RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268150.12

MFGE8-201, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MFGE8, Length 1,937 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-201ENST00000268150 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.88■■■■□ 3.81
MFGE8-201ENST00000268150 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.77■■■■□ 3
MFGE8-201ENST00000268150 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
MFGE8-201ENST00000268150 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.08■■■□□ 2.73
MFGE8-201ENST00000268150 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.08■■■□□ 2.73
MFGE8-201ENST00000268150 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.96■■■□□ 2.71
MFGE8-201ENST00000268150 ABCC9O60706 1549 aa31.86■■■□□ 2.69
MFGE8-201ENST00000268150 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.6■■■□□ 2.65
MFGE8-201ENST00000268150 NACADO15069 1562 aa31.39■■■□□ 2.62
MFGE8-201ENST00000268150 SCRIBQ14160 1630 aa31.19■■■□□ 2.58
MFGE8-201ENST00000268150 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.1■■■□□ 2.57
MFGE8-201ENST00000268150 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
MFGE8-201ENST00000268150 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.58■■■□□ 2.49
MFGE8-201ENST00000268150 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.26■■■□□ 2.44
MFGE8-201ENST00000268150 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
MFGE8-201ENST00000268150 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.24■■■□□ 2.43
MFGE8-201ENST00000268150 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.1■■■□□ 2.41
MFGE8-201ENST00000268150 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.1■■■□□ 2.41
MFGE8-201ENST00000268150 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
MFGE8-201ENST00000268150 WIZO95785 1651 aa29.88■■■□□ 2.37
MFGE8-201ENST00000268150 SMARCA4P51532 1647 aa29.87■■■□□ 2.37
MFGE8-201ENST00000268150 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.55■■■□□ 2.32
MFGE8-201ENST00000268150 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
MFGE8-201ENST00000268150 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.45■■■□□ 2.3
MFGE8-201ENST00000268150 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.31■■■□□ 2.28
MFGE8-201ENST00000268150 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
MFGE8-201ENST00000268150 SMARCA2P51531 1590 aa29.27■■■□□ 2.28
MFGE8-201ENST00000268150 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.23■■■□□ 2.27
MFGE8-201ENST00000268150 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
MFGE8-201ENST00000268150 NCAPD3P42695 1498 aa28.99■■■□□ 2.23
MFGE8-201ENST00000268150 HMGXB3Q12766 1538 aa28.97■■■□□ 2.23
MFGE8-201ENST00000268150 TRIM41Q8WV44 630 aa28.88■■■□□ 2.21
MFGE8-201ENST00000268150 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.82■■■□□ 2.2
MFGE8-201ENST00000268150 ABCC8Q09428 1581 aa28.74■■■□□ 2.19
MFGE8-201ENST00000268150 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.48■■■□□ 2.15
MFGE8-201ENST00000268150 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.15
MFGE8-201ENST00000268150 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
MFGE8-201ENST00000268150 CFTRP13569 1480 aa28.43■■■□□ 2.14
MFGE8-201ENST00000268150 SYNJ1O43426 1573 aa28.39■■■□□ 2.14
MFGE8-201ENST00000268150 PRDM2Q13029 1718 aa28.3■■■□□ 2.12
MFGE8-201ENST00000268150 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.27■■■□□ 2.12
MFGE8-201ENST00000268150 SOGA1O94964 1423 aa28.22■■■□□ 2.11
MFGE8-201ENST00000268150 TOP2BQ02880 1626 aa28.21■■■□□ 2.11
MFGE8-201ENST00000268150 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.18■■■□□ 2.1
MFGE8-201ENST00000268150 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.13■■■□□ 2.09
MFGE8-201ENST00000268150 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.13■■■□□ 2.09
MFGE8-201ENST00000268150 CUX1P39880 1505 aa28.13■■■□□ 2.09
MFGE8-201ENST00000268150 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.1■■■□□ 2.09
MFGE8-201ENST00000268150 EEA1Q15075 1411 aa28.07■■■□□ 2.08
MFGE8-201ENST00000268150 NESP48681 1621 aa28.06■■■□□ 2.08
MFGE8-201ENST00000268150 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.99■■■□□ 2.07
MFGE8-201ENST00000268150 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.97■■■□□ 2.07
MFGE8-201ENST00000268150 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.94■■■□□ 2.06
MFGE8-201ENST00000268150 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.78■■■□□ 2.04
MFGE8-201ENST00000268150 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.77■■■□□ 2.04
MFGE8-201ENST00000268150 KIF21BO75037 1637 aa27.77■■■□□ 2.04
MFGE8-201ENST00000268150 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.76■■■□□ 2.03
MFGE8-201ENST00000268150 GOLGA3Q08378 1498 aa27.76■■■□□ 2.03
MFGE8-201ENST00000268150 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.73■■■□□ 2.03
MFGE8-201ENST00000268150 TOPBP1Q92547 1522 aa27.72■■■□□ 2.03
MFGE8-201ENST00000268150 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.7■■■□□ 2.03
MFGE8-201ENST00000268150 KIF27Q86VH2 1401 aa27.69■■■□□ 2.02
MFGE8-201ENST00000268150 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.69■■■□□ 2.02
MFGE8-201ENST00000268150 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
MFGE8-201ENST00000268150 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.63■■■□□ 2.01
MFGE8-201ENST00000268150 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
MFGE8-201ENST00000268150 CUX2O14529 1486 aa27.62■■■□□ 2.01
MFGE8-201ENST00000268150 CEP162Q5TB80 1403 aa27.61■■■□□ 2.01
MFGE8-201ENST00000268150 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
MFGE8-201ENST00000268150 PRXQ9BXM0 1461 aa27.58■■■□□ 2.01
MFGE8-201ENST00000268150 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.55■■■□□ 2
MFGE8-201ENST00000268150 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.53■■■□□ 2
MFGE8-201ENST00000268150 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.49■■□□□ 1.99
MFGE8-201ENST00000268150 IGF1RP08069 1367 aa27.45■■□□□ 1.98
MFGE8-201ENST00000268150 WDR97A6NE52 1622 aa27.43■■□□□ 1.98
MFGE8-201ENST00000268150 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.41■■□□□ 1.98
MFGE8-201ENST00000268150 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.35■■□□□ 1.97
MFGE8-201ENST00000268150 CLIP1P30622 1438 aa27.33■■□□□ 1.97
MFGE8-201ENST00000268150 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.31■■□□□ 1.96
MFGE8-201ENST00000268150 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
MFGE8-201ENST00000268150 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.29■■□□□ 1.96
MFGE8-201ENST00000268150 WDR62O43379 1518 aa27.27■■□□□ 1.96
MFGE8-201ENST00000268150 ERCC6Q03468 1493 aa27.25■■□□□ 1.95
MFGE8-201ENST00000268150 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
MFGE8-201ENST00000268150 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
MFGE8-201ENST00000268150 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
MFGE8-201ENST00000268150 CUL7Q14999 1698 aa27.2■■□□□ 1.95
MFGE8-201ENST00000268150 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.2■■□□□ 1.94
MFGE8-201ENST00000268150 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
MFGE8-201ENST00000268150 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
MFGE8-201ENST00000268150 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.11■■□□□ 1.93
MFGE8-201ENST00000268150 ARAP1Q96P48 1450 aa27.09■■□□□ 1.93
MFGE8-201ENST00000268150 IFT140Q96RY7 1462 aa27.08■■□□□ 1.93
MFGE8-201ENST00000268150 PBRM1Q86U86 1689 aa27.06■■□□□ 1.92
MFGE8-201ENST00000268150 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.05■■□□□ 1.925e-7■■■■■ 32.3
MFGE8-201ENST00000268150 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.03■■□□□ 1.92
MFGE8-201ENST00000268150 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
MFGE8-201ENST00000268150 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.97■■□□□ 1.91
MFGE8-201ENST00000268150 GRIN2BQ13224 1484 aa26.94■■□□□ 1.9
MFGE8-201ENST00000268150 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms