RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447878.6

MVK-203, Transcript of mevalonate kinase, humanhuman

TSL 2

Gene MVK, Length 1,644 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVK-203ENST00000447878 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.55■■■■■ 6.96
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MVK-203ENST00000447878 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.52■■■■■ 5.52
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MVK-203ENST00000447878 NACADO15069 1562 aa49.32■■■■■ 5.49
MVK-203ENST00000447878 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.81■■■■■ 5.4
MVK-203ENST00000447878 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.78■■■■■ 5.4
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MVK-203ENST00000447878 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.3■■■■■ 5.32
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MVK-203ENST00000447878 SCRIBQ14160 1630 aa47.69■■■■■ 5.23
MVK-203ENST00000447878 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.46■■■■■ 5.19
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MVK-203ENST00000447878 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.53■■■■■ 5.04
MVK-203ENST00000447878 SMARCA4P51532 1647 aa45.54■■■■■ 4.88
MVK-203ENST00000447878 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.53■■■■■ 4.88
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MVK-203ENST00000447878 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.46■■■■■ 4.87
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MVK-203ENST00000447878 SMARCA2P51531 1590 aa45.4■■■■■ 4.86
MVK-203ENST00000447878 HMGXB3Q12766 1538 aa45.21■■■■■ 4.83
MVK-203ENST00000447878 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.1■■■■■ 4.81
MVK-203ENST00000447878 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.09■■■■■ 4.81
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MVK-203ENST00000447878 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45■■■■■ 4.79
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MVK-203ENST00000447878 WIZO95785 1651 aa44.6■■■■■ 4.73
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MVK-203ENST00000447878 CUX2O14529 1486 aa44.34■■■■■ 4.69
MVK-203ENST00000447878 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.18■■■■■ 4.66
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MVK-203ENST00000447878 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.66■■■■■ 4.58
MVK-203ENST00000447878 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.65■■■■■ 4.58
MVK-203ENST00000447878 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.6■■■■■ 4.57
MVK-203ENST00000447878 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.6■■■■■ 4.57
MVK-203ENST00000447878 WDR62O43379 1518 aa43.54■■■■■ 4.56
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MVK-203ENST00000447878 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
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MVK-203ENST00000447878 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.8■■■■■ 4.44
MVK-203ENST00000447878 IFT140Q96RY7 1462 aa42.78■■■■■ 4.44
MVK-203ENST00000447878 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
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MVK-203ENST00000447878 CUX1P39880 1505 aa42.34■■■■■ 4.37
MVK-203ENST00000447878 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.32■■■■■ 4.37
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MVK-203ENST00000447878 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.17■■■■■ 4.34
MVK-203ENST00000447878 WDR97A6NE52 1622 aa42.11■■■■■ 4.33
MVK-203ENST00000447878 TOP2BQ02880 1626 aa42.09■■■■■ 4.33
MVK-203ENST00000447878 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.08■■■■■ 4.33
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MVK-203ENST00000447878 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.76■■■■■ 4.28
MVK-203ENST00000447878 PBRM1Q86U86 1689 aa41.75■■■■■ 4.27
MVK-203ENST00000447878 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.72■■■■■ 4.27
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MVK-203ENST00000447878 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.44■■■■■ 4.22
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MVK-203ENST00000447878 ADAMTS12P58397 1594 aa41.37■■■■■ 4.21
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MVK-203ENST00000447878 KIF27Q86VH2 1401 aa41.31■■■■■ 4.2
MVK-203ENST00000447878 ARAP1Q96P48 1450 aa41.3■■■■■ 4.2
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