RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.52■■■■□ 3.44
PTPRM-211ENST00000580170 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
PTPRM-211ENST00000580170 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.43■■■■□ 3.1
PTPRM-211ENST00000580170 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.28■■■■□ 3.08
PTPRM-211ENST00000580170 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
PTPRM-211ENST00000580170 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.05■■■■□ 3.04
PTPRM-211ENST00000580170 APLP2Q06481 763 aa33.35■■■□□ 2.93
PTPRM-211ENST00000580170 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
PTPRM-211ENST00000580170 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.05■■■□□ 2.88
PTPRM-211ENST00000580170 MYT1Q01538 1121 aa32.98■■■□□ 2.87
PTPRM-211ENST00000580170 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
PTPRM-211ENST00000580170 ERICH6Q7L0X2 663 aa32.83■■■□□ 2.85
PTPRM-211ENST00000580170 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP32.7■■■□□ 2.82
PTPRM-211ENST00000580170 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
PTPRM-211ENST00000580170 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
PTPRM-211ENST00000580170 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.45■■■□□ 2.78
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM41Q8WV44 630 aa32.35■■■□□ 2.77
PTPRM-211ENST00000580170 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
PTPRM-211ENST00000580170 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.71
PTPRM-211ENST00000580170 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
PTPRM-211ENST00000580170 NEFLP07196 543 aa31.89■■■□□ 2.7
PTPRM-211ENST00000580170 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.66
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
PTPRM-211ENST00000580170 HRCP23327 699 aa31.34■■■□□ 2.61
PTPRM-211ENST00000580170 ITGAEP38570 1179 aa31.13■■■□□ 2.57
PTPRM-211ENST00000580170 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.07■■■□□ 2.56
PTPRM-211ENST00000580170 POLR3GLQ9BT43 218 aa31.01■■■□□ 2.56
PTPRM-211ENST00000580170 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
PTPRM-211ENST00000580170 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.54
PTPRM-211ENST00000580170 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.91■■■□□ 2.54
PTPRM-211ENST00000580170 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
PTPRM-211ENST00000580170 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.77■■■□□ 2.52
PTPRM-211ENST00000580170 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
PTPRM-211ENST00000580170 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
PTPRM-211ENST00000580170 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
PTPRM-211ENST00000580170 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
PTPRM-211ENST00000580170 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
PTPRM-211ENST00000580170 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.27■■■□□ 2.44
PTPRM-211ENST00000580170 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa30.16■■■□□ 2.42
PTPRM-211ENST00000580170 NEUROD1Q13562 356 aa30.15■■■□□ 2.42
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM52Q96A61 297 aa30.14■■■□□ 2.42
PTPRM-211ENST00000580170 BCANQ96GW7 911 aa30.12■■■□□ 2.41
PTPRM-211ENST00000580170 ANP32CO43423 234 aa29.95■■■□□ 2.38
PTPRM-211ENST00000580170 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
PTPRM-211ENST00000580170 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.74■■■□□ 2.35
PTPRM-211ENST00000580170 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
PTPRM-211ENST00000580170 ABCC9O60706 1549 aa29.59■■■□□ 2.33
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
PTPRM-211ENST00000580170 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
PTPRM-211ENST00000580170 CANXP27824 592 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
PTPRM-211ENST00000580170 BCL11AQ9H165 835 aa29.4■■■□□ 2.3
PTPRM-211ENST00000580170 P3H3Q8IVL6 736 aa29.39■■■□□ 2.3
PTPRM-211ENST00000580170 FBLN2P98095 1184 aa29.38■■■□□ 2.29
PTPRM-211ENST00000580170 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
PTPRM-211ENST00000580170 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.33■■■□□ 2.29
PTPRM-211ENST00000580170 ARID3CA6NKF2 412 aa29.31■■■□□ 2.28
PTPRM-211ENST00000580170 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa29.3■■■□□ 2.28
PTPRM-211ENST00000580170 SLC24A1O60721 1099 aa29.3■■■□□ 2.28
PTPRM-211ENST00000580170 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
PTPRM-211ENST00000580170 NEFMP07197 916 aa29.24■■■□□ 2.27
PTPRM-211ENST00000580170 FKBP8Q14318 412 aa29.2■■■□□ 2.27
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
PTPRM-211ENST00000580170 TONSLQ96HA7 1378 aa29.06■■■□□ 2.24
PTPRM-211ENST00000580170 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.24
PTPRM-211ENST00000580170 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.98■■■□□ 2.23
PTPRM-211ENST00000580170 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
PTPRM-211ENST00000580170 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.96■■■□□ 2.23
PTPRM-211ENST00000580170 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
PTPRM-211ENST00000580170 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
PTPRM-211ENST00000580170 NBR1Q14596 966 aa28.82■■■□□ 2.2
PTPRM-211ENST00000580170 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
PTPRM-211ENST00000580170 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
PTPRM-211ENST00000580170 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
PTPRM-211ENST00000580170 SCRIBQ14160 1630 aa28.76■■■□□ 2.19
PTPRM-211ENST00000580170 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.73■■■□□ 2.19
PTPRM-211ENST00000580170 TMC1Q8TDI8 760 aa28.69■■■□□ 2.18
PTPRM-211ENST00000580170 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.68■■■□□ 2.18
PTPRM-211ENST00000580170 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.62■■■□□ 2.17
PTPRM-211ENST00000580170 MIER1Q8N108 512 aa28.61■■■□□ 2.17
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
PTPRM-211ENST00000580170 MRS2Q9HD23 443 aa28.6■■■□□ 2.17
PTPRM-211ENST00000580170 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
PTPRM-211ENST00000580170 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.56■■■□□ 2.16
PTPRM-211ENST00000580170 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
PTPRM-211ENST00000580170 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.55■■■□□ 2.162e-6■■■□□ 15.5
PTPRM-211ENST00000580170 ARXQ96QS3 562 aa28.49■■■□□ 2.15
PTPRM-211ENST00000580170 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.49■■■□□ 2.15
PTPRM-211ENST00000580170 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
PTPRM-211ENST00000580170 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
PTPRM-211ENST00000580170 ANP32EQ9BTT0 268 aa28.44■■■□□ 2.14
PTPRM-211ENST00000580170 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRM-211ENST00000580170 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.38■■■□□ 2.13
PTPRM-211ENST00000580170 CLIP1P30622 1438 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRM-211ENST00000580170 TSPY4P0CV99 314 aa28.34■■■□□ 2.13
PTPRM-211ENST00000580170 TSPY10P0CW01 314 aa28.34■■■□□ 2.13
PTPRM-211ENST00000580170 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.33■■■□□ 2.13
PTPRM-211ENST00000580170 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.31■■■□□ 2.12
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