RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439686.6

ARL6IP4-208, Transcript of ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene ARL6IP4, Length 796 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL6IP4-208ENST00000439686 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.85■■■■■ 7.17
ARL6IP4-208ENST00000439686 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.02■■■■■ 6.08
ARL6IP4-208ENST00000439686 ABCC9O60706 1549 aa52.39■■■■■ 5.98
ARL6IP4-208ENST00000439686 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.37■■■■■ 5.65
ARL6IP4-208ENST00000439686 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.1■■■■■ 5.61
ARL6IP4-208ENST00000439686 NACADO15069 1562 aa50.01■■■■■ 5.6
ARL6IP4-208ENST00000439686 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.76■■■■■ 5.56
ARL6IP4-208ENST00000439686 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.62■■■■■ 5.53
ARL6IP4-208ENST00000439686 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.38■■■■■ 5.5
ARL6IP4-208ENST00000439686 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.1■■■■■ 5.454e-8■■■□□ 14.8
ARL6IP4-208ENST00000439686 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.9■■■■■ 5.42
ARL6IP4-208ENST00000439686 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.7■■■■■ 5.39
ARL6IP4-208ENST00000439686 SCRIBQ14160 1630 aa48.59■■■■■ 5.37
ARL6IP4-208ENST00000439686 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.46■■■■■ 5.35
ARL6IP4-208ENST00000439686 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.94■■■■■ 5.26
ARL6IP4-208ENST00000439686 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.39■■■■■ 5.18
ARL6IP4-208ENST00000439686 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.25■■■■■ 5.15
ARL6IP4-208ENST00000439686 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.03■■■■■ 5.12
ARL6IP4-208ENST00000439686 SMARCA4P51532 1647 aa46.39■■■■■ 5.02
ARL6IP4-208ENST00000439686 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.3■■■■■ 5
ARL6IP4-208ENST00000439686 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.3■■■■■ 5
ARL6IP4-208ENST00000439686 NCAPD3P42695 1498 aa46.27■■■■■ 5
ARL6IP4-208ENST00000439686 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.18■■■■■ 4.98
ARL6IP4-208ENST00000439686 SMARCA2P51531 1590 aa46.09■■■■■ 4.97
ARL6IP4-208ENST00000439686 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.89■■■■■ 4.94
ARL6IP4-208ENST00000439686 HMGXB3Q12766 1538 aa45.87■■■■■ 4.93
ARL6IP4-208ENST00000439686 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.85■■■■■ 4.93
ARL6IP4-208ENST00000439686 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.63■■■■■ 4.9
ARL6IP4-208ENST00000439686 WIZO95785 1651 aa45.61■■■■■ 4.89
ARL6IP4-208ENST00000439686 NESP48681 1621 aa45.3■■■■■ 4.84
ARL6IP4-208ENST00000439686 ERCC6Q03468 1493 aa45.07■■■■■ 4.81
ARL6IP4-208ENST00000439686 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.06■■■■■ 4.8
ARL6IP4-208ENST00000439686 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.96■■■■■ 4.79
ARL6IP4-208ENST00000439686 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.94■■■■■ 4.78
ARL6IP4-208ENST00000439686 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.76■■■■■ 4.76
ARL6IP4-208ENST00000439686 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.68■■■■■ 4.74
ARL6IP4-208ENST00000439686 CFTRP13569 1480 aa44.6■■■■■ 4.73
ARL6IP4-208ENST00000439686 CUX2O14529 1486 aa44.57■■■■■ 4.73
ARL6IP4-208ENST00000439686 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.55■■■■■ 4.72
ARL6IP4-208ENST00000439686 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.54■■■■■ 4.72
ARL6IP4-208ENST00000439686 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.44■■■■■ 4.71
ARL6IP4-208ENST00000439686 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.4■■■■■ 4.7
ARL6IP4-208ENST00000439686 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.3■■■■■ 4.68
ARL6IP4-208ENST00000439686 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.29■■■■■ 4.68
ARL6IP4-208ENST00000439686 WDR62O43379 1518 aa44.09■■■■■ 4.65
ARL6IP4-208ENST00000439686 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44■■■■■ 4.63
ARL6IP4-208ENST00000439686 PRDM2Q13029 1718 aa43.93■■■■■ 4.62
ARL6IP4-208ENST00000439686 TOPBP1Q92547 1522 aa43.67■■■■■ 4.58
ARL6IP4-208ENST00000439686 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.64■■■■■ 4.58
ARL6IP4-208ENST00000439686 ABCC8Q09428 1581 aa43.55■■■■■ 4.56
ARL6IP4-208ENST00000439686 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.51■■■■■ 4.56
ARL6IP4-208ENST00000439686 IFT140Q96RY7 1462 aa43.4■■■■■ 4.54
ARL6IP4-208ENST00000439686 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.34■■■■■ 4.53
ARL6IP4-208ENST00000439686 CUX1P39880 1505 aa43.31■■■■■ 4.52
ARL6IP4-208ENST00000439686 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.29■■■■■ 4.52
ARL6IP4-208ENST00000439686 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.22■■■■■ 4.51
ARL6IP4-208ENST00000439686 SOGA1O94964 1423 aa43.19■■■■■ 4.5
ARL6IP4-208ENST00000439686 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.17■■■■■ 4.5
ARL6IP4-208ENST00000439686 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.15■■■■■ 4.5
ARL6IP4-208ENST00000439686 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.11■■■■■ 4.494e-7■■■■■ 38.3
ARL6IP4-208ENST00000439686 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.04■■■■■ 4.48
ARL6IP4-208ENST00000439686 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.97■■■■■ 4.47
ARL6IP4-208ENST00000439686 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.96■■■■■ 4.47
ARL6IP4-208ENST00000439686 OSCARQ8IYS5 282 aa42.91■■■■■ 4.46
ARL6IP4-208ENST00000439686 SYNJ1O43426 1573 aa42.84■■■■■ 4.45
ARL6IP4-208ENST00000439686 TOP2BQ02880 1626 aa42.78■■■■■ 4.44
ARL6IP4-208ENST00000439686 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.72■■■■■ 4.43
ARL6IP4-208ENST00000439686 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.71■■■■■ 4.43
ARL6IP4-208ENST00000439686 FBLN2P98095 1184 aa42.69■■■■■ 4.42
ARL6IP4-208ENST00000439686 WDR97A6NE52 1622 aa42.63■■■■■ 4.41
ARL6IP4-208ENST00000439686 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.62■■■■■ 4.41
ARL6IP4-208ENST00000439686 GRIN2BQ13224 1484 aa42.62■■■■■ 4.41
ARL6IP4-208ENST00000439686 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.61■■■■■ 4.41
ARL6IP4-208ENST00000439686 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.49■■■■■ 4.39
ARL6IP4-208ENST00000439686 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.46■■■■■ 4.39
ARL6IP4-208ENST00000439686 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.45■■■■■ 4.39
ARL6IP4-208ENST00000439686 CHD1O14646 1710 aa42.43■■■■■ 4.38
ARL6IP4-208ENST00000439686 PBRM1Q86U86 1689 aa42.35■■■■■ 4.37
ARL6IP4-208ENST00000439686 SYNJ2O15056 1496 aa42.33■■■■■ 4.37
ARL6IP4-208ENST00000439686 TRIM41Q8WV44 630 aa42.2■■■■■ 4.35
ARL6IP4-208ENST00000439686 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.13■■■■■ 4.33
ARL6IP4-208ENST00000439686 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.12■■■■■ 4.33
ARL6IP4-208ENST00000439686 ADAMTS12P58397 1594 aa42.09■■■■■ 4.33
ARL6IP4-208ENST00000439686 ARHGEF11O15085 1522 aa42.07■■■■■ 4.33
ARL6IP4-208ENST00000439686 KIF27Q86VH2 1401 aa42.07■■■■■ 4.33
ARL6IP4-208ENST00000439686 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.06■■■■■ 4.32
ARL6IP4-208ENST00000439686 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.06■■■■■ 4.32
ARL6IP4-208ENST00000439686 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.06■■■■■ 4.32
ARL6IP4-208ENST00000439686 IGF1RP08069 1367 aa42.06■■■■■ 4.32
ARL6IP4-208ENST00000439686 GRIN2AQ12879 1464 aa42.05■■■■■ 4.32
ARL6IP4-208ENST00000439686 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.04■■■■■ 4.32
ARL6IP4-208ENST00000439686 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.91■■■■■ 4.3
ARL6IP4-208ENST00000439686 NUP160Q12769 1436 aa41.89■■■■■ 4.3
ARL6IP4-208ENST00000439686 CEP170Q5SW79 1584 aa41.85■■■■■ 4.29
ARL6IP4-208ENST00000439686 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.81■■■■■ 4.28
ARL6IP4-208ENST00000439686 ARAP1Q96P48 1450 aa41.78■■■■■ 4.28
ARL6IP4-208ENST00000439686 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.76■■■■■ 4.27
ARL6IP4-208ENST00000439686 JPH4Q96JJ6 628 aa41.63■■■■■ 4.25
ARL6IP4-208ENST00000439686 CUL7Q14999 1698 aa41.63■■■■■ 4.25
ARL6IP4-208ENST00000439686 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.59■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms