RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468186.5

THUMPD3-AS1-202, THUMPD3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THUMPD3-AS1, Length 3,253 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.77■■□□□ 1.88
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 HRCP23327 699 aa23.93■■□□□ 1.42
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.93■■□□□ 1.42
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.58■■□□□ 1.37
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.35■■□□□ 1.33
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.3■■□□□ 1.32
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.84■■□□□ 1.25
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.82■■□□□ 1.24
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.68■■□□□ 1.22
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.54■■□□□ 1.2
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 MYT1Q01538 1121 aa22.1■■□□□ 1.13
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.08■■□□□ 1.13
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 NEUROD1Q13562 356 aa22.04■■□□□ 1.12
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 TRIM41Q8WV44 630 aa22.02■■□□□ 1.12
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.97■■□□□ 1.11
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 ABCC9O60706 1549 aa21.61■■□□□ 1.05
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.49■■□□□ 1.03
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 SCRIBQ14160 1630 aa21.31■■□□□ 1
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 MIER1Q8N108 512 aa21.23■□□□□ 0.99
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.02■□□□□ 0.96
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 CEP162Q5TB80 1403 aa21.02■□□□□ 0.96
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 CECR2Q9BXF3 1484 aa21■□□□□ 0.95
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.95■□□□□ 0.94
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 WIZO95785 1651 aa20.87■□□□□ 0.93
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.84■□□□□ 0.93
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.81■□□□□ 0.92
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.81■□□□□ 0.92
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 ABCC8Q09428 1581 aa20.79■□□□□ 0.92
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.79■□□□□ 0.92
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 SOGA1O94964 1423 aa20.77■□□□□ 0.92
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.77■□□□□ 0.91
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.75■□□□□ 0.91
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 BCL11AQ9H165 835 aa20.71■□□□□ 0.91
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 APLP2Q06481 763 aa20.68■□□□□ 0.9
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.62■□□□□ 0.89
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 GOLGA3Q08378 1498 aa20.62■□□□□ 0.89
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 EEA1Q15075 1411 aa20.6■□□□□ 0.89
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 BCANQ96GW7 911 aa20.6■□□□□ 0.89
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 NACADO15069 1562 aa20.57■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 CLIP1P30622 1438 aa20.5■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 FKBP8Q14318 412 aa20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 KCNH8Q96L42 1107 aa20.4■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.39■□□□□ 0.85
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 SMARCA2P51531 1590 aa20.38■□□□□ 0.85
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 NEFLP07196 543 aa20.35■□□□□ 0.85
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 ITGAEP38570 1179 aa20.24■□□□□ 0.83
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 KIF21BO75037 1637 aa20.22■□□□□ 0.83
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 SMARCA4P51532 1647 aa20.22■□□□□ 0.83
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.19■□□□□ 0.82
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.15■□□□□ 0.82
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 TRIM52Q96A61 297 aa20.15■□□□□ 0.82
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 SYNJ1O43426 1573 aa20.1■□□□□ 0.81
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 MSH5O43196 834 aa20.05■□□□□ 0.8
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.02■□□□□ 0.8
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.01■□□□□ 0.79
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 ANP32CO43423 234 aa20■□□□□ 0.79
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.96■□□□□ 0.79
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.95■□□□□ 0.78
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 ARAP1Q96P48 1450 aa19.95■□□□□ 0.78
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 CCER2I3L3R5 266 aa19.91■□□□□ 0.78
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 CUX2O14529 1486 aa19.9■□□□□ 0.78
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 FANCIQ9NVI1 1328 aa19.89■□□□□ 0.77
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 WDR97A6NE52 1622 aa19.88■□□□□ 0.77
THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 MAPKBP1O60336 1514 aa19.86■□□□□ 0.77
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