Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 KPNB1-205ENST00000577918 859 ntTSL 313.77□□□□□ -0.212e-7■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 TMEM8A-203ENST00000427313 587 ntTSL 411.12□□□□□ -0.631e-7■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 SFXN5-218ENST00000487508 507 ntTSL 410.6□□□□□ -0.713e-6■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 SFXN5-209ENST00000464825 532 ntTSL 48.1□□□□□ -1.113e-6■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 SREBF1-208ENST00000469356 1323 ntTSL 322.1■■□□□ 1.132e-7■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 MYO1E-204ENST00000558646 578 ntTSL 216.57■□□□□ 0.245e-6■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 SREBF1-221ENST00000583080 482 ntTSL 514.79□□□□□ -0.042e-7■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 PSD4-209ENST00000465917 910 ntTSL 213.77□□□□□ -0.214e-6■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 SREBF1-215ENST00000487401 477 ntTSL 211.53□□□□□ -0.562e-7■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 MYO1E-201ENST00000288235 8673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.955e-6■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 MYO1E-203ENST00000558571 557 ntTSL 57.08□□□□□ -1.285e-6■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 ANPEP-201ENST00000300060 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.673e-9■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.432e-6■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.312e-6■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 MFGE8-205ENST00000558018 1989 ntTSL 216.69■□□□□ 0.262e-6■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.122e-6■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.685e-6■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.732e-6■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.832e-6■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 RASGRF2-203ENST00000503795 3837 ntTSL 1 (best)11.5□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 RASGRF2-201ENST00000265080 8167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 FAF1-204ENST00000487898 681 ntTSL 34.26□□□□□ -1.732e-7■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 RPH3AL-206ENST00000570954 568 ntTSL 411.85□□□□□ -0.513e-8■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.028e-8■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 PCSK6-205ENST00000558433 543 ntTSL 412.34□□□□□ -0.438e-8■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 PCSK6-212ENST00000560785 507 ntTSL 411.23□□□□□ -0.618e-8■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 PCSK6-206ENST00000558864 3868 ntTSL 26.41□□□□□ -1.388e-8■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 RPL37A-212ENST00000600880 425 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.645e-11■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 RPL37A-205ENST00000446558 495 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.685e-11■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 AL109930.1-201ENST00000606932 724 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.041e-7■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.335e-10■■■■□ 24.2
PCBP2Q15366 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.375e-8■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 SMG1P3-202ENST00000437413 589 ntTSL 420.99■□□□□ 0.958e-8■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.168e-8■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.572e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.582e-33■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.472e-8■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CPSF7-222ENST00000544585 722 ntTSL 27.12□□□□□ -1.271e-6■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.351e-6■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 ACAP3-210ENST00000478065 2393 ntTSL 319.22■□□□□ 0.672e-6■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.312e-6■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CCDC12-211ENST00000604367 2412 nt14.83□□□□□ -0.048e-17■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 MVK-203ENST00000447878 1644 ntTSL 225.21■■□□□ 1.639e-13■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 SYNGAP1-206ENST00000479510 2073 ntTSL 224.35■■□□□ 1.499e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.29e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.129e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.129e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CDON-204ENST00000527967 722 ntTSL 321.68■■□□□ 1.069e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.939e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 MCRS1-209ENST00000549000 1074 ntTSL 219.52■□□□□ 0.729e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 IL17RA-203ENST00000477874 651 ntTSL 319.42■□□□□ 0.79e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 NSFL1C-211ENST00000555359 450 ntTSL 319.31■□□□□ 0.689e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.669e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.649e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.629e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.69e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.589e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.523e-6■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.499e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 WDFY3-AS2-203ENST00000624443 461 ntTSL 317.91■□□□□ 0.469e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 KCTD10-202ENST00000440541 2493 ntTSL 217.76■□□□□ 0.432e-12■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PRPF40B-206ENST00000547764 803 ntTSL 317.73■□□□□ 0.439e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PLOD3-212ENST00000478082 1585 ntTSL 217.73■□□□□ 0.439e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.429e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.429e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.419e-13■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.369e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PDLIM2-214ENST00000452226 845 ntTSL 217.24■□□□□ 0.359e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 MVK-216ENST00000636996 1725 ntTSL 517.18■□□□□ 0.349e-13■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PDLIM2-215ENST00000456545 757 ntTSL 517.05■□□□□ 0.329e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.39e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PLOD3-209ENST00000460475 746 ntTSL 316.85■□□□□ 0.299e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.249e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.239e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.239e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.239e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PDLIM2-208ENST00000416159 880 ntTSL 516.34■□□□□ 0.219e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PLOD3-203ENST00000421736 809 ntTSL 516.23■□□□□ 0.199e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CKLF-CMTM1-202ENST00000527845 504 ntTSL 316.08■□□□□ 0.169e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 NSFL1C-208ENST00000487086 456 ntTSL 215.85■□□□□ 0.139e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 NPRL3-214ENST00000622194 2981 ntTSL 515.77■□□□□ 0.115e-11■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.089e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 LPCAT4-205ENST00000563748 1357 ntTSL 215.5■□□□□ 0.079e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PDLIM2-217ENST00000491330 563 ntTSL 315.45■□□□□ 0.069e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 AAAS-215ENST00000549983 860 ntTSL 315.42■□□□□ 0.061e-6■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 MCRS1-204ENST00000547182 724 ntTSL 315.15■□□□□ 0.029e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 MCRS1-212ENST00000551598 636 ntTSL 515.15■□□□□ 0.029e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 MCRS1-208ENST00000548646 608 ntTSL 315.15■□□□□ 0.029e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 MVK-215ENST00000636529 1509 ntTSL 515.02■□□□□ -09e-13■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.019e-13■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 SLC25A42-204ENST00000597661 519 ntTSL 314.97□□□□□ -0.019e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 MCRS1-213ENST00000551625 2450 ntTSL 1 (best)14.74□□□□□ -0.059e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.079e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.079e-13■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 MCRS1-207ENST00000548602 1666 ntTSL 1 (best)14.61□□□□□ -0.079e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 PRPF40B-211ENST00000551063 531 ntTSL 414.6□□□□□ -0.079e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 CLSTN3-216ENST00000545663 533 ntTSL 414.55□□□□□ -0.089e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.092e-12■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.169e-7■■■■□ 24.1
PCBP2Q15366 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.169e-7■■■■□ 24.1
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