Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 SLC16A1-AS1-205ENST00000435800 1194 ntTSL 315.4■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SLC16A1-AS1-203ENST00000420168 900 ntTSL 211.87□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SLC16A1-AS1-207ENST00000627431 1073 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SLC16A1-AS1-204ENST00000428411 8757 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 CDHR3-207ENST00000470188 2199 ntTSL 218.72■□□□□ 0.591e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 CDHR3-213ENST00000488386 540 ntTSL 34.39□□□□□ -1.711e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SEC22A-210ENST00000492595 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.385e-8■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.525e-8■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.595e-8■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SEC22A-204ENST00000473494 1011 ntTSL 34.72□□□□□ -1.655e-8■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 ZNF184-201ENST00000211936 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.949e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.469e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 GTDC1-215ENST00000482601 642 ntTSL 58.42□□□□□ -1.064e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.454e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.464e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.474e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.614e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.654e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.74e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 GTDC1-214ENST00000476958 570 ntTSL 44.42□□□□□ -1.74e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 GTDC1-218ENST00000491448 2456 ntTSL 54.19□□□□□ -1.744e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 GTDC1-205ENST00000392871 2352 ntTSL 24□□□□□ -1.774e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 GTDC1-208ENST00000415569 2780 ntTSL 53.94□□□□□ -1.784e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.794e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SUPT6H-202ENST00000347486 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.046e-8■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.186e-8■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.387e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 APBA2-209ENST00000559709 594 ntTSL 418.36■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 APBA2-210ENST00000559814 2555 ntTSL 1 (best)17.96■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 APBA2-211ENST00000560283 711 ntTSL 313.72□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 APBA2-204ENST00000558259 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 APBA2-208ENST00000558804 535 ntTSL 49.52□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 NCALD-204ENST00000517531 629 ntTSL 420.83■□□□□ 0.933e-6■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 HOOK3-204ENST00000527306 2325 ntTSL 1 (best)19.78■□□□□ 0.769e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 CDC42EP4-205ENST00000580315 1022 ntTSL 219.04■□□□□ 0.649e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.619e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 ABCA2-221ENST00000492260 2062 ntTSL 517.62■□□□□ 0.412e-11■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.49e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MKL1-208ENST00000466278 577 ntTSL 317.26■□□□□ 0.359e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 RELT-206ENST00000545687 586 ntTSL 417.08■□□□□ 0.329e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.319e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 RELT-205ENST00000544075 744 ntTSL 316.98■□□□□ 0.319e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.39e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 NCALD-219ENST00000521964 565 ntTSL 216.13■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 ABCA2-222ENST00000494046 1622 ntTSL 516.04■□□□□ 0.162e-11■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 GPATCH2L-205ENST00000554375 1791 ntTSL 515.97■□□□□ 0.154e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.149e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 ZNF292-208ENST00000518845 277 ntTSL 315.85■□□□□ 0.131e-9■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 UBE2G1-203ENST00000571980 984 ntTSL 515.6■□□□□ 0.099e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 UBE2G1-206ENST00000574633 863 ntTSL 215.31■□□□□ 0.049e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.039e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.019e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.019e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SLC39A9-208ENST00000556125 944 ntTSL 314.98□□□□□ -0.017e-15■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SLC39A9-205ENST00000554059 1763 ntTSL 1 (best)14.92□□□□□ -0.027e-15■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.049e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.049e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 ZNF292-203ENST00000369578 1732 ntTSL 214.8□□□□□ -0.041e-9■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.059e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 COPS7B-215ENST00000450501 559 ntTSL 414.73□□□□□ -0.053e-12■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 COPS7B-211ENST00000432387 584 ntTSL 414.56□□□□□ -0.083e-12■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.091e-12■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.099e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.19e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.19e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MKL1-207ENST00000463769 531 ntTSL 1 (best)14.3□□□□□ -0.129e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 KRT8-210ENST00000548998 918 ntTSL 514.29□□□□□ -0.129e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.129e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.149e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 KRT8-204ENST00000546826 1165 ntTSL 514.12□□□□□ -0.159e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MEF2D-206ENST00000489057 593 ntTSL 514.07□□□□□ -0.169e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.171e-12■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.229e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.239e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.249e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.259e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.259e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.259e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SH3BP5L-202ENST00000475978 4122 ntTSL 213.4□□□□□ -0.269e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.39e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SPPL2A-207ENST00000560288 742 ntTSL 213.14□□□□□ -0.317e-8■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.319e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.329e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.339e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.349e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 DBF4B-207ENST00000528353 2495 ntTSL 212.95□□□□□ -0.349e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 ABCA2-216ENST00000476211 997 ntTSL 212.9□□□□□ -0.342e-11■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 ABCA2-212ENST00000464876 3438 ntTSL 212.88□□□□□ -0.352e-11■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 DBF4B-203ENST00000525140 775 ntTSL 212.87□□□□□ -0.359e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 CDC42EP4-204ENST00000579611 580 ntTSL 412.87□□□□□ -0.359e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.359e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.359e-7■■■■■ 27.6
Retrieved 100 of 27,725 protein–RNA pairs in 310 ms