Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSPAN13O95857 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSPAN13O95857 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPAN13O95857 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms