RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.41■■■■■ 4.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCC9O60706 1549 aa39.07■■■■□ 3.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.38■■■■□ 3.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.28■■■■□ 3.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.92■■■■□ 3.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NACADO15069 1562 aa36.5■■■■□ 3.43
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.26■■■■□ 3.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.13■■■■□ 3.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.94■■■■□ 3.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.8■■■■□ 3.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.79■■■■□ 3.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.39■■■■□ 3.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.31■■■■□ 3.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.25■■■■□ 3.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.04■■■■□ 3.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.88■■■■□ 3.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCRIBQ14160 1630 aa34.86■■■■□ 3.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CUX2O14529 1486 aa34.07■■■■□ 3.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERCC6Q03468 1493 aa33.85■■■■□ 3.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NCAPD3P42695 1498 aa33.71■■■□□ 2.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.47■■■□□ 2.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HMGXB3Q12766 1538 aa33.38■■■□□ 2.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMARCA2P51531 1590 aa33.37■■■□□ 2.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NESP48681 1621 aa33.32■■■□□ 2.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMARCA4P51532 1647 aa33.21■■■□□ 2.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.15■■■□□ 2.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.12■■■□□ 2.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.06■■■□□ 2.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRIM41Q8WV44 630 aa33■■■□□ 2.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33■■■□□ 2.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.94■■■□□ 2.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.94■■■□□ 2.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.85■■■□□ 2.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.65■■■□□ 2.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.65■■■□□ 2.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.63■■■□□ 2.81
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WDR62O43379 1518 aa32.57■■■□□ 2.8
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OSCARQ8IYS5 282 aa32.4■■■□□ 2.78
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.37■■■□□ 2.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.26■■■□□ 2.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WIZO95785 1651 aa32.17■■■□□ 2.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CFTRP13569 1480 aa32.11■■■□□ 2.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.96■■■□□ 2.71
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.96■■■□□ 2.71
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.96■■■□□ 2.71
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGEF11O15085 1522 aa31.81■■■□□ 2.68
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFT140Q96RY7 1462 aa31.77■■■□□ 2.68
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.65■■■□□ 2.66
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRDM2Q13029 1718 aa31.63■■■□□ 2.65
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TOPBP1Q92547 1522 aa31.54■■■□□ 2.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCC8Q09428 1581 aa31.51■■■□□ 2.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARAP1Q96P48 1450 aa31.43■■■□□ 2.62
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.41■■■□□ 2.62
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.37■■■□□ 2.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHD1O14646 1710 aa31.37■■■□□ 2.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.36■■■□□ 2.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBLN2P98095 1184 aa31.34■■■□□ 2.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SOGA1O94964 1423 aa31.06■■■□□ 2.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.05■■■□□ 2.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.04■■■□□ 2.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.02■■■□□ 2.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WDR97A6NE52 1622 aa31.02■■■□□ 2.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SYNJ1O43426 1573 aa31.01■■■□□ 2.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GRIN2BQ13224 1484 aa30.89■■■□□ 2.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.87■■■□□ 2.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SYNJ2O15056 1496 aa30.86■■■□□ 2.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.81■■■□□ 2.52
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CUX1P39880 1505 aa30.7■■■□□ 2.51
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PBRM1Q86U86 1689 aa30.61■■■□□ 2.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.51■■■□□ 2.47
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.48■■■□□ 2.47
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GRIN2AQ12879 1464 aa30.46■■■□□ 2.47
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.45■■■□□ 2.47
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEP170Q5SW79 1584 aa30.41■■■□□ 2.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUP160Q12769 1436 aa30.39■■■□□ 2.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADAMTS12P58397 1594 aa30.32■■■□□ 2.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SHROOM2Q13796 1616 aa30.31■■■□□ 2.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.27■■■□□ 2.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.26■■■□□ 2.43
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.26■■■□□ 2.43
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.13■■■□□ 2.41
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.12■■■□□ 2.41
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.12■■■□□ 2.41
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.11■■■□□ 2.41
RFX3-AS1-201ENST00000423112 JPH4Q96JJ6 628 aa30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.1 ms