Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 PCBP2-225ENST00000553064 1786 ntTSL 513.24□□□□□ -0.297e-30■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 PCBP2-210ENST00000547859 1919 ntTSL 29.95□□□□□ -0.827e-30■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 PCBP2-211ENST00000547987 681 ntTSL 38.66□□□□□ -1.027e-30■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 PCBP2-214ENST00000549272 445 ntTSL 24.18□□□□□ -1.747e-30■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 CCNY-210ENST00000497692 478 ntTSL 211.33□□□□□ -0.62e-6■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 CCNY-205ENST00000465416 432 ntTSL 59.5□□□□□ -0.892e-6■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.057e-8■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.097e-8■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.147e-8■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.247e-8■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.277e-8■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SATB2-207ENST00000463386 372 ntTSL 410.9□□□□□ -0.667e-8■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.362e-6■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 AC009120.2-203ENST00000565313 539 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.012e-6■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 ST3GAL2-204ENST00000566097 904 ntTSL 227.41■■□□□ 1.985e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 ST3GAL2-205ENST00000567586 557 ntTSL 425.01■■□□□ 1.595e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.377e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.297e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 RYR1-206ENST00000594335 6263 ntTSL 1 (best)16.57■□□□□ 0.247e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.147e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 RYR1-208ENST00000599547 2200 ntTSL 215.47■□□□□ 0.077e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.017e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 GBGT1-205ENST00000470431 2870 ntTSL 1 (best)13.93□□□□□ -0.187e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 GBGT1-206ENST00000472281 2948 ntTSL 213.33□□□□□ -0.277e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.537e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 IGFL2-AS1-201ENST00000594027 294 ntTSL 310.79□□□□□ -0.687e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 RYR1-201ENST00000355481 15377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.77e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 IGFL2-AS1-203ENST00000598518 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.767e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.341e-8■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 RPS29-207ENST00000557367 499 ntTSL 213.4□□□□□ -0.261e-8■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.341e-8■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 GATAD2A-210ENST00000457895 729 ntTSL 221.64■■□□□ 1.051e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 GATAD2A-212ENST00000494516 640 ntTSL 220.17■□□□□ 0.821e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 GATAD2A-204ENST00000417582 655 ntTSL 219.8■□□□□ 0.761e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 GATAD2A-213ENST00000609040 1652 ntTSL 218.38■□□□□ 0.531e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 GATAD2A-207ENST00000432704 570 ntTSL 418.03■□□□□ 0.481e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.261e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.321e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 QRICH1-205ENST00000430979 583 ntTSL 427.82■■■□□ 2.043e-6■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 QRICH1-206ENST00000437939 510 ntTSL 526.42■■□□□ 1.823e-6■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 QRICH1-203ENST00000411682 359 ntTSL 54.53□□□□□ -1.683e-6■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 QRICH1-207ENST00000450685 426 ntTSL 23.63□□□□□ -1.833e-6■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 UBE2D2-207ENST00000511691 543 ntTSL 25.88□□□□□ -1.477e-11■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.87e-11■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 MDM2-216ENST00000471946 251 ntTSL 33.8□□□□□ -1.84e-29■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.955e-6■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 FOXK2-204ENST00000527313 779 ntTSL 320.12■□□□□ 0.815e-6■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 FOXK2-202ENST00000473637 3462 ntTSL 1 (best)18.77■□□□□ 0.65e-6■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 FOXK2-207ENST00000570585 756 ntTSL 313.76□□□□□ -0.215e-6■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SRPK2-214ENST00000489828 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.113e-6■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.229e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.879e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.189e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 CNN3-203ENST00000415017 792 ntTSL 212.99□□□□□ -0.339e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 CNN3-205ENST00000474409 544 ntTSL 38.18□□□□□ -1.19e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 AL137230.2-201ENST00000555070 452 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.073e-6■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 ARF1-209ENST00000478424 1059 ntTSL 224.86■■□□□ 1.574e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 SAMD4B-212ENST00000602243 672 ntTSL 324.78■■□□□ 1.564e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 ARF1-208ENST00000478336 930 ntTSL 223.74■■□□□ 1.394e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.14e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.924e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 ARF1-206ENST00000473949 578 ntTSL 520.73■□□□□ 0.914e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.794e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.754e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.324e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 ARF1-207ENST00000477451 789 ntTSL 516.72■□□□□ 0.274e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 SLC25A42-204ENST00000597661 519 ntTSL 316.22■□□□□ 0.194e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 NDUFV3-204ENST00000460740 811 ntTSL 216.16■□□□□ 0.184e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 ARF1-202ENST00000469235 678 ntTSL 315.65■□□□□ 0.14e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 ARF1-203ENST00000470558 820 ntTSL 215.49■□□□□ 0.074e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 ARF1-210ENST00000482962 597 ntTSL 314.87□□□□□ -0.034e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 ARF1-204ENST00000470670 712 ntTSL 314.3□□□□□ -0.124e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 NDUFV3-203ENST00000460259 2029 ntTSL 213.9□□□□□ -0.184e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.284e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 ARF1-205ENST00000473546 291 ntTSL 213.12□□□□□ -0.314e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 SAMD4B-209ENST00000599712 925 ntTSL 412.85□□□□□ -0.354e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 ACAA1-213ENST00000465181 656 ntTSL 312.57□□□□□ -0.44e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 ZNF609-204ENST00000559364 1321 ntTSL 1 (best)11.49□□□□□ -0.574e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 ARF1-201ENST00000272102 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.714e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 SAMD4B-213ENST00000610417 3664 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.794e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 SAMD4B-214ENST00000611159 3662 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.874e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.258e-8■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 HMGA2-208ENST00000537429 1527 ntTSL 1 (best)23.79■■□□□ 1.43e-10■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.063e-10■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 FOXN3-203ENST00000553353 366 ntTSL 33.21□□□□□ -1.93e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 ZCCHC14-204ENST00000568020 6242 ntTSL 1 (best)12.6□□□□□ -0.399e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.449e-7■■□□□ 13.1
ILF3Q12906 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.151e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.241e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.51e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 CCDC88A-202ENST00000336838 9505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.821e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 CCDC88A-203ENST00000412148 2880 ntTSL 1 (best)5.34□□□□□ -1.551e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 CCDC88A-209ENST00000456975 2208 ntTSL 24.65□□□□□ -1.671e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 CCDC88A-205ENST00000426576 4500 ntTSL 1 (best)2.91□□□□□ -1.941e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 CCDC88A-208ENST00000444458 4236 ntTSL 21.99□□□□□ -2.091e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.842e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 FOXN3-211ENST00000555855 851 ntTSL 519.47■□□□□ 0.712e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.012e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 UBAP2-207ENST00000421278 833 ntTSL 54.71□□□□□ -1.661e-8■■□□□ 13
ILF3Q12906 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.812e-7■■□□□ 13
Retrieved 100 of 15,265 protein–RNA pairs in 175.9 ms