RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396914.3

CHCHD4-202, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHCHD4, Length 1,405 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4-202ENST00000396914 NISCHQ9Y2I1 1504 aa70,42■■■■■ 8,86
CHCHD4-202ENST00000396914 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa62,42■■■■■ 7,58
CHCHD4-202ENST00000396914 ABCC9O60706 1549 aa60,88■■■■■ 7,34
CHCHD4-202ENST00000396914 DCAF8L2P0C7V8 631 aa59■■■■■ 7,04
CHCHD4-202ENST00000396914 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP58,71■■■■■ 6,99
CHCHD4-202ENST00000396914 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58,65■■■■■ 6,98
CHCHD4-202ENST00000396914 NACADO15069 1562 aa58,62■■■■■ 6,97
CHCHD4-202ENST00000396914 MYO15BQ96JP2 1530 aa58,27■■■■■ 6,92
CHCHD4-202ENST00000396914 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa58,19■■■■■ 6,91
CHCHD4-202ENST00000396914 UNC13AQ9UPW8 1703 aa57,29■■■■■ 6,76
CHCHD4-202ENST00000396914 SCRIBQ14160 1630 aa57,12■■■■■ 6,74
CHCHD4-202ENST00000396914 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56,99■■■■■ 6,71
CHCHD4-202ENST00000396914 BICRAQ9NZM4 1560 aa56,78■■■■■ 6,68
CHCHD4-202ENST00000396914 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa56,16■■■■■ 6,58
CHCHD4-202ENST00000396914 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55,47■■■■■ 6,47
CHCHD4-202ENST00000396914 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP55,31■■■■■ 6,44
CHCHD4-202ENST00000396914 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55,02■■■■■ 6,4
CHCHD4-202ENST00000396914 CECR2Q9BXF3 1484 aa54,85■■■■■ 6,37
CHCHD4-202ENST00000396914 SMARCA4P51532 1647 aa54,58■■■■■ 6,33
CHCHD4-202ENST00000396914 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP54,58■■■■■ 6,33
CHCHD4-202ENST00000396914 MROH2BQ7Z745 1585 aa54,32■■■■■ 6,29
CHCHD4-202ENST00000396914 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa54,19■■■■■ 6,26
CHCHD4-202ENST00000396914 SMARCA2P51531 1590 aa54,16■■■■■ 6,26
CHCHD4-202ENST00000396914 NCAPD3P42695 1498 aa54,05■■■■■ 6,24
CHCHD4-202ENST00000396914 PEG3Q9GZU2 1588 aa53,94■■■■■ 6,23
CHCHD4-202ENST00000396914 HMGXB3Q12766 1538 aa53,83■■■■■ 6,21
CHCHD4-202ENST00000396914 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53,83■■■■■ 6,21
CHCHD4-202ENST00000396914 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP53,81■■■■■ 6,21
CHCHD4-202ENST00000396914 WIZO95785 1651 aa53,78■■■■■ 6,2
CHCHD4-202ENST00000396914 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP53,19■■■■■ 6,1
CHCHD4-202ENST00000396914 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP52,96■■■■■ 6,07
CHCHD4-202ENST00000396914 NESP48681 1621 aa52,75■■■■■ 6,03
CHCHD4-202ENST00000396914 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52,62■■■■■ 6,01
CHCHD4-202ENST00000396914 CCDC88BA6NC98 1476 aa52,58■■■■■ 6,01
CHCHD4-202ENST00000396914 CADPSQ9ULU8 1353 aa52,57■■■■■ 6,01
CHCHD4-202ENST00000396914 ERCC6Q03468 1493 aa52,49■■■■■ 5,99
CHCHD4-202ENST00000396914 PDS5BQ9NTI5 1447 aa52,3■■■■■ 5,96
CHCHD4-202ENST00000396914 CFTRP13569 1480 aa52,29■■■■■ 5,96
CHCHD4-202ENST00000396914 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa52,14■■■■■ 5,94
CHCHD4-202ENST00000396914 FANCD2Q9BXW9 1451 aa52■■■■■ 5,91
CHCHD4-202ENST00000396914 PRDM2Q13029 1718 aa51,95■■■■■ 5,91
CHCHD4-202ENST00000396914 CEP164Q9UPV0 1460 aa51,91■■■■■ 5,9
CHCHD4-202ENST00000396914 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51,8■■■■■ 5,88
CHCHD4-202ENST00000396914 MRC2Q9UBG0 1479 aa51,73■■■■■ 5,87
CHCHD4-202ENST00000396914 CUX2O14529 1486 aa51,65■■■■■ 5,86
CHCHD4-202ENST00000396914 WDR62O43379 1518 aa51,5■■■■■ 5,83
CHCHD4-202ENST00000396914 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP51,42■■■■■ 5,82
CHCHD4-202ENST00000396914 ABCC8Q09428 1581 aa51,19■■■■■ 5,78
CHCHD4-202ENST00000396914 TOPBP1Q92547 1522 aa51,18■■■■■ 5,78
CHCHD4-202ENST00000396914 DNMBPQ6XZF7 1577 aa51,15■■■■■ 5,78
CHCHD4-202ENST00000396914 CUX1P39880 1505 aa50,93■■■■■ 5,74
CHCHD4-202ENST00000396914 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP50,78■■■■■ 5,72
CHCHD4-202ENST00000396914 IFT140Q96RY7 1462 aa50,77■■■■■ 5,72
CHCHD4-202ENST00000396914 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50,77■■■■■ 5,72
CHCHD4-202ENST00000396914 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50,73■■■■■ 5,71
CHCHD4-202ENST00000396914 SOGA1O94964 1423 aa50,62■■■■■ 5,69
CHCHD4-202ENST00000396914 SYNJ1O43426 1573 aa50,61■■■■■ 5,69
CHCHD4-202ENST00000396914 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa50,6■■■■■ 5,69
CHCHD4-202ENST00000396914 TOP2BQ02880 1626 aa50,57■■■■■ 5,69
CHCHD4-202ENST00000396914 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP50,56■■■■■ 5,68
CHCHD4-202ENST00000396914 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50,56■■■■■ 5,68
CHCHD4-202ENST00000396914 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50,53■■■■■ 5,68
CHCHD4-202ENST00000396914 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP50,35■■■■■ 5,65
CHCHD4-202ENST00000396914 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP50,33■■■■■ 5,65
CHCHD4-202ENST00000396914 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50,31■■■■■ 5,64
CHCHD4-202ENST00000396914 WDR97A6NE52 1622 aa50,22■■■■■ 5,63
CHCHD4-202ENST00000396914 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50,2■■■■■ 5,63
CHCHD4-202ENST00000396914 GAPVD1Q14C86 1478 aa50,02■■■■■ 5,6
CHCHD4-202ENST00000396914 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49,96■■■■■ 5,59
CHCHD4-202ENST00000396914 GRIN2BQ13224 1484 aa49,96■■■■■ 5,59
CHCHD4-202ENST00000396914 TRIM41Q8WV44 630 aa49,95■■■■■ 5,59
CHCHD4-202ENST00000396914 PBRM1Q86U86 1689 aa49,9■■■■■ 5,58
CHCHD4-202ENST00000396914 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49,86■■■■■ 5,57
CHCHD4-202ENST00000396914 FBLN2P98095 1184 aa49,82■■■■■ 5,57
CHCHD4-202ENST00000396914 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49,75■■■■■ 5,56
CHCHD4-202ENST00000396914 KIF27Q86VH2 1401 aa49,7■■■■■ 5,55
CHCHD4-202ENST00000396914 OSCARQ8IYS5 282 aa49,68■■■■■ 5,54
CHCHD4-202ENST00000396914 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49,68■■■■■ 5,54
CHCHD4-202ENST00000396914 CHD1O14646 1710 aa49,67■■■■■ 5,54
CHCHD4-202ENST00000396914 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49,65■■■■■ 5,54
CHCHD4-202ENST00000396914 ERICH3Q5RHP9 1530 aa49,61■■■■■ 5,53
CHCHD4-202ENST00000396914 SYNJ2O15056 1496 aa49,57■■■■■ 5,53
CHCHD4-202ENST00000396914 CHIC1Q5VXU3 224 aa49,5■■■■■ 5,51
CHCHD4-202ENST00000396914 ADAMTS12P58397 1594 aa49,48■■■■■ 5,51
CHCHD4-202ENST00000396914 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49,44■■■■■ 5,51
CHCHD4-202ENST00000396914 IGF1RP08069 1367 aa49,41■■■■■ 5,5
CHCHD4-202ENST00000396914 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa49,36■■■■■ 5,49
CHCHD4-202ENST00000396914 GRIN2AQ12879 1464 aa49,31■■■■■ 5,48
CHCHD4-202ENST00000396914 CUL7Q14999 1698 aa49,26■■■■■ 5,48
CHCHD4-202ENST00000396914 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49,17■■■■■ 5,46
CHCHD4-202ENST00000396914 CLASP1Q7Z460 1538 aa49,05■■■■■ 5,44
CHCHD4-202ENST00000396914 CEP170Q5SW79 1584 aa49,04■■■■■ 5,44
CHCHD4-202ENST00000396914 NUP160Q12769 1436 aa49,01■■■■■ 5,44
CHCHD4-202ENST00000396914 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP49■■■■■ 5,43
CHCHD4-202ENST00000396914 EEA1Q15075 1411 aa48,95■■■■■ 5,43
CHCHD4-202ENST00000396914 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa48,91■■■■■ 5,42
CHCHD4-202ENST00000396914 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48,91■■■■■ 5,42
CHCHD4-202ENST00000396914 ARHGEF11O15085 1522 aa48,82■■■■■ 5,41
CHCHD4-202ENST00000396914 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48,8■■■■■ 5,4
CHCHD4-202ENST00000396914 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48,8■■■■■ 5,4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10,9 ms