RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478336.5

ARF1-208, Transcript of ADP ribosylation factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARF1, Length 930 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1-208ENST00000478336 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.34■■■■■ 6.93
ARF1-208ENST00000478336 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.88■■■■■ 5.9
ARF1-208ENST00000478336 ABCC9O60706 1549 aa50.62■■■■■ 5.69
ARF1-208ENST00000478336 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.75■■■■■ 5.39
ARF1-208ENST00000478336 NACADO15069 1562 aa48.73■■■■■ 5.39
ARF1-208ENST00000478336 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.65■■■■■ 5.38
ARF1-208ENST00000478336 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.54■■■■■ 5.36
ARF1-208ENST00000478336 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.49■■■■■ 5.35
ARF1-208ENST00000478336 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.31■■■■■ 5.32
ARF1-208ENST00000478336 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.69■■■■■ 5.22
ARF1-208ENST00000478336 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.32■■■■■ 5.17
ARF1-208ENST00000478336 SCRIBQ14160 1630 aa47.29■■■■■ 5.16
ARF1-208ENST00000478336 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.26■■■■■ 5.16
ARF1-208ENST00000478336 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.83■■■■■ 5.09
ARF1-208ENST00000478336 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.39■■■■■ 5.02
ARF1-208ENST00000478336 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.04■■■■■ 4.96
ARF1-208ENST00000478336 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.82■■■■■ 4.93
ARF1-208ENST00000478336 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.49■■■■■ 4.87
ARF1-208ENST00000478336 SMARCA4P51532 1647 aa45.26■■■■■ 4.84
ARF1-208ENST00000478336 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.21■■■■■ 4.83
ARF1-208ENST00000478336 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.99■■■■■ 4.79
ARF1-208ENST00000478336 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.96■■■■■ 4.79
ARF1-208ENST00000478336 NCAPD3P42695 1498 aa44.96■■■■■ 4.79
ARF1-208ENST00000478336 SMARCA2P51531 1590 aa44.94■■■■■ 4.78
ARF1-208ENST00000478336 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.86■■■■■ 4.77
ARF1-208ENST00000478336 HMGXB3Q12766 1538 aa44.77■■■■■ 4.76
ARF1-208ENST00000478336 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.6■■■■■ 4.73
ARF1-208ENST00000478336 WIZO95785 1651 aa44.47■■■■■ 4.71
ARF1-208ENST00000478336 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.46■■■■■ 4.71
ARF1-208ENST00000478336 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
ARF1-208ENST00000478336 NESP48681 1621 aa43.84■■■■■ 4.61
ARF1-208ENST00000478336 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.76■■■■■ 4.6
ARF1-208ENST00000478336 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.62■■■■■ 4.57
ARF1-208ENST00000478336 ERCC6Q03468 1493 aa43.6■■■■■ 4.57
ARF1-208ENST00000478336 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.47■■■■■ 4.55
ARF1-208ENST00000478336 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.42■■■■■ 4.54
ARF1-208ENST00000478336 CFTRP13569 1480 aa43.4■■■■■ 4.54
ARF1-208ENST00000478336 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.36■■■■■ 4.53
ARF1-208ENST00000478336 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
ARF1-208ENST00000478336 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
ARF1-208ENST00000478336 CUX2O14529 1486 aa43.17■■■■■ 4.5
ARF1-208ENST00000478336 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.13■■■■■ 4.49
ARF1-208ENST00000478336 PRDM2Q13029 1718 aa43.12■■■■■ 4.49
ARF1-208ENST00000478336 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.07■■■■■ 4.49
ARF1-208ENST00000478336 MRC2Q9UBG0 1479 aa43■■■■■ 4.47
ARF1-208ENST00000478336 WDR62O43379 1518 aa42.9■■■■■ 4.46
ARF1-208ENST00000478336 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.71■■■■■ 4.43
ARF1-208ENST00000478336 TOPBP1Q92547 1522 aa42.46■■■■■ 4.39
ARF1-208ENST00000478336 ABCC8Q09428 1581 aa42.44■■■■■ 4.39
ARF1-208ENST00000478336 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.44■■■■■ 4.38
ARF1-208ENST00000478336 CUX1P39880 1505 aa42.18■■■■■ 4.34
ARF1-208ENST00000478336 IFT140Q96RY7 1462 aa42.17■■■■■ 4.34
ARF1-208ENST00000478336 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
ARF1-208ENST00000478336 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.02■■■■■ 4.32
ARF1-208ENST00000478336 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
ARF1-208ENST00000478336 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
ARF1-208ENST00000478336 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.91■■■■■ 4.3
ARF1-208ENST00000478336 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.91■■■■■ 4.3
ARF1-208ENST00000478336 SOGA1O94964 1423 aa41.89■■■■■ 4.3
ARF1-208ENST00000478336 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.85■■■■■ 4.29
ARF1-208ENST00000478336 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
ARF1-208ENST00000478336 SYNJ1O43426 1573 aa41.84■■■■■ 4.29
ARF1-208ENST00000478336 TOP2BQ02880 1626 aa41.84■■■■■ 4.29
ARF1-208ENST00000478336 WDR97A6NE52 1622 aa41.72■■■■■ 4.27
ARF1-208ENST00000478336 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.72■■■■■ 4.275e-7■■■■□ 21.3
ARF1-208ENST00000478336 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.71■■■■■ 4.27
ARF1-208ENST00000478336 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
ARF1-208ENST00000478336 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.63■■■■■ 4.25
ARF1-208ENST00000478336 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.48■■■■■ 4.23
ARF1-208ENST00000478336 GRIN2BQ13224 1484 aa41.42■■■■■ 4.22
ARF1-208ENST00000478336 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.42■■■■■ 4.22
ARF1-208ENST00000478336 PBRM1Q86U86 1689 aa41.38■■■■■ 4.21
ARF1-208ENST00000478336 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.36■■■■■ 4.21
ARF1-208ENST00000478336 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
ARF1-208ENST00000478336 OSCARQ8IYS5 282 aa41.31■■■■■ 4.2
ARF1-208ENST00000478336 CHD1O14646 1710 aa41.3■■■■■ 4.2
ARF1-208ENST00000478336 SYNJ2O15056 1496 aa41.15■■■■■ 4.18
ARF1-208ENST00000478336 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.13■■■■■ 4.17
ARF1-208ENST00000478336 FBLN2P98095 1184 aa41.12■■■■■ 4.17
ARF1-208ENST00000478336 ADAMTS12P58397 1594 aa41.08■■■■■ 4.17
ARF1-208ENST00000478336 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
ARF1-208ENST00000478336 KIF27Q86VH2 1401 aa41.01■■■■■ 4.16
ARF1-208ENST00000478336 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.96■■■■■ 4.15
ARF1-208ENST00000478336 GRIN2AQ12879 1464 aa40.9■■■■■ 4.14
ARF1-208ENST00000478336 TRIM41Q8WV44 630 aa40.88■■■■■ 4.13
ARF1-208ENST00000478336 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.88■■■■■ 4.13
ARF1-208ENST00000478336 IGF1RP08069 1367 aa40.84■■■■■ 4.13
ARF1-208ENST00000478336 CUL7Q14999 1698 aa40.77■■■■■ 4.12
ARF1-208ENST00000478336 NUP160Q12769 1436 aa40.74■■■■■ 4.11
ARF1-208ENST00000478336 ARHGEF11O15085 1522 aa40.72■■■■■ 4.11
ARF1-208ENST00000478336 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.72■■■■■ 4.11
ARF1-208ENST00000478336 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.72■■■■■ 4.11
ARF1-208ENST00000478336 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.72■■■■■ 4.11
ARF1-208ENST00000478336 CEP170Q5SW79 1584 aa40.72■■■■■ 4.11
ARF1-208ENST00000478336 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.67■■■■■ 4.1
ARF1-208ENST00000478336 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.59■■■■■ 4.09
ARF1-208ENST00000478336 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.46■■■■■ 4.07
ARF1-208ENST00000478336 SHROOM2Q13796 1616 aa40.45■■■■■ 4.07
ARF1-208ENST00000478336 ARAP1Q96P48 1450 aa40.41■■■■■ 4.06
ARF1-208ENST00000478336 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.37■■■■■ 4.05
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