Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.159e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.189e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 ECT2-205ENST00000415665 637 ntTSL 413.67□□□□□ -0.229e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 CHD7-207ENST00000527921 527 ntTSL 413□□□□□ -0.339e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 FANCI-214ENST00000567996 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.349e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.399e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 LDLR-207ENST00000558013 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.449e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 ZCCHC11-220ENST00000528642 3854 ntTSL 512.02□□□□□ -0.499e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 MARK3-201ENST00000216288 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.549e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.559e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 GRB2-210ENST00000582582 584 ntTSL 411.55□□□□□ -0.569e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 ZCCHC11-202ENST00000355809 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.579e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 RHAG-203ENST00000618248 1203 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.649e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 DYNLT1-203ENST00000367089 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.689e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 MARK3-226ENST00000561314 724 ntTSL 310.79□□□□□ -0.689e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 LDLR-208ENST00000558518 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.699e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 RHAG-201ENST00000229810 1283 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.729e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 CWC15-202ENST00000539856 905 ntTSL 210.3□□□□□ -0.769e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 DSCR4-201ENST00000328264 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.799e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 MPHOSPH8-204ENST00000467481 367 ntTSL 310.07□□□□□ -0.89e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 GRB2-208ENST00000578961 687 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.89e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 GRB2-206ENST00000462266 601 ntTSL 310□□□□□ -0.819e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 LSG1-201ENST00000265245 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.849e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 MARK3-218ENST00000559274 1053 ntTSL 29.77□□□□□ -0.859e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 MARK3-211ENST00000556744 1051 ntTSL 1 (best)9.73□□□□□ -0.859e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 PRPF3-207ENST00000496202 1082 ntTSL 1 (best)9.5□□□□□ -0.899e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 LSG1-203ENST00000437613 854 ntTSL 59.42□□□□□ -0.99e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 MRPL47-203ENST00000476781 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.929e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 MARK3-208ENST00000554627 1571 ntTSL 29.1□□□□□ -0.959e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 GPATCH11-202ENST00000409774 3906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.979e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 MRPL47-202ENST00000392659 673 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.989e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 RHAG-202ENST00000371175 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.999e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 DSCR4-202ENST00000398948 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.999e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 ECT2-208ENST00000428567 735 ntTSL 58.86□□□□□ -0.999e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 PRPF3-202ENST00000467329 2595 ntTSL 58.79□□□□□ -19e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 MARK3-207ENST00000553942 2298 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.079e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 SPTA1-204ENST00000467387 465 ntTSL 58.3□□□□□ -1.089e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 DYNLT1-202ENST00000367088 2891 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.19e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 MARK3-203ENST00000335102 2331 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.119e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.139e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.139e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 RDX-205ENST00000528556 803 ntTSL 37.93□□□□□ -1.149e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.149e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 RDX-212ENST00000532118 536 ntTSL 57.89□□□□□ -1.159e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 RBM28-205ENST00000481788 1052 ntTSL 37.71□□□□□ -1.189e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 MARK3-223ENST00000561071 746 ntTSL 37.45□□□□□ -1.229e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.229e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 ECT2-210ENST00000438041 573 ntTSL 47.02□□□□□ -1.299e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 SPART-204ENST00000460126 392 ntTSL 27.02□□□□□ -1.299e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 LSG1-205ENST00000461343 428 ntTSL 26.9□□□□□ -1.39e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 GPATCH11-203ENST00000473067 532 ntTSL 36.68□□□□□ -1.349e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 SPART-205ENST00000475603 675 ntTSL 26.65□□□□□ -1.349e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.359e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.419e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 SPART-207ENST00000482146 583 ntTSL 55.99□□□□□ -1.459e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 SPART-208ENST00000491805 668 ntTSL 25.83□□□□□ -1.489e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 ZCCHC11-203ENST00000371541 4319 ntTSL 25.68□□□□□ -1.59e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.529e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.549e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 SEC23A-210ENST00000555425 547 ntTSL 55.05□□□□□ -1.69e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.629e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 FANCI-210ENST00000565522 233 ntTSL 54.83□□□□□ -1.649e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.669e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.669e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 FANCI-205ENST00000563250 700 ntTSL 54.3□□□□□ -1.729e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.739e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.799e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 FANCI-203ENST00000447611 3690 ntTSL 23.6□□□□□ -1.839e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 SEC23A-208ENST00000555017 588 ntTSL 43.22□□□□□ -1.899e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.929e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 SLC38A2-201ENST00000256689 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.022e-9■■■■□ 23.6
PUM1Q14671 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.834e-7■■■■□ 23.6
PUM1Q14671 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.434e-7■■■■□ 23.6
PUM1Q14671 TNKS-203ENST00000517770 574 ntTSL 45.66□□□□□ -1.54e-7■■■■□ 23.6
PUM1Q14671 UBR4-213ENST00000483922 543 ntTSL 514.38□□□□□ -0.118e-7■■■■□ 23.5
PUM1Q14671 MIR6834-201ENST00000622807 81 ntBASIC11.03□□□□□ -0.641e-10■■■■□ 23.4
PUM1Q14671 SMAP2-204ENST00000487871 362 ntTSL 38.75□□□□□ -1.011e-10■■■■□ 23.4
PUM1Q14671 EIF3I-205ENST00000483517 744 ntTSL 514.52□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 23.3
PUM1Q14671 EIF3I-203ENST00000471486 825 ntTSL 212.16□□□□□ -0.462e-6■■■■□ 23.3
PUM1Q14671 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.324e-7■■■■□ 23.3
PUM1Q14671 CCDC25-211ENST00000524084 460 ntTSL 314.27□□□□□ -0.134e-7■■■■□ 23.3
PUM1Q14671 CCDC25-206ENST00000520202 1734 ntTSL 1 (best)12.34□□□□□ -0.434e-7■■■■□ 23.3
PUM1Q14671 CCDC25-210ENST00000523841 947 ntTSL 211.81□□□□□ -0.524e-7■■■■□ 23.3
PUM1Q14671 CCDC25-204ENST00000519509 977 ntTSL 210.88□□□□□ -0.674e-7■■■■□ 23.3
PUM1Q14671 CCDC25-201ENST00000356537 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.974e-7■■■■□ 23.3
PUM1Q14671 CCDC25-207ENST00000520486 3586 ntTSL 1 (best)9□□□□□ -0.974e-7■■■■□ 23.3
PUM1Q14671 CCDC25-208ENST00000521220 613 ntTSL 26.2□□□□□ -1.424e-7■■■■□ 23.3
PUM1Q14671 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.674e-7■■■■□ 23.3
PUM1Q14671 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.551e-7■■■■□ 23.2
PUM1Q14671 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.61e-6■■■■□ 23.2
PUM1Q14671 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.41e-6■■■■□ 23.2
PUM1Q14671 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.381e-6■■■■□ 23.2
PUM1Q14671 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.081e-6■■■■□ 23.2
PUM1Q14671 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.081e-6■■■■□ 23.2
PUM1Q14671 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.141e-6■■■■□ 23.2
PUM1Q14671 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.261e-6■■■■□ 23.2
PUM1Q14671 ZC3H18-212ENST00000569435 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.38■□□□□ 0.378e-7■■■■□ 23
PUM1Q14671 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.338e-7■■■■□ 23
PUM1Q14671 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.458e-7■■■■□ 23
PUM1Q14671 MSL3-204ENST00000380691 589 ntTSL 37□□□□□ -1.298e-7■■■■□ 23
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