Protein–RNA interactions for Protein: P63124

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P63124 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERV-K104P63124 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERV-K104P63124 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P63124 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P63124 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P63124 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P63124 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P63124 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P63124 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P63124 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P63124 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms