RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366472.5

SH3BP5L-201, Transcript of SH3 binding domain protein 5 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5L, Length 3,861 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5L-201ENST00000366472 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.36■■□□□ 1.97
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SH3BP5L-201ENST00000366472 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5L-201ENST00000366472 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP5L-201ENST00000366472 ABCC9O60706 1549 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP5L-201ENST00000366472 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 HRCP23327 699 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5L-201ENST00000366472 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5L-201ENST00000366472 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5L-201ENST00000366472 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP5L-201ENST00000366472 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.11■■□□□ 1.29
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SH3BP5L-201ENST00000366472 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5L-201ENST00000366472 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP5L-201ENST00000366472 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SH3BP5L-201ENST00000366472 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SH3BP5L-201ENST00000366472 SCRIBQ14160 1630 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5L-201ENST00000366472 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5L-201ENST00000366472 TRIM41Q8WV44 630 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5L-201ENST00000366472 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP5L-201ENST00000366472 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5L-201ENST00000366472 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP5L-201ENST00000366472 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5L-201ENST00000366472 NACADO15069 1562 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5L-201ENST00000366472 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5L-201ENST00000366472 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
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SH3BP5L-201ENST00000366472 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP5L-201ENST00000366472 NEUROD1Q13562 356 aa21.91■■□□□ 1.1
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SH3BP5L-201ENST00000366472 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
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SH3BP5L-201ENST00000366472 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.66■■□□□ 1.06
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SH3BP5L-201ENST00000366472 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
SH3BP5L-201ENST00000366472 MYT1Q01538 1121 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP5L-201ENST00000366472 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP5L-201ENST00000366472 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP5L-201ENST00000366472 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
SH3BP5L-201ENST00000366472 APLP2Q06481 763 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP5L-201ENST00000366472 MIER1Q8N108 512 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP5L-201ENST00000366472 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP5L-201ENST00000366472 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP5L-201ENST00000366472 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
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SH3BP5L-201ENST00000366472 ITGAEP38570 1179 aa21.04■□□□□ 0.96
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SH3BP5L-201ENST00000366472 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP5L-201ENST00000366472 CEP162Q5TB80 1403 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP5L-201ENST00000366472 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
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SH3BP5L-201ENST00000366472 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP5L-201ENST00000366472 ERCC6Q03468 1493 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP5L-201ENST00000366472 FKBP8Q14318 412 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP5L-201ENST00000366472 SOGA1O94964 1423 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP5L-201ENST00000366472 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
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SH3BP5L-201ENST00000366472 TRIM52Q96A61 297 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP5L-201ENST00000366472 KCNH8Q96L42 1107 aa20.5■□□□□ 0.87
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SH3BP5L-201ENST00000366472 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.47■□□□□ 0.87
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SH3BP5L-201ENST00000366472 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5L-201ENST00000366472 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5L-201ENST00000366472 CLIP1P30622 1438 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP5L-201ENST00000366472 HMGXB3Q12766 1538 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP5L-201ENST00000366472 P3H3Q8IVL6 736 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP5L-201ENST00000366472 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP5L-201ENST00000366472 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SH3BP5L-201ENST00000366472 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP5L-201ENST00000366472 ANP32CO43423 234 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5L-201ENST00000366472 ARID3CA6NKF2 412 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5L-201ENST00000366472 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5L-201ENST00000366472 GOLGA3Q08378 1498 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5L-201ENST00000366472 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5L-201ENST00000366472 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5L-201ENST00000366472 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.18■□□□□ 0.82
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