Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE1CQ14123 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE1CQ14123 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE1CQ14123 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE1CQ14123 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
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