Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJA3Q96EY1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJA3Q96EY1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJA3Q96EY1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms