RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469356.3

SREBF1-208, Transcript of sterol regulatory element binding transcription factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene SREBF1, Length 1,323 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1-208ENST00000469356 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.37■■■■■ 6.29
SREBF1-208ENST00000469356 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.13■■■■■ 5.3
SREBF1-208ENST00000469356 ABCC9O60706 1549 aa46.45■■■■■ 5.03
SREBF1-208ENST00000469356 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.39■■■■■ 4.86
SREBF1-208ENST00000469356 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.29■■■■■ 4.84
SREBF1-208ENST00000469356 NACADO15069 1562 aa45.13■■■■■ 4.82
SREBF1-208ENST00000469356 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.06■■■■■ 4.8
SREBF1-208ENST00000469356 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.05■■■■■ 4.8
SREBF1-208ENST00000469356 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.05■■■■■ 4.8
SREBF1-208ENST00000469356 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.91■■■■■ 4.62
SREBF1-208ENST00000469356 SCRIBQ14160 1630 aa43.89■■■■■ 4.62
SREBF1-208ENST00000469356 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.51■■■■■ 4.56
SREBF1-208ENST00000469356 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.5■■■■■ 4.55
SREBF1-208ENST00000469356 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.29■■■■■ 4.52
SREBF1-208ENST00000469356 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.38
SREBF1-208ENST00000469356 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.2■■■■■ 4.35
SREBF1-208ENST00000469356 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.16■■■■■ 4.34
SREBF1-208ENST00000469356 SMARCA4P51532 1647 aa42.05■■■■■ 4.32
SREBF1-208ENST00000469356 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.05■■■■■ 4.32
SREBF1-208ENST00000469356 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42■■■■■ 4.31
SREBF1-208ENST00000469356 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.85■■■■■ 4.29
SREBF1-208ENST00000469356 SMARCA2P51531 1590 aa41.75■■■■■ 4.27
SREBF1-208ENST00000469356 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.68■■■■■ 4.26
SREBF1-208ENST00000469356 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.64■■■■■ 4.26
SREBF1-208ENST00000469356 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
SREBF1-208ENST00000469356 NCAPD3P42695 1498 aa41.6■■■■■ 4.25
SREBF1-208ENST00000469356 HMGXB3Q12766 1538 aa41.46■■■■■ 4.23
SREBF1-208ENST00000469356 WIZO95785 1651 aa41.45■■■■■ 4.23
SREBF1-208ENST00000469356 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
SREBF1-208ENST00000469356 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
SREBF1-208ENST00000469356 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
SREBF1-208ENST00000469356 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.59■■■■■ 4.09
SREBF1-208ENST00000469356 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.45■■■■■ 4.07
SREBF1-208ENST00000469356 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.44■■■■■ 4.07
SREBF1-208ENST00000469356 NESP48681 1621 aa40.32■■■■■ 4.04
SREBF1-208ENST00000469356 CFTRP13569 1480 aa40.29■■■■■ 4.04
SREBF1-208ENST00000469356 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.21■■■■■ 4.03
SREBF1-208ENST00000469356 ERCC6Q03468 1493 aa40.1■■■■■ 4.01
SREBF1-208ENST00000469356 PRDM2Q13029 1718 aa40.09■■■■■ 4.01
SREBF1-208ENST00000469356 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.95■■■■□ 3.99
SREBF1-208ENST00000469356 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.91■■■■□ 3.98
SREBF1-208ENST00000469356 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.88■■■■□ 3.97
SREBF1-208ENST00000469356 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.68■■■■□ 3.94
SREBF1-208ENST00000469356 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.6■■■■□ 3.93
SREBF1-208ENST00000469356 ABCC8Q09428 1581 aa39.54■■■■□ 3.92
SREBF1-208ENST00000469356 WDR62O43379 1518 aa39.49■■■■□ 3.91
SREBF1-208ENST00000469356 CUX2O14529 1486 aa39.45■■■■□ 3.91
SREBF1-208ENST00000469356 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.45■■■■□ 3.91
SREBF1-208ENST00000469356 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.39■■■■□ 3.9
SREBF1-208ENST00000469356 TOPBP1Q92547 1522 aa39.37■■■■□ 3.89
SREBF1-208ENST00000469356 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.29■■■■□ 3.88
SREBF1-208ENST00000469356 CUX1P39880 1505 aa39.24■■■■□ 3.87
SREBF1-208ENST00000469356 TOP2BQ02880 1626 aa39.12■■■■□ 3.85
SREBF1-208ENST00000469356 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.1■■■■□ 3.85
SREBF1-208ENST00000469356 SYNJ1O43426 1573 aa39.07■■■■□ 3.84
SREBF1-208ENST00000469356 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.06■■■■□ 3.84
SREBF1-208ENST00000469356 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
SREBF1-208ENST00000469356 IFT140Q96RY7 1462 aa39.04■■■■□ 3.84
SREBF1-208ENST00000469356 SOGA1O94964 1423 aa38.98■■■■□ 3.83
SREBF1-208ENST00000469356 TRIM41Q8WV44 630 aa38.86■■■■□ 3.81
SREBF1-208ENST00000469356 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.85■■■■□ 3.81
SREBF1-208ENST00000469356 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
SREBF1-208ENST00000469356 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.74■■■■□ 3.79
SREBF1-208ENST00000469356 WDR97A6NE52 1622 aa38.72■■■■□ 3.79
SREBF1-208ENST00000469356 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.67■■■■□ 3.78
SREBF1-208ENST00000469356 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.67■■■■□ 3.78
SREBF1-208ENST00000469356 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.77
SREBF1-208ENST00000469356 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
SREBF1-208ENST00000469356 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.59■■■■□ 3.771e-10■■■■■ 53.2
SREBF1-208ENST00000469356 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.52■■■■□ 3.76
SREBF1-208ENST00000469356 KIF27Q86VH2 1401 aa38.49■■■■□ 3.75
SREBF1-208ENST00000469356 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.48■■■■□ 3.75
SREBF1-208ENST00000469356 GRIN2BQ13224 1484 aa38.45■■■■□ 3.75
SREBF1-208ENST00000469356 PBRM1Q86U86 1689 aa38.37■■■■□ 3.73
SREBF1-208ENST00000469356 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.31■■■■□ 3.72
SREBF1-208ENST00000469356 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.3■■■■□ 3.72
SREBF1-208ENST00000469356 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.25■■■■□ 3.71
SREBF1-208ENST00000469356 EEA1Q15075 1411 aa38.19■■■■□ 3.7
SREBF1-208ENST00000469356 IGF1RP08069 1367 aa38.17■■■■□ 3.7
SREBF1-208ENST00000469356 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.14■■■■□ 3.7
SREBF1-208ENST00000469356 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.13■■■■□ 3.7
SREBF1-208ENST00000469356 FBLN2P98095 1184 aa38.12■■■■□ 3.69
SREBF1-208ENST00000469356 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.12■■■■□ 3.69
SREBF1-208ENST00000469356 SYNJ2O15056 1496 aa38.12■■■■□ 3.69
SREBF1-208ENST00000469356 CUL7Q14999 1698 aa38.1■■■■□ 3.69
SREBF1-208ENST00000469356 ADAMTS12P58397 1594 aa38.08■■■■□ 3.69
SREBF1-208ENST00000469356 CHD1O14646 1710 aa38.02■■■■□ 3.68
SREBF1-208ENST00000469356 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.01■■■■□ 3.68
SREBF1-208ENST00000469356 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.01■■■■□ 3.68
SREBF1-208ENST00000469356 OSCARQ8IYS5 282 aa37.98■■■■□ 3.67
SREBF1-208ENST00000469356 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.95■■■■□ 3.67
SREBF1-208ENST00000469356 GRIN2AQ12879 1464 aa37.92■■■■□ 3.66
SREBF1-208ENST00000469356 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.85■■■■□ 3.65
SREBF1-208ENST00000469356 PRXQ9BXM0 1461 aa37.8■■■■□ 3.64
SREBF1-208ENST00000469356 NUP160Q12769 1436 aa37.71■■■■□ 3.63
SREBF1-208ENST00000469356 CEP170Q5SW79 1584 aa37.65■■■■□ 3.62
SREBF1-208ENST00000469356 KIF21BO75037 1637 aa37.64■■■■□ 3.62
SREBF1-208ENST00000469356 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.59■■■■□ 3.61
SREBF1-208ENST00000469356 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.55■■■■□ 3.6
SREBF1-208ENST00000469356 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.52■■■■□ 3.6
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