RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602243.5

SAMD4B-212, Transcript of sterile alpha motif domain containing 4B, humanhuman

TSL 3

Gene SAMD4B, Length 672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4B-212ENST00000602243 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.91■■■■■ 7.66
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SAMD4B-212ENST00000602243 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.19■■■■■ 6.27
SAMD4B-212ENST00000602243 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.05■■■■■ 6.24
SAMD4B-212ENST00000602243 NACADO15069 1562 aa53.7■■■■■ 6.19
SAMD4B-212ENST00000602243 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.25■■■■■ 6.11
SAMD4B-212ENST00000602243 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.12■■■■■ 6.09
SAMD4B-212ENST00000602243 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53■■■■■ 6.07
SAMD4B-212ENST00000602243 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.8■■■■■ 6.04
SAMD4B-212ENST00000602243 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.65■■■■■ 6.02
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SAMD4B-212ENST00000602243 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.62■■■■■ 5.85
SAMD4B-212ENST00000602243 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.55■■■■■ 5.84
SAMD4B-212ENST00000602243 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.4■■■■■ 5.82
SAMD4B-212ENST00000602243 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50■■■■■ 5.59
SAMD4B-212ENST00000602243 NCAPD3P42695 1498 aa49.57■■■■■ 5.53
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SAMD4B-212ENST00000602243 ERCC6Q03468 1493 aa49.39■■■■■ 5.5
SAMD4B-212ENST00000602243 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.36■■■■■ 5.49
SAMD4B-212ENST00000602243 SMARCA2P51531 1590 aa49.2■■■■■ 5.47
SAMD4B-212ENST00000602243 SMARCA4P51532 1647 aa49.2■■■■■ 5.47
SAMD4B-212ENST00000602243 HMGXB3Q12766 1538 aa49.19■■■■■ 5.46
SAMD4B-212ENST00000602243 NESP48681 1621 aa48.97■■■■■ 5.43
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SAMD4B-212ENST00000602243 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.6■■■■■ 5.37
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SAMD4B-212ENST00000602243 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.47■■■■■ 5.35
SAMD4B-212ENST00000602243 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.34■■■■■ 5.33
SAMD4B-212ENST00000602243 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.27■■■■■ 5.32
SAMD4B-212ENST00000602243 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.03■■■■■ 5.28
SAMD4B-212ENST00000602243 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.91■■■■■ 5.26
SAMD4B-212ENST00000602243 WIZO95785 1651 aa47.87■■■■■ 5.25
SAMD4B-212ENST00000602243 WDR62O43379 1518 aa47.81■■■■■ 5.24
SAMD4B-212ENST00000602243 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.61■■■■■ 5.21
SAMD4B-212ENST00000602243 TRIM41Q8WV44 630 aa47.59■■■■■ 5.21
SAMD4B-212ENST00000602243 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.51■■■■■ 5.2
SAMD4B-212ENST00000602243 CFTRP13569 1480 aa47.4■■■■■ 5.18
SAMD4B-212ENST00000602243 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.27■■■■■ 5.16
SAMD4B-212ENST00000602243 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.24■■■■■ 5.15
SAMD4B-212ENST00000602243 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.16■■■■■ 5.14
SAMD4B-212ENST00000602243 OSCARQ8IYS5 282 aa47.1■■■■■ 5.13
SAMD4B-212ENST00000602243 PRDM2Q13029 1718 aa46.91■■■■■ 5.1
SAMD4B-212ENST00000602243 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.69■■■■■ 5.06
SAMD4B-212ENST00000602243 IFT140Q96RY7 1462 aa46.67■■■■■ 5.06
SAMD4B-212ENST00000602243 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.65■■■■■ 5.06
SAMD4B-212ENST00000602243 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.59■■■■■ 5.05
SAMD4B-212ENST00000602243 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.59■■■■■ 5.05
SAMD4B-212ENST00000602243 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.59■■■■■ 5.05
SAMD4B-212ENST00000602243 TOPBP1Q92547 1522 aa46.56■■■■■ 5.04
SAMD4B-212ENST00000602243 ABCC8Q09428 1581 aa46.4■■■■■ 5.02
SAMD4B-212ENST00000602243 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.39■■■■■ 5.02
SAMD4B-212ENST00000602243 ARHGEF11O15085 1522 aa46.39■■■■■ 5.02
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SAMD4B-212ENST00000602243 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.03■■■■■ 4.96
SAMD4B-212ENST00000602243 FBLN2P98095 1184 aa45.92■■■■■ 4.94
SAMD4B-212ENST00000602243 ARAP1Q96P48 1450 aa45.91■■■■■ 4.94
SAMD4B-212ENST00000602243 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.88■■■■■ 4.94
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SAMD4B-212ENST00000602243 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.79■■■■■ 4.92
SAMD4B-212ENST00000602243 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.69■■■■■ 4.91
SAMD4B-212ENST00000602243 WDR97A6NE52 1622 aa45.69■■■■■ 4.9
SAMD4B-212ENST00000602243 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.68■■■■■ 4.9
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SAMD4B-212ENST00000602243 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.6■■■■■ 4.89
SAMD4B-212ENST00000602243 CUX1P39880 1505 aa45.57■■■■■ 4.89
SAMD4B-212ENST00000602243 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.55■■■■■ 4.88
SAMD4B-212ENST00000602243 SYNJ1O43426 1573 aa45.51■■■■■ 4.88
SAMD4B-212ENST00000602243 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.51■■■■■ 4.88
SAMD4B-212ENST00000602243 GRIN2BQ13224 1484 aa45.49■■■■■ 4.87
SAMD4B-212ENST00000602243 SYNJ2O15056 1496 aa45.4■■■■■ 4.86
SAMD4B-212ENST00000602243 PBRM1Q86U86 1689 aa45.29■■■■■ 4.84
SAMD4B-212ENST00000602243 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.26■■■■■ 4.84
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SAMD4B-212ENST00000602243 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.14■■■■■ 4.82
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SAMD4B-212ENST00000602243 CEP170Q5SW79 1584 aa44.78■■■■■ 4.76
SAMD4B-212ENST00000602243 NUP160Q12769 1436 aa44.78■■■■■ 4.76
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SAMD4B-212ENST00000602243 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.66■■■■■ 4.74
SAMD4B-212ENST00000602243 SHROOM2Q13796 1616 aa44.65■■■■■ 4.74
SAMD4B-212ENST00000602243 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.56■■■■■ 4.72
SAMD4B-212ENST00000602243 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.37■■■■■ 4.69
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SAMD4B-212ENST00000602243 JPH4Q96JJ6 628 aa44.28■■■■■ 4.68
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