RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423571.6

MXD3-201, Transcript of MAX dimerization protein 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MXD3, Length 1,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3-201ENST00000423571 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.91■■■■■ 6.7
MXD3-201ENST00000423571 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.98■■■■■ 5.59
MXD3-201ENST00000423571 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.69■■■■■ 5.23
MXD3-201ENST00000423571 ABCC9O60706 1549 aa47.69■■■■■ 5.22
MXD3-201ENST00000423571 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.14■■■■■ 5.14
MXD3-201ENST00000423571 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.03■■■■■ 5.12
MXD3-201ENST00000423571 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.84■■■■■ 5.09
MXD3-201ENST00000423571 NACADO15069 1562 aa46.69■■■■■ 5.07
MXD3-201ENST00000423571 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.42■■■■■ 5.02
MXD3-201ENST00000423571 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.81■■■■■ 4.92
MXD3-201ENST00000423571 SCRIBQ14160 1630 aa45.76■■■■■ 4.92
MXD3-201ENST00000423571 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.4■■■■■ 4.86
MXD3-201ENST00000423571 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.99■■■■■ 4.79
MXD3-201ENST00000423571 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.8■■■■■ 4.763e-7■■■■□ 21.4
MXD3-201ENST00000423571 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.21■■■■■ 4.67
MXD3-201ENST00000423571 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.01■■■■■ 4.64
MXD3-201ENST00000423571 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.9■■■■■ 4.62
MXD3-201ENST00000423571 SMARCA4P51532 1647 aa43.88■■■■■ 4.61
MXD3-201ENST00000423571 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.87■■■■■ 4.61
MXD3-201ENST00000423571 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.78■■■■■ 4.6
MXD3-201ENST00000423571 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.7■■■■■ 4.59
MXD3-201ENST00000423571 WIZO95785 1651 aa43.49■■■■■ 4.55
MXD3-201ENST00000423571 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.42■■■■■ 4.54
MXD3-201ENST00000423571 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.31■■■■■ 4.52
MXD3-201ENST00000423571 SMARCA2P51531 1590 aa43.31■■■■■ 4.52
MXD3-201ENST00000423571 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.19■■■■■ 4.5
MXD3-201ENST00000423571 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.09■■■■■ 4.49
MXD3-201ENST00000423571 NCAPD3P42695 1498 aa43.08■■■■■ 4.49
MXD3-201ENST00000423571 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
MXD3-201ENST00000423571 HMGXB3Q12766 1538 aa42.98■■■■■ 4.47
MXD3-201ENST00000423571 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.6■■■■■ 4.41
MXD3-201ENST00000423571 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.59■■■■■ 4.41
MXD3-201ENST00000423571 CFTRP13569 1480 aa41.94■■■■■ 4.3
MXD3-201ENST00000423571 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.9■■■■■ 4.3
MXD3-201ENST00000423571 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.72■■■■■ 4.27
MXD3-201ENST00000423571 PRDM2Q13029 1718 aa41.69■■■■■ 4.27
MXD3-201ENST00000423571 NESP48681 1621 aa41.66■■■■■ 4.26
MXD3-201ENST00000423571 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.64■■■■■ 4.26
MXD3-201ENST00000423571 ABCC8Q09428 1581 aa41.45■■■■■ 4.23
MXD3-201ENST00000423571 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.43■■■■■ 4.22
MXD3-201ENST00000423571 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.41■■■■■ 4.22
MXD3-201ENST00000423571 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.33■■■■■ 4.21
MXD3-201ENST00000423571 TRIM41Q8WV44 630 aa41.28■■■■■ 4.2
MXD3-201ENST00000423571 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.24■■■■■ 4.19
MXD3-201ENST00000423571 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.19■■■■■ 4.18
MXD3-201ENST00000423571 SYNJ1O43426 1573 aa41.16■■■■■ 4.18
MXD3-201ENST00000423571 CUX1P39880 1505 aa41.11■■■■■ 4.17
MXD3-201ENST00000423571 TOP2BQ02880 1626 aa41.09■■■■■ 4.17
MXD3-201ENST00000423571 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.07■■■■■ 4.16
MXD3-201ENST00000423571 ERCC6Q03468 1493 aa40.98■■■■■ 4.15
MXD3-201ENST00000423571 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.97■■■■■ 4.15
MXD3-201ENST00000423571 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
MXD3-201ENST00000423571 TOPBP1Q92547 1522 aa40.91■■■■■ 4.14
MXD3-201ENST00000423571 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.9■■■■■ 4.14
MXD3-201ENST00000423571 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.75■■■■■ 4.11
MXD3-201ENST00000423571 WDR62O43379 1518 aa40.72■■■■■ 4.11
MXD3-201ENST00000423571 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
MXD3-201ENST00000423571 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
MXD3-201ENST00000423571 SOGA1O94964 1423 aa40.55■■■■■ 4.08
MXD3-201ENST00000423571 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.48■■■■■ 4.07
MXD3-201ENST00000423571 EEA1Q15075 1411 aa40.46■■■■■ 4.07
MXD3-201ENST00000423571 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.42■■■■■ 4.06
MXD3-201ENST00000423571 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.42■■■■■ 4.06
MXD3-201ENST00000423571 CUX2O14529 1486 aa40.41■■■■■ 4.06
MXD3-201ENST00000423571 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.41■■■■■ 4.06
MXD3-201ENST00000423571 KIF27Q86VH2 1401 aa40.36■■■■■ 4.05
MXD3-201ENST00000423571 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
MXD3-201ENST00000423571 WDR97A6NE52 1622 aa40.34■■■■■ 4.05
MXD3-201ENST00000423571 IFT140Q96RY7 1462 aa40.32■■■■■ 4.05
MXD3-201ENST00000423571 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.22■■■■■ 4.03
MXD3-201ENST00000423571 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.14■■■■■ 4.02
MXD3-201ENST00000423571 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
MXD3-201ENST00000423571 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.07■■■■■ 4
MXD3-201ENST00000423571 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
MXD3-201ENST00000423571 IGF1RP08069 1367 aa40.04■■■■■ 4
MXD3-201ENST00000423571 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.99■■■■□ 3.999e-9■■■■□ 22.1
MXD3-201ENST00000423571 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.95■■■■□ 3.99
MXD3-201ENST00000423571 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.95■■■■□ 3.99
MXD3-201ENST00000423571 KIF21BO75037 1637 aa39.94■■■■□ 3.98
MXD3-201ENST00000423571 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
MXD3-201ENST00000423571 PRXQ9BXM0 1461 aa39.93■■■■□ 3.98
MXD3-201ENST00000423571 PBRM1Q86U86 1689 aa39.88■■■■□ 3.98
MXD3-201ENST00000423571 GRIN2BQ13224 1484 aa39.87■■■■□ 3.97
MXD3-201ENST00000423571 CUL7Q14999 1698 aa39.84■■■■□ 3.97
MXD3-201ENST00000423571 GOLGA3Q08378 1498 aa39.83■■■■□ 3.97
MXD3-201ENST00000423571 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.83■■■■□ 3.97
MXD3-201ENST00000423571 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.78■■■■□ 3.96
MXD3-201ENST00000423571 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.78■■■■□ 3.96
MXD3-201ENST00000423571 ADAMTS12P58397 1594 aa39.65■■■■□ 3.94
MXD3-201ENST00000423571 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.65■■■■□ 3.94
MXD3-201ENST00000423571 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.65■■■■□ 3.94
MXD3-201ENST00000423571 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.63■■■■□ 3.93
MXD3-201ENST00000423571 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.6■■■■□ 3.93
MXD3-201ENST00000423571 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.58■■■■□ 3.93
MXD3-201ENST00000423571 SYNJ2O15056 1496 aa39.46■■■■□ 3.91
MXD3-201ENST00000423571 GRIN2AQ12879 1464 aa39.37■■■■□ 3.89
MXD3-201ENST00000423571 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.35■■■■□ 3.89
MXD3-201ENST00000423571 CEP162Q5TB80 1403 aa39.29■■■■□ 3.88
MXD3-201ENST00000423571 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.27■■■■□ 3.88
MXD3-201ENST00000423571 FBLN2P98095 1184 aa39.24■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms