RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478424.5

ARF1-209, Transcript of ADP ribosylation factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARF1, Length 1,059 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1-209ENST00000478424 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.79■■■■■ 7.48
ARF1-209ENST00000478424 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.34■■■■■ 6.45
ARF1-209ENST00000478424 ABCC9O60706 1549 aa55.29■■■■■ 6.44
ARF1-209ENST00000478424 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.63■■■■■ 6.02
ARF1-209ENST00000478424 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.31■■■■■ 5.96
ARF1-209ENST00000478424 NACADO15069 1562 aa52.26■■■■■ 5.96
ARF1-209ENST00000478424 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.54■■■■■ 5.84
ARF1-209ENST00000478424 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.53■■■■■ 5.84
ARF1-209ENST00000478424 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.51■■■■■ 5.84
ARF1-209ENST00000478424 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.41■■■■■ 5.82
ARF1-209ENST00000478424 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.27■■■■■ 5.8
ARF1-209ENST00000478424 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.02■■■■■ 5.76
ARF1-209ENST00000478424 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.96■■■■■ 5.75
ARF1-209ENST00000478424 SCRIBQ14160 1630 aa50.62■■■■■ 5.69
ARF1-209ENST00000478424 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.31■■■■■ 5.64
ARF1-209ENST00000478424 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.88■■■■■ 5.58
ARF1-209ENST00000478424 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.81■■■■■ 5.56
ARF1-209ENST00000478424 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.73■■■■■ 5.55
ARF1-209ENST00000478424 NCAPD3P42695 1498 aa48.21■■■■■ 5.31
ARF1-209ENST00000478424 SMARCA4P51532 1647 aa48.2■■■■■ 5.31
ARF1-209ENST00000478424 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.16■■■■■ 5.3
ARF1-209ENST00000478424 SMARCA2P51531 1590 aa48.05■■■■■ 5.28
ARF1-209ENST00000478424 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.99■■■■■ 5.27
ARF1-209ENST00000478424 HMGXB3Q12766 1538 aa47.92■■■■■ 5.26
ARF1-209ENST00000478424 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.78■■■■■ 5.24
ARF1-209ENST00000478424 ERCC6Q03468 1493 aa47.77■■■■■ 5.24
ARF1-209ENST00000478424 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.66■■■■■ 5.22
ARF1-209ENST00000478424 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.61■■■■■ 5.21
ARF1-209ENST00000478424 NESP48681 1621 aa47.52■■■■■ 5.2
ARF1-209ENST00000478424 CUX2O14529 1486 aa47.45■■■■■ 5.19
ARF1-209ENST00000478424 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.15■■■■■ 5.14
ARF1-209ENST00000478424 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.14■■■■■ 5.14
ARF1-209ENST00000478424 WIZO95785 1651 aa47.13■■■■■ 5.14
ARF1-209ENST00000478424 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.94■■■■■ 5.11
ARF1-209ENST00000478424 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.91■■■■■ 5.1
ARF1-209ENST00000478424 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.9■■■■■ 5.1
ARF1-209ENST00000478424 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.83■■■■■ 5.09
ARF1-209ENST00000478424 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.73■■■■■ 5.07
ARF1-209ENST00000478424 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.53■■■■■ 5.04
ARF1-209ENST00000478424 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.51■■■■■ 5.04
ARF1-209ENST00000478424 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.39■■■■■ 5.02
ARF1-209ENST00000478424 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.35■■■■■ 5.01
ARF1-209ENST00000478424 WDR62O43379 1518 aa46.34■■■■■ 5.01
ARF1-209ENST00000478424 CFTRP13569 1480 aa46.31■■■■■ 5
ARF1-209ENST00000478424 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.99■■■■■ 4.95
ARF1-209ENST00000478424 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
ARF1-209ENST00000478424 PRDM2Q13029 1718 aa45.89■■■■■ 4.94
ARF1-209ENST00000478424 TOPBP1Q92547 1522 aa45.48■■■■■ 4.87
ARF1-209ENST00000478424 IFT140Q96RY7 1462 aa45.42■■■■■ 4.86
ARF1-209ENST00000478424 TRIM41Q8WV44 630 aa45.4■■■■■ 4.86
ARF1-209ENST00000478424 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.36■■■■■ 4.85
ARF1-209ENST00000478424 OSCARQ8IYS5 282 aa45.35■■■■■ 4.85
ARF1-209ENST00000478424 ABCC8Q09428 1581 aa45.33■■■■■ 4.85
ARF1-209ENST00000478424 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.33■■■■■ 4.85
ARF1-209ENST00000478424 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.12■■■■■ 4.81
ARF1-209ENST00000478424 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.04■■■■■ 4.8
ARF1-209ENST00000478424 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.03■■■■■ 4.8
ARF1-209ENST00000478424 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
ARF1-209ENST00000478424 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.98■■■■■ 4.795e-7■■■■□ 21.3
ARF1-209ENST00000478424 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.91■■■■■ 4.78
ARF1-209ENST00000478424 SOGA1O94964 1423 aa44.84■■■■■ 4.77
ARF1-209ENST00000478424 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.81■■■■■ 4.76
ARF1-209ENST00000478424 CUX1P39880 1505 aa44.78■■■■■ 4.76
ARF1-209ENST00000478424 FBLN2P98095 1184 aa44.77■■■■■ 4.76
ARF1-209ENST00000478424 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.76■■■■■ 4.76
ARF1-209ENST00000478424 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.76■■■■■ 4.76
ARF1-209ENST00000478424 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.76■■■■■ 4.76
ARF1-209ENST00000478424 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.76■■■■■ 4.76
ARF1-209ENST00000478424 CHD1O14646 1710 aa44.75■■■■■ 4.75
ARF1-209ENST00000478424 ARHGEF11O15085 1522 aa44.65■■■■■ 4.74
ARF1-209ENST00000478424 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.56■■■■■ 4.72
ARF1-209ENST00000478424 WDR97A6NE52 1622 aa44.53■■■■■ 4.72
ARF1-209ENST00000478424 GRIN2BQ13224 1484 aa44.42■■■■■ 4.7
ARF1-209ENST00000478424 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.39■■■■■ 4.7
ARF1-209ENST00000478424 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.38■■■■■ 4.69
ARF1-209ENST00000478424 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.35■■■■■ 4.69
ARF1-209ENST00000478424 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.3■■■■■ 4.68
ARF1-209ENST00000478424 PBRM1Q86U86 1689 aa44.29■■■■■ 4.68
ARF1-209ENST00000478424 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.25■■■■■ 4.67
ARF1-209ENST00000478424 SYNJ1O43426 1573 aa44.24■■■■■ 4.67
ARF1-209ENST00000478424 SYNJ2O15056 1496 aa44.23■■■■■ 4.67
ARF1-209ENST00000478424 ARAP1Q96P48 1450 aa44.23■■■■■ 4.67
ARF1-209ENST00000478424 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.18■■■■■ 4.66
ARF1-209ENST00000478424 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.17■■■■■ 4.66
ARF1-209ENST00000478424 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.16■■■■■ 4.666e-7■■■■■ 33.4
ARF1-209ENST00000478424 TOP2BQ02880 1626 aa44.1■■■■■ 4.65
ARF1-209ENST00000478424 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.08■■■■■ 4.65
ARF1-209ENST00000478424 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.88■■■■■ 4.62
ARF1-209ENST00000478424 ADAMTS12P58397 1594 aa43.88■■■■■ 4.61
ARF1-209ENST00000478424 GRIN2AQ12879 1464 aa43.85■■■■■ 4.61
ARF1-209ENST00000478424 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.73■■■■■ 4.59
ARF1-209ENST00000478424 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.69■■■■■ 4.59
ARF1-209ENST00000478424 CEP170Q5SW79 1584 aa43.69■■■■■ 4.58
ARF1-209ENST00000478424 NUP160Q12769 1436 aa43.65■■■■■ 4.58
ARF1-209ENST00000478424 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.57■■■■■ 4.57
ARF1-209ENST00000478424 SHROOM2Q13796 1616 aa43.4■■■■■ 4.54
ARF1-209ENST00000478424 KIF27Q86VH2 1401 aa43.29■■■■■ 4.52
ARF1-209ENST00000478424 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.29■■■■■ 4.52
ARF1-209ENST00000478424 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.24■■■■■ 4.51
ARF1-209ENST00000478424 JPH4Q96JJ6 628 aa43.23■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms