RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566497.5

MFGE8-215, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene MFGE8, Length 1,689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-215ENST00000566497 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.38■■■■□ 3.41
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MFGE8-215ENST00000566497 ABCC9O60706 1549 aa30.6■■■□□ 2.49
MFGE8-215ENST00000566497 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
MFGE8-215ENST00000566497 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.13■■■□□ 2.41
MFGE8-215ENST00000566497 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.08■■■□□ 2.41
MFGE8-215ENST00000566497 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.96■■■□□ 2.39
MFGE8-215ENST00000566497 NACADO15069 1562 aa29.91■■■□□ 2.38
MFGE8-215ENST00000566497 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.78■■■□□ 2.36
MFGE8-215ENST00000566497 SCRIBQ14160 1630 aa29.34■■■□□ 2.29
MFGE8-215ENST00000566497 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.27■■■□□ 2.28
MFGE8-215ENST00000566497 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.16■■■□□ 2.26
MFGE8-215ENST00000566497 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.83■■■□□ 2.21
MFGE8-215ENST00000566497 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.68■■■□□ 2.18
MFGE8-215ENST00000566497 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.25■■■□□ 2.11
MFGE8-215ENST00000566497 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
MFGE8-215ENST00000566497 SMARCA4P51532 1647 aa28.11■■■□□ 2.09
MFGE8-215ENST00000566497 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.07■■■□□ 2.08
MFGE8-215ENST00000566497 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
MFGE8-215ENST00000566497 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
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MFGE8-215ENST00000566497 WIZO95785 1651 aa27.84■■■□□ 2.05
MFGE8-215ENST00000566497 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.79■■■□□ 2.04
MFGE8-215ENST00000566497 SMARCA2P51531 1590 aa27.74■■■□□ 2.03
MFGE8-215ENST00000566497 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.72■■■□□ 2.03
MFGE8-215ENST00000566497 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.71■■■□□ 2.03
MFGE8-215ENST00000566497 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
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MFGE8-215ENST00000566497 NCAPD3P42695 1498 aa27.55■■■□□ 2
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MFGE8-215ENST00000566497 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.21■■□□□ 1.95
MFGE8-215ENST00000566497 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.1■■□□□ 1.93
MFGE8-215ENST00000566497 CFTRP13569 1480 aa26.82■■□□□ 1.88
MFGE8-215ENST00000566497 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.8■■□□□ 1.88
MFGE8-215ENST00000566497 PRDM2Q13029 1718 aa26.78■■□□□ 1.88
MFGE8-215ENST00000566497 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.76■■□□□ 1.87
MFGE8-215ENST00000566497 NESP48681 1621 aa26.7■■□□□ 1.87
MFGE8-215ENST00000566497 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.54■■□□□ 1.84
MFGE8-215ENST00000566497 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.52■■□□□ 1.84
MFGE8-215ENST00000566497 ABCC8Q09428 1581 aa26.52■■□□□ 1.84
MFGE8-215ENST00000566497 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.46■■□□□ 1.83
MFGE8-215ENST00000566497 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.44■■□□□ 1.82
MFGE8-215ENST00000566497 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.42■■□□□ 1.82
MFGE8-215ENST00000566497 SYNJ1O43426 1573 aa26.34■■□□□ 1.81
MFGE8-215ENST00000566497 ERCC6Q03468 1493 aa26.33■■□□□ 1.81
MFGE8-215ENST00000566497 TRIM41Q8WV44 630 aa26.31■■□□□ 1.8
MFGE8-215ENST00000566497 TOP2BQ02880 1626 aa26.29■■□□□ 1.8
MFGE8-215ENST00000566497 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.29■■□□□ 1.8
MFGE8-215ENST00000566497 CUX1P39880 1505 aa26.29■■□□□ 1.8
MFGE8-215ENST00000566497 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.26■■□□□ 1.79
MFGE8-215ENST00000566497 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.23■■□□□ 1.79
MFGE8-215ENST00000566497 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
MFGE8-215ENST00000566497 TOPBP1Q92547 1522 aa26.2■■□□□ 1.78
MFGE8-215ENST00000566497 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
MFGE8-215ENST00000566497 WDR62O43379 1518 aa26.12■■□□□ 1.77
MFGE8-215ENST00000566497 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.1■■□□□ 1.77
MFGE8-215ENST00000566497 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.04■■□□□ 1.76
MFGE8-215ENST00000566497 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
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MFGE8-215ENST00000566497 WDR97A6NE52 1622 aa25.87■■□□□ 1.73
MFGE8-215ENST00000566497 CUX2O14529 1486 aa25.87■■□□□ 1.73
MFGE8-215ENST00000566497 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.86■■□□□ 1.73
MFGE8-215ENST00000566497 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
MFGE8-215ENST00000566497 IFT140Q96RY7 1462 aa25.83■■□□□ 1.73
MFGE8-215ENST00000566497 EEA1Q15075 1411 aa25.82■■□□□ 1.72
MFGE8-215ENST00000566497 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.79■■□□□ 1.72
MFGE8-215ENST00000566497 KIF27Q86VH2 1401 aa25.79■■□□□ 1.72
MFGE8-215ENST00000566497 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
MFGE8-215ENST00000566497 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.72■■□□□ 1.71
MFGE8-215ENST00000566497 HRCP23327 699 aa25.72■■□□□ 1.71
MFGE8-215ENST00000566497 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.7■■□□□ 1.7
MFGE8-215ENST00000566497 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
MFGE8-215ENST00000566497 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
MFGE8-215ENST00000566497 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.65■■□□□ 1.7
MFGE8-215ENST00000566497 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
MFGE8-215ENST00000566497 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.62■■□□□ 1.69
MFGE8-215ENST00000566497 PBRM1Q86U86 1689 aa25.61■■□□□ 1.69
MFGE8-215ENST00000566497 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.6■■□□□ 1.695e-7■■■■■ 32.3
MFGE8-215ENST00000566497 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.57■■□□□ 1.68
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MFGE8-215ENST00000566497 IGF1RP08069 1367 aa25.54■■□□□ 1.68
MFGE8-215ENST00000566497 CUL7Q14999 1698 aa25.53■■□□□ 1.68
MFGE8-215ENST00000566497 KIF21BO75037 1637 aa25.53■■□□□ 1.68
MFGE8-215ENST00000566497 GRIN2BQ13224 1484 aa25.53■■□□□ 1.68
MFGE8-215ENST00000566497 PRXQ9BXM0 1461 aa25.48■■□□□ 1.67
MFGE8-215ENST00000566497 GOLGA3Q08378 1498 aa25.44■■□□□ 1.66
MFGE8-215ENST00000566497 ADAMTS12P58397 1594 aa25.44■■□□□ 1.66
MFGE8-215ENST00000566497 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.43■■□□□ 1.66
MFGE8-215ENST00000566497 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.42■■□□□ 1.66
MFGE8-215ENST00000566497 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.41■■□□□ 1.66
MFGE8-215ENST00000566497 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.4■■□□□ 1.66
MFGE8-215ENST00000566497 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
MFGE8-215ENST00000566497 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.36■■□□□ 1.65
MFGE8-215ENST00000566497 SYNJ2O15056 1496 aa25.28■■□□□ 1.64
MFGE8-215ENST00000566497 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
MFGE8-215ENST00000566497 GRIN2AQ12879 1464 aa25.22■■□□□ 1.63
MFGE8-215ENST00000566497 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.21■■□□□ 1.63
MFGE8-215ENST00000566497 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.19■■□□□ 1.62
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