RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)C

SUP53, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene SUP53, Length 82 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUP53tL(CAA)C BDP1P46678 594 aa4.57□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C IRC8P47046 822 aa4.57□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C YLL058WQ12198 575 aa4.57□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C PEX2P32800 271 aa4.56□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C SAF1P38352 637 aa4.56□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C SSF1P38789 453 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C PEX28P38848 579 aa4.56□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C VPS8P39702 1274 aa4.56□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C FAA4P47912 694 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C PIB2P53191 635 aa4.56□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C YDR344CQ05510 147 aa4.56□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C UTP20P35194 2493 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C GEF1P37020 779 aa4.55□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C ILV3P39522 585 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C GCV2P49095 1034 aa4.55□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C UBP15P50101 1230 aa4.55□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C FOL1P53848 824 aa4.55□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C VPS30Q02948 557 aa4.55□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C YML020WQ03722 664 aa4.55□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C YML053CQ04978 212 aa4.55□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C NUC1P08466 329 aa4.54□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C RAM1P22007 431 aa4.54□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C MSS51P32335 436 aa4.54□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C PDR3P33200 976 aa4.54□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C COY1P34237 679 aa4.54□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C BUD16P39988 312 aa4.54□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C FMS1P50264 508 aa4.54□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C YGL242CP53066 181 aa4.54□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C LIF1P53150 421 aa4.54□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C ALO1P54783 526 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C MRD1Q06106 887 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C MEX67Q99257 599 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C SUI2P20459 304 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C GCD7P32502 381 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C ECM32P32644 1121 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C UGA4P32837 571 aa4.53□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C UBX7P38349 436 aa4.53□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C FPR3P38911 411 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C VPS45P38932 577 aa4.53□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C EAF1Q06337 982 aa4.53□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C GPI13Q07830 1017 aa4.53□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C RPS14AP06367 137 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C HIS5P07172 385 aa4.52□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C TIF1P10081 395 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C SRP54P20424 541 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C RIT1P23796 513 aa4.52□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C RPS14BP39516 138 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C PSP2P50109 593 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C CWC24P53769 259 aa4.52□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C SEC21P32074 935 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C RFC1P38630 861 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C YHL026CP38740 315 aa4.51□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C RIM4P38741 713 aa4.51□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C SFB3P38810 929 aa4.51□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C YPT35P38815 214 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C TAM41P53230 385 aa4.51□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C WHI4Q07655 649 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C SGF29P25554 259 aa4.5□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C MYO3P36006 1272 aa4.5□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C ENV11P53246 860 aa4.5□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C RPS15Q01855 142 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C NOT3P06102 836 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C SPE1P08432 466 aa4.49□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C UBC1P21734 215 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C CDC48P25694 835 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C UBP11P36026 717 aa4.49□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C TVP38P36164 337 aa4.49□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C SPO1P53541 631 aa4.49□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C YNR061CP53747 219 aa4.49□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C YHM2Q04013 314 aa4.49□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C NSE1Q07913 336 aa4.49□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C RAD2P07276 1031 aa4.48□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C PCK1P10963 549 aa4.48□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C MSH2P25847 964 aa4.48□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C RME1P32338 300 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C CSE2P33308 149 aa4.48□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C DID4P36108 232 aa4.48□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C MRPL7P36519 292 aa4.48□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C PBY1P38254 753 aa4.48□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C YNG2P38806 282 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C YHR202WP38887 602 aa4.48□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C XDJ1P39102 459 aa4.48□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C YEL025CP39991 1188 aa4.48□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C MMF1P40185 145 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C ESL1P40456 1118 aa4.48□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C CSM2P40465 213 aa4.48□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C SFB2P53953 876 aa4.48□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C UFD2P54860 961 aa4.48□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C GYL1Q04322 720 aa4.48□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C MRI1Q06489 411 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C TAH18Q12181 623 aa4.48□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C HOM2P13663 365 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C RPL8BP29453 256 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
SUP53tL(CAA)C PSE1P32337 1089 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27 ms