RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354833.7

SERF1A-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1A, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1A-202ENST00000354833 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.49■■■■■ 6.31
SERF1A-202ENST00000354833 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.34■■■■■ 5.17
SERF1A-202ENST00000354833 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.84■■■■■ 4.93
SERF1A-202ENST00000354833 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.06■■■■■ 4.8
SERF1A-202ENST00000354833 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.93■■■■■ 4.78
SERF1A-202ENST00000354833 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.67■■■■■ 4.74
SERF1A-202ENST00000354833 ABCC9O60706 1549 aa44.58■■■■■ 4.73
SERF1A-202ENST00000354833 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.42■■■■■ 4.7
SERF1A-202ENST00000354833 NACADO15069 1562 aa44.06■■■■■ 4.64
SERF1A-202ENST00000354833 SCRIBQ14160 1630 aa43.61■■■■■ 4.57
SERF1A-202ENST00000354833 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.61■■■■■ 4.57
SERF1A-202ENST00000354833 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.11■■■■■ 4.49
SERF1A-202ENST00000354833 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.71■■■■■ 4.43
SERF1A-202ENST00000354833 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
SERF1A-202ENST00000354833 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.34■■■■■ 4.37
SERF1A-202ENST00000354833 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.32■■■■■ 4.36
SERF1A-202ENST00000354833 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.12■■■■■ 4.33
SERF1A-202ENST00000354833 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.12■■■■■ 4.33
SERF1A-202ENST00000354833 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
SERF1A-202ENST00000354833 SMARCA4P51532 1647 aa41.82■■■■■ 4.29
SERF1A-202ENST00000354833 WIZO95785 1651 aa41.77■■■■■ 4.28
SERF1A-202ENST00000354833 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.43■■■■■ 4.22
SERF1A-202ENST00000354833 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
SERF1A-202ENST00000354833 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.3■■■■■ 4.2
SERF1A-202ENST00000354833 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.09■■■■■ 4.17
SERF1A-202ENST00000354833 SMARCA2P51531 1590 aa41.05■■■■■ 4.16
SERF1A-202ENST00000354833 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
SERF1A-202ENST00000354833 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.95■■■■■ 4.15
SERF1A-202ENST00000354833 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
SERF1A-202ENST00000354833 NCAPD3P42695 1498 aa40.69■■■■■ 4.1
SERF1A-202ENST00000354833 HMGXB3Q12766 1538 aa40.64■■■■■ 4.1
SERF1A-202ENST00000354833 TRIM41Q8WV44 630 aa40.52■■■■■ 4.08
SERF1A-202ENST00000354833 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.33■■■■■ 4.05
SERF1A-202ENST00000354833 ABCC8Q09428 1581 aa40.17■■■■■ 4.02
SERF1A-202ENST00000354833 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.89■■■■□ 3.98
SERF1A-202ENST00000354833 CFTRP13569 1480 aa39.86■■■■□ 3.97
SERF1A-202ENST00000354833 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.85■■■■□ 3.97
SERF1A-202ENST00000354833 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.78■■■■□ 3.96
SERF1A-202ENST00000354833 SYNJ1O43426 1573 aa39.71■■■■□ 3.95
SERF1A-202ENST00000354833 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.67■■■■□ 3.94
SERF1A-202ENST00000354833 PRDM2Q13029 1718 aa39.59■■■■□ 3.93
SERF1A-202ENST00000354833 TOP2BQ02880 1626 aa39.52■■■■□ 3.92
SERF1A-202ENST00000354833 SOGA1O94964 1423 aa39.49■■■■□ 3.91
SERF1A-202ENST00000354833 EEA1Q15075 1411 aa39.46■■■■□ 3.91
SERF1A-202ENST00000354833 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.46■■■■□ 3.91
SERF1A-202ENST00000354833 CUX1P39880 1505 aa39.36■■■■□ 3.89
SERF1A-202ENST00000354833 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.32■■■■□ 3.89
SERF1A-202ENST00000354833 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.28■■■■□ 3.88
SERF1A-202ENST00000354833 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.24■■■■□ 3.87
SERF1A-202ENST00000354833 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.24■■■■□ 3.87
SERF1A-202ENST00000354833 NESP48681 1621 aa39.23■■■■□ 3.87
SERF1A-202ENST00000354833 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.23■■■■□ 3.87
SERF1A-202ENST00000354833 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.22■■■■□ 3.87
SERF1A-202ENST00000354833 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.95■■■■□ 3.83
SERF1A-202ENST00000354833 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.95■■■■□ 3.83
SERF1A-202ENST00000354833 GOLGA3Q08378 1498 aa38.93■■■■□ 3.82
SERF1A-202ENST00000354833 KIF21BO75037 1637 aa38.92■■■■□ 3.82
SERF1A-202ENST00000354833 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.91■■■■□ 3.82
SERF1A-202ENST00000354833 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.89■■■■□ 3.82
SERF1A-202ENST00000354833 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.87■■■■□ 3.81
SERF1A-202ENST00000354833 KIF27Q86VH2 1401 aa38.86■■■■□ 3.81
SERF1A-202ENST00000354833 TOPBP1Q92547 1522 aa38.83■■■■□ 3.81
SERF1A-202ENST00000354833 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.75■■■■□ 3.79
SERF1A-202ENST00000354833 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
SERF1A-202ENST00000354833 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.71■■■■□ 3.79
SERF1A-202ENST00000354833 CUX2O14529 1486 aa38.69■■■■□ 3.78
SERF1A-202ENST00000354833 CEP162Q5TB80 1403 aa38.68■■■■□ 3.78
SERF1A-202ENST00000354833 PRXQ9BXM0 1461 aa38.68■■■■□ 3.78
SERF1A-202ENST00000354833 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.67■■■■□ 3.78
SERF1A-202ENST00000354833 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.67■■■■□ 3.78
SERF1A-202ENST00000354833 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.61■■■■□ 3.77
SERF1A-202ENST00000354833 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.56■■■■□ 3.76
SERF1A-202ENST00000354833 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.55■■■■□ 3.76
SERF1A-202ENST00000354833 IGF1RP08069 1367 aa38.5■■■■□ 3.75
SERF1A-202ENST00000354833 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.42■■■■□ 3.74
SERF1A-202ENST00000354833 WDR97A6NE52 1622 aa38.37■■■■□ 3.73
SERF1A-202ENST00000354833 CLIP1P30622 1438 aa38.32■■■■□ 3.73
SERF1A-202ENST00000354833 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.31■■■■□ 3.72
SERF1A-202ENST00000354833 PCGF6Q9BYE7 350 aa38.3■■■■□ 3.72
SERF1A-202ENST00000354833 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP38.24■■■■□ 3.71
SERF1A-202ENST00000354833 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.22■■■■□ 3.71
SERF1A-202ENST00000354833 WDR62O43379 1518 aa38.21■■■■□ 3.71
SERF1A-202ENST00000354833 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.2■■■■□ 3.71
SERF1A-202ENST00000354833 ERCC6Q03468 1493 aa38.19■■■■□ 3.7
SERF1A-202ENST00000354833 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.16■■■■□ 3.7
SERF1A-202ENST00000354833 CUL7Q14999 1698 aa38.13■■■■□ 3.69
SERF1A-202ENST00000354833 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.13■■■■□ 3.69
SERF1A-202ENST00000354833 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.04■■■■□ 3.68
SERF1A-202ENST00000354833 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.03■■■■□ 3.68
SERF1A-202ENST00000354833 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.02■■■■□ 3.68
SERF1A-202ENST00000354833 IFT140Q96RY7 1462 aa38■■■■□ 3.67
SERF1A-202ENST00000354833 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.95■■■■□ 3.67
SERF1A-202ENST00000354833 ARAP1Q96P48 1450 aa37.92■■■■□ 3.66
SERF1A-202ENST00000354833 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.87■■■■□ 3.65
SERF1A-202ENST00000354833 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.86■■■■□ 3.65
SERF1A-202ENST00000354833 PBRM1Q86U86 1689 aa37.84■■■■□ 3.65
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.8■■■■□ 3.64
SERF1A-202ENST00000354833 GRIN2BQ13224 1484 aa37.78■■■■□ 3.64
SERF1A-202ENST00000354833 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.73■■■■□ 3.63
SERF1A-202ENST00000354833 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.72■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms