RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475978.1

SH3BP5L-202, Transcript of SH3 binding domain protein 5 like, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP5L, Length 4,122 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5L-202ENST00000475978 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.17■■□□□ 1.78
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SH3BP5L-202ENST00000475978 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP5L-202ENST00000475978 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5L-202ENST00000475978 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5L-202ENST00000475978 HRCP23327 699 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5L-202ENST00000475978 MYT1Q01538 1121 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5L-202ENST00000475978 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5L-202ENST00000475978 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP5L-202ENST00000475978 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.56■■□□□ 1.2
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SH3BP5L-202ENST00000475978 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5L-202ENST00000475978 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5L-202ENST00000475978 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5L-202ENST00000475978 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5L-202ENST00000475978 TRIM41Q8WV44 630 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5L-202ENST00000475978 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5L-202ENST00000475978 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SH3BP5L-202ENST00000475978 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
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SH3BP5L-202ENST00000475978 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP5L-202ENST00000475978 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
SH3BP5L-202ENST00000475978 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BP5L-202ENST00000475978 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5L-202ENST00000475978 ABCC9O60706 1549 aa21.67■■□□□ 1.06
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SH3BP5L-202ENST00000475978 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SH3BP5L-202ENST00000475978 NEUROD1Q13562 356 aa21.48■■□□□ 1.03
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SH3BP5L-202ENST00000475978 MIER1Q8N108 512 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP5L-202ENST00000475978 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP5L-202ENST00000475978 BCANQ96GW7 911 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BP5L-202ENST00000475978 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.74■□□□□ 0.91
SH3BP5L-202ENST00000475978 NACADO15069 1562 aa20.73■□□□□ 0.91
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SH3BP5L-202ENST00000475978 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.35■□□□□ 0.85
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SH3BP5L-202ENST00000475978 ABCC8Q09428 1581 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5L-202ENST00000475978 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
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SH3BP5L-202ENST00000475978 EEA1Q15075 1411 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP5L-202ENST00000475978 WIZO95785 1651 aa20.3■□□□□ 0.84
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SH3BP5L-202ENST00000475978 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
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SH3BP5L-202ENST00000475978 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BP5L-202ENST00000475978 ANP32CO43423 234 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP5L-202ENST00000475978 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.12■□□□□ 0.81
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SH3BP5L-202ENST00000475978 KCNH8Q96L42 1107 aa19.95■□□□□ 0.78
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SH3BP5L-202ENST00000475978 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
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SH3BP5L-202ENST00000475978 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
SH3BP5L-202ENST00000475978 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
SH3BP5L-202ENST00000475978 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.78
SH3BP5L-202ENST00000475978 SMARCA4P51532 1647 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP5L-202ENST00000475978 P3H3Q8IVL6 736 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP5L-202ENST00000475978 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP5L-202ENST00000475978 DEKP35659 375 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
SH3BP5L-202ENST00000475978 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.8■□□□□ 0.76
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SH3BP5L-202ENST00000475978 SMARCA2P51531 1590 aa19.78■□□□□ 0.76
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