RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380750.7

SERF1B-201, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1B, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-201ENST00000380750 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.49■■■■■ 6.31
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SERF1B-201ENST00000380750 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.93■■■■■ 4.78
SERF1B-201ENST00000380750 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.67■■■■■ 4.74
SERF1B-201ENST00000380750 ABCC9O60706 1549 aa44.58■■■■■ 4.73
SERF1B-201ENST00000380750 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.42■■■■■ 4.7
SERF1B-201ENST00000380750 NACADO15069 1562 aa44.06■■■■■ 4.64
SERF1B-201ENST00000380750 SCRIBQ14160 1630 aa43.61■■■■■ 4.57
SERF1B-201ENST00000380750 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.61■■■■■ 4.57
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SERF1B-201ENST00000380750 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.32■■■■■ 4.36
SERF1B-201ENST00000380750 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.12■■■■■ 4.33
SERF1B-201ENST00000380750 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.12■■■■■ 4.33
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SERF1B-201ENST00000380750 WIZO95785 1651 aa41.77■■■■■ 4.28
SERF1B-201ENST00000380750 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.43■■■■■ 4.22
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SERF1B-201ENST00000380750 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.3■■■■■ 4.2
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SERF1B-201ENST00000380750 SMARCA2P51531 1590 aa41.05■■■■■ 4.16
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SERF1B-201ENST00000380750 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.33■■■■■ 4.05
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SERF1B-201ENST00000380750 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.85■■■■□ 3.97
SERF1B-201ENST00000380750 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.78■■■■□ 3.96
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SERF1B-201ENST00000380750 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.67■■■■□ 3.94
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SERF1B-201ENST00000380750 TOP2BQ02880 1626 aa39.52■■■■□ 3.92
SERF1B-201ENST00000380750 SOGA1O94964 1423 aa39.49■■■■□ 3.91
SERF1B-201ENST00000380750 EEA1Q15075 1411 aa39.46■■■■□ 3.91
SERF1B-201ENST00000380750 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.46■■■■□ 3.91
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SERF1B-201ENST00000380750 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.32■■■■□ 3.89
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SERF1B-201ENST00000380750 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.24■■■■□ 3.87
SERF1B-201ENST00000380750 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.24■■■■□ 3.87
SERF1B-201ENST00000380750 NESP48681 1621 aa39.23■■■■□ 3.87
SERF1B-201ENST00000380750 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.23■■■■□ 3.87
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SERF1B-201ENST00000380750 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.89■■■■□ 3.82
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SERF1B-201ENST00000380750 CUX2O14529 1486 aa38.69■■■■□ 3.78
SERF1B-201ENST00000380750 CEP162Q5TB80 1403 aa38.68■■■■□ 3.78
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