Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN13O95857 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN13O95857 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN13O95857 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN13O95857 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN13O95857 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN13O95857 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN13O95857 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN13O95857 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TSPAN13O95857 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN13O95857 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN13O95857 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN13O95857 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN13O95857 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN13O95857 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN13O95857 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN13O95857 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN13O95857 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN13O95857 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN13O95857 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN13O95857 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN13O95857 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN13O95857 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN13O95857 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN13O95857 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN13O95857 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN13O95857 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN13O95857 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN13O95857 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN13O95857 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN13O95857 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSPAN13O95857 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSPAN13O95857 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSPAN13O95857 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TSPAN13O95857 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSPAN13O95857 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TSPAN13O95857 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPAN13O95857 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSPAN13O95857 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSPAN13O95857 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSPAN13O95857 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSPAN13O95857 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSPAN13O95857 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSPAN13O95857 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSPAN13O95857 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSPAN13O95857 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSPAN13O95857 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSPAN13O95857 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSPAN13O95857 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSPAN13O95857 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSPAN13O95857 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSPAN13O95857 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN13O95857 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSPAN13O95857 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSPAN13O95857 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSPAN13O95857 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSPAN13O95857 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSPAN13O95857 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSPAN13O95857 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSPAN13O95857 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TSPAN13O95857 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSPAN13O95857 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSPAN13O95857 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSPAN13O95857 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSPAN13O95857 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSPAN13O95857 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPAN13O95857 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN13O95857 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN13O95857 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSPAN13O95857 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSPAN13O95857 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TSPAN13O95857 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSPAN13O95857 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TSPAN13O95857 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPAN13O95857 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSPAN13O95857 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TSPAN13O95857 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPAN13O95857 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPAN13O95857 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TSPAN13O95857 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPAN13O95857 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSPAN13O95857 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSPAN13O95857 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPAN13O95857 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN13O95857 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN13O95857 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN13O95857 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN13O95857 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN13O95857 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN13O95857 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN13O95857 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN13O95857 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN13O95857 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN13O95857 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN13O95857 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN13O95857 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPAN13O95857 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPAN13O95857 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPAN13O95857 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSPAN13O95857 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms