAPD3P42695 1498 aa46.82■■■■■ 5.09
FCGRT-217ENST00000599988 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.81■■■■■ 5.08
FCGRT-217ENST00000599988 SMARCA2P51531 1590 aa46.79■■■■■ 5.08
FCGRT-217ENST00000599988 HMGXB3Q12766 1538 aa46.67■■■■■ 5.06
FCGRT-217ENST00000599988 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.67■■■■■ 5.06
FCGRT-217ENST00000599988 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.64■■■■■ 5.06
FCGRT-217ENST00000599988 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.41■■■■■ 5.02
FCGRT-217ENST00000599988 WIZO95785 1651 aa46.14■■■■■ 4.98
FCGRT-217ENST00000599988 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.99■■■■■ 4.95
FCGRT-217ENST00000599988 NESP48681 1621 aa45.74■■■■■ 4.91
FCGRT-217ENST00000599988 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.68■■■■■ 4.9
FCGRT-217ENST00000599988 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.67■■■■■ 4.9
FCGRT-217ENST00000599988 ERCC6Q03468 1493 aa45.61■■■■■ 4.89
FCGRT-217ENST00000599988 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.4■■■■■ 4.86
FCGRT-217ENST00000599988 CUX2O14529 1486 aa45.31■■■■■ 4.84
FCGRT-217ENST00000599988 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.28■■■■■ 4.84
FCGRT-217ENST00000599988 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.28■■■■■ 4.84
FCGRT-217ENST00000599988 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.24■■■■■ 4.83
FCGRT-217ENST00000599988 CFTRP13569 1480 aa45.14■■■■■ 4.82
FCGRT-217ENST00000599988 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.06■■■■■ 4.8
FCGRT-217ENST00000599988 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.04■■■■■ 4.8
FCGRT-217ENST00000599988 PRDM2Q13029 1718 aa44.92■■■■■ 4.78
FCGRT-217ENST00000599988 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.91■■■■■ 4.78
FCGRT-217ENST00000599988 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.9■■■■■ 4.78
FCGRT-217ENST00000599988 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.89■■■■■ 4.78
FCGRT-217ENST00000599988 WDR62O43379 1518 aa44.8■■■■■ 4.76
FCGRT-217ENST00000599988 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.5■■■■■ 4.71
FCGRT-217ENST00000599988 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
FCGRT-217ENST00000599988 TOPBP1Q92547 1522 aa44.19■■■■■ 4.66
FCGRT-217ENST00000599988 ABCC8Q09428 1581 aa44.16■■■■■ 4.66
FCGRT-217ENST00000599988 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.16■■■■■ 4.66
FCGRT-217ENST00000599988 IFT140Q96RY7 1462 aa43.96■■■■■ 4.63
FCGRT-217ENST00000599988 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.8■■■■■ 4.6
FCGRT-217ENST00000599988 CUX1P39880 1505 aa43.78■■■■■ 4.6
FCGRT-217ENST00000599988 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.78■■■■■ 4.6
FCGRT-217ENST00000599988 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.75■■■■■ 4.59
FCGRT-217ENST00000599988 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.67■■■■■ 4.58
FCGRT-217ENST00000599988 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.64■■■■■ 4.58
FCGRT-217ENST00000599988 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.55■■■■■ 4.56
FCGRT-217ENST00000599988 SOGA1O94964 1423 aa43.52■■■■■ 4.56
FCGRT-217ENST00000599988 WDR97A6NE52 1622 aa43.48■■■■■ 4.55
FCGRT-217ENST00000599988 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.43■■■■■ 4.548e-7■■■■■ 27.7
FCGRT-217ENST00000599988 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.42■■■■■ 4.54
FCGRT-217ENST00000599988 TOP2BQ02880 1626 aa43.38■■■■■ 4.54
FCGRT-217ENST00000599988 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.37■■■■■ 4.53
FCGRT-217ENST00000599988 SYNJ1O43426 1573 aa43.34■■■■■ 4.53
FCGRT-217ENST00000599988 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
FCGRT-217ENST00000599988 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.25■■■■■ 4.51
FCGRT-217ENST00000599988 OSCARQ8IYS5 282 aa43.19■■■■■ 4.5
FCGRT-217ENST00000599988 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.16■■■■■ 4.5
FCGRT-217ENST00000599988 CHD1O14646 1710 aa43.16■■■■■ 4.5
FCGRT-217ENST00000599988 PBRM1Q86U86 1689 aa43.11■■■■■ 4.49
FCGRT-217ENST00000599988 GRIN2BQ13224 1484 aa43.11■■■■■ 4.49
FCGRT-217ENST00000599988 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.09■■■■■ 4.49
FCGRT-217ENST00000599988 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.07■■■■■ 4.49
FCGRT-217ENST00000599988 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
FCGRT-217ENST00000599988 SYNJ2O15056 1496 aa42.87■■■■■ 4.45
FCGRT-217ENST00000599988 TRIM41Q8WV44 630 aa42.86■■■■■ 4.45
FCGRT-217ENST00000599988 FBLN2P98095 1184 aa42.8■■■■■ 4.44
FCGRT-217ENST00000599988 ADAMTS12P58397 1594 aa42.76■■■■■ 4.44
FCGRT-217ENST00000599988 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.74■■■■■ 4.43
FCGRT-217ENST00000599988 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.71■■■■■ 4.43
FCGRT-217ENST00000599988 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.71■■■■■ 4.43
FCGRT-217ENST00000599988 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.71■■■■■ 4.43
FCGRT-217ENST00000599988 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.71■■■■■ 4.43
FCGRT-217ENST00000599988 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.7■■■■■ 4.43
FCGRT-217ENST00000599988 ARHGEF11O15085 1522 aa42.67■■■■■ 4.42
FCGRT-217ENST00000599988 GRIN2AQ12879 1464 aa42.58■■■■■ 4.41
FCGRT-217ENST00000599988 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.57■■■■■ 4.41
FCGRT-217ENST00000599988 KIF27Q86VH2 1401 aa42.46■■■■■ 4.39
FCGRT-217ENST00000599988 NUP160Q12769 1436 aa42.42■■■■■ 4.38
FCGRT-217ENST00000599988 CEP170Q5SW79 1584 aa42.41■■■■■ 4.38
FCGRT-217ENST00000599988 CUL7Q14999 1698 aa42.35■■■■■ 4.37
FCGRT-217ENST00000599988 ARAP1Q96P48 1450 aa42.31■■■■■ 4.36
FCGRT-217ENST00000599988 IGF1RP08069 1367 aa42.28■■■■■ 4.36
FCGRT-217ENST00000599988 SHROOM2Q13796 1616 aa42.2■■■■■ 4.35
FCGRT-217ENST00000599988 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.14■■■■■ 4.34
FCGRT-217ENST00000599988 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.07■■■■■ 4.33
FCGRT-217ENST00000599988 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.02■■■■■ 4.32
FCGRT-217ENST00000599988 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.02■■■■■ 4.32
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