RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466278.1

MKL1-208, Transcript of MKL/myocardin-like protein 1, human

TSL 3

Gene MKL1, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKL1-208	ENST00000466278	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		56.29	■■■■■ 6.6
MKL1-208	ENST00000466278	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.35	■■■■■ 5.65
MKL1-208	ENST00000466278	ABCC9	O60706	1549 aa		49.64	■■■■■ 5.54
MKL1-208	ENST00000466278	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.59	■■■■■ 5.21
MKL1-208	ENST00000466278	NACAD	O15069	1562 aa		47.41	■■■■■ 5.18
MKL1-208	ENST00000466278	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.13	■■■■■ 5.14
MKL1-208	ENST00000466278	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		46.99	■■■■■ 5.11
MKL1-208	ENST00000466278	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	46.82	■■■■■ 5.09
MKL1-208	ENST00000466278	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		46.59	■■■■■ 5.05
MKL1-208	ENST00000466278	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.52	■■■■■ 5.04
MKL1-208	ENST00000466278	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.25	■■■■■ 4.99
MKL1-208	ENST00000466278	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.14	■■■■■ 4.98
MKL1-208	ENST00000466278	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		45.93	■■■■■ 4.94
MKL1-208	ENST00000466278	SCRIB	Q14160	1630 aa		45.85	■■■■■ 4.93
MKL1-208	ENST00000466278	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.69	■■■■■ 4.91
MKL1-208	ENST00000466278	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	44.99	■■■■■ 4.79
MKL1-208	ENST00000466278	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		44.91	■■■■■ 4.78
MKL1-208	ENST00000466278	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.68	■■■■■ 4.74
MKL1-208	ENST00000466278	SMARCA4	P51532	1647 aa		43.82	■■■■■ 4.61
MKL1-208	ENST00000466278	NCAPD3	P42695	1498 aa		43.72	■■■■■ 4.59
MKL1-208	ENST00000466278	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	43.7	■■■■■ 4.59
MKL1-208	ENST00000466278	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.67	■■■■■ 4.58
MKL1-208	ENST00000466278	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.64	■■■■■ 4.58
MKL1-208	ENST00000466278	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.52	■■■■■ 4.56
MKL1-208	ENST00000466278	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.41	■■■■■ 4.54
MKL1-208	ENST00000466278	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.36	■■■■■ 4.53
MKL1-208	ENST00000466278	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.32	■■■■■ 4.52
MKL1-208	ENST00000466278	WIZ	O95785	1651 aa		42.89	■■■■■ 4.46
MKL1-208	ENST00000466278	ERCC6	Q03468	1493 aa		42.87	■■■■■ 4.45
MKL1-208	ENST00000466278	NES	P48681	1621 aa		42.81	■■■■■ 4.44
MKL1-208	ENST00000466278	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.69	■■■■■ 4.43
MKL1-208	ENST00000466278	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	42.67	■■■■■ 4.42
MKL1-208	ENST00000466278	CUX2	O14529	1486 aa		42.62	■■■■■ 4.41
MKL1-208	ENST00000466278	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	42.43	■■■■■ 4.38
MKL1-208	ENST00000466278	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.4	■■■■■ 4.38
MKL1-208	ENST00000466278	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.39	■■■■■ 4.38
MKL1-208	ENST00000466278	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.35	■■■■■ 4.37
MKL1-208	ENST00000466278	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.34	■■■■■ 4.37
MKL1-208	ENST00000466278	CFTR	P13569	1480 aa		42.07	■■■■■ 4.33
MKL1-208	ENST00000466278	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		42	■■■■■ 4.31
MKL1-208	ENST00000466278	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		41.97	■■■■■ 4.31
MKL1-208	ENST00000466278	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		41.94	■■■■■ 4.3
MKL1-208	ENST00000466278	WDR62	O43379	1518 aa		41.9	■■■■■ 4.3
MKL1-208	ENST00000466278	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		41.87	■■■■■ 4.29
MKL1-208	ENST00000466278	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.81	■■■■■ 4.28
MKL1-208	ENST00000466278	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		41.8	■■■■■ 4.28
MKL1-208	ENST00000466278	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.55	■■■■■ 4.24
MKL1-208	ENST00000466278	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.22	■■■■■ 4.19
MKL1-208	ENST00000466278	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.2	■■■■■ 4.19
MKL1-208	ENST00000466278	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	41.16	■■■■■ 4.18
MKL1-208	ENST00000466278	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.16	■■■■■ 4.18
MKL1-208	ENST00000466278	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.1	■■■■■ 4.17
MKL1-208	ENST00000466278	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	40.92	■■■■■ 4.14
MKL1-208	ENST00000466278	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	40.84	■■■■■ 4.13
MKL1-208	ENST00000466278	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	40.82	■■■■■ 4.13
MKL1-208	ENST00000466278	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	40.8	■■■■■ 4.12
MKL1-208	ENST00000466278	CUX1	P39880	1505 aa		40.72	■■■■■ 4.11
MKL1-208	ENST00000466278	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		40.67	■■■■■ 4.1
MKL1-208	ENST00000466278	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		40.67	■■■■■ 4.1
MKL1-208	ENST00000466278	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.64	■■■■■ 4.1
MKL1-208	ENST00000466278	SOGA1	O94964	1423 aa		40.63	■■■■■ 4.09
MKL1-208	ENST00000466278	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.61	■■■■■ 4.09
MKL1-208	ENST00000466278	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.53	■■■■■ 4.08
MKL1-208	ENST00000466278	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.45	■■■■■ 4.07
MKL1-208	ENST00000466278	CHD1	O14646	1710 aa		40.38	■■■■■ 4.05
MKL1-208	ENST00000466278	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		40.28	■■■■■ 4.04
MKL1-208	ENST00000466278	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	40.28	■■■■■ 4.04
MKL1-208	ENST00000466278	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.27	■■■■■ 4.04
MKL1-208	ENST00000466278	TOP2B	Q02880	1626 aa		40.27	■■■■■ 4.04
MKL1-208	ENST00000466278	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.26	■■■■■ 4.04
MKL1-208	ENST00000466278	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.26	■■■■■ 4.03
MKL1-208	ENST00000466278	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.22	■■■■■ 4.03
MKL1-208	ENST00000466278	SYNJ1	O43426	1573 aa		40.21	■■■■■ 4.03
MKL1-208	ENST00000466278	TRIM41	Q8WV44	630 aa		40.2	■■■■■ 4.03
MKL1-208	ENST00000466278	FBLN2	P98095	1184 aa		40.19	■■■■■ 4.02
MKL1-208	ENST00000466278	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.19	■■■■■ 4.02
MKL1-208	ENST00000466278	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.18	■■■■■ 4.02
MKL1-208	ENST00000466278	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.16	■■■■■ 4.02
MKL1-208	ENST00000466278	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		40.15	■■■■■ 4.02
MKL1-208	ENST00000466278	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		40.15	■■■■■ 4.02
MKL1-208	ENST00000466278	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		40.15	■■■■■ 4.02
MKL1-208	ENST00000466278	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.08	■■■■■ 4.01
MKL1-208	ENST00000466278	SYNJ2	O15056	1496 aa		40.06	■■■■■ 4
MKL1-208	ENST00000466278	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40.03	■■■■■ 4
MKL1-208	ENST00000466278	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		39.92	■■■■□ 3.98
MKL1-208	ENST00000466278	ADAMTS12	P58397	1594 aa		39.83	■■■■□ 3.97
MKL1-208	ENST00000466278	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		39.78	■■■■□ 3.96
MKL1-208	ENST00000466278	GRIN2A	Q12879	1464 aa		39.74	■■■■□ 3.95
MKL1-208	ENST00000466278	ARAP1	Q96P48	1450 aa		39.72	■■■■□ 3.95
MKL1-208	ENST00000466278	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		39.7	■■■■□ 3.95
MKL1-208	ENST00000466278	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		39.66	■■■■□ 3.94
MKL1-208	ENST00000466278	NUP160	Q12769	1436 aa		39.58	■■■■□ 3.93
MKL1-208	ENST00000466278	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.57	■■■■□ 3.92
MKL1-208	ENST00000466278	KIF27	Q86VH2	1401 aa		39.48	■■■■□ 3.91
MKL1-208	ENST00000466278	SHROOM2	Q13796	1616 aa		39.36	■■■■□ 3.89
MKL1-208	ENST00000466278	CUL7	Q14999	1698 aa		39.35	■■■■□ 3.89
MKL1-208	ENST00000466278	IGF1R	P08069	1367 aa		39.33	■■■■□ 3.89
MKL1-208	ENST00000466278	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39.29	■■■■□ 3.88
MKL1-208	ENST00000466278	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		39.25	■■■■□ 3.87
MKL1-208	ENST00000466278	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	39.11	■■■■□ 3.85

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