Protein–RNA interactions for Protein: Q02948

VPS30, Vacuolar protein sorting-associated protein 30, yeastyeast

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS30Q02948 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.6■■□□□ 1.37
VPS30Q02948 NSR1YGR159C 1245 nt23.27■■□□□ 1.32
VPS30Q02948 NOP1YDL014W 984 nt22.99■■□□□ 1.27
VPS30Q02948 YKL036CYKL036C 393 nt21.41■■□□□ 1.02
VPS30Q02948 MDJ1YFL016C 1536 nt20.51■□□□□ 0.87
VPS30Q02948 Q0297Q0297 156 nt20.2■□□□□ 0.82
VPS30Q02948 SRX1YKL086W 384 nt20.1■□□□□ 0.81
VPS30Q02948 YJL027CYJL027C 417 nt20.02■□□□□ 0.8
VPS30Q02948 SCS3YGL126W 1143 nt19.59■□□□□ 0.73
VPS30Q02948 YCR051WYCR051W 669 nt19.1■□□□□ 0.65
VPS30Q02948 YOL085CYOL085C 342 nt18.54■□□□□ 0.56
VPS30Q02948 PKP1YIL042C 1185 nt18.25■□□□□ 0.51
VPS30Q02948 DBP2YNL112W 1641 nt18.23■□□□□ 0.51
VPS30Q02948 RPP1BYDL130W 321 nt18.13■□□□□ 0.49
VPS30Q02948 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.08■□□□□ 0.48
VPS30Q02948 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.08■□□□□ 0.48
VPS30Q02948 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.08■□□□□ 0.48
VPS30Q02948 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.08■□□□□ 0.48
VPS30Q02948 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.08■□□□□ 0.48
VPS30Q02948 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.08■□□□□ 0.48
VPS30Q02948 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.08■□□□□ 0.48
VPS30Q02948 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.08■□□□□ 0.48
VPS30Q02948 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.08■□□□□ 0.48
VPS30Q02948 CCC1YLR220W 969 nt17.9■□□□□ 0.46
VPS30Q02948 SCJ1YMR214W 1134 nt17.58■□□□□ 0.4
VPS30Q02948 ATS1YAL020C 1002 nt17.57■□□□□ 0.4
VPS30Q02948 YBR190WYBR190W 312 nt17.41■□□□□ 0.38
VPS30Q02948 PET122YER153C 765 nt17.31■□□□□ 0.36
VPS30Q02948 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.16■□□□□ 0.34
VPS30Q02948 SCR1SCR1 522 nt17.16■□□□□ 0.34
VPS30Q02948 RVS167YDR388W 1449 nt17.15■□□□□ 0.34
VPS30Q02948 RTC3YHR087W 336 nt17.04■□□□□ 0.32
VPS30Q02948 RRN5YLR141W 1092 nt16.82■□□□□ 0.28
VPS30Q02948 SHR5YOL110W 714 nt16.61■□□□□ 0.25
VPS30Q02948 YDJ1YNL064C 1230 nt16.58■□□□□ 0.24
VPS30Q02948 RSB1YOR049C 1065 nt16.53■□□□□ 0.24
VPS30Q02948 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.5■□□□□ 0.23
VPS30Q02948 SSA3YBL075C 1950 nt16.35■□□□□ 0.21
VPS30Q02948 PST2YDR032C 597 nt16.24■□□□□ 0.19
VPS30Q02948 GAR1YHR089C 618 nt16.2■□□□□ 0.18
VPS30Q02948 DEP1YAL013W 1218 nt16.09■□□□□ 0.17
VPS30Q02948 URN1YPR152C 1398 nt16.03■□□□□ 0.16
VPS30Q02948 YNL208WYNL208W 600 nt15.84■□□□□ 0.13
VPS30Q02948 RPN10YHR200W 807 nt15.82■□□□□ 0.12
VPS30Q02948 OPI9YLR338W 858 nt15.76■□□□□ 0.11
VPS30Q02948 YKL097CYKL097C 411 nt15.7■□□□□ 0.1
VPS30Q02948 PUT4YOR348C 1884 nt15.69■□□□□ 0.1
VPS30Q02948 TIR1YER011W 765 nt15.65■□□□□ 0.1
VPS30Q02948 SAH1YER043C 1350 nt15.62■□□□□ 0.09
VPS30Q02948 SHU1YHL006C 453 nt15.55■□□□□ 0.08
VPS30Q02948 ARE1YCR048W 1833 nt15.47■□□□□ 0.07
VPS30Q02948 SSA1YAL005C 1929 nt15.44■□□□□ 0.06
VPS30Q02948 YJR018WYJR018W 363 nt15.3■□□□□ 0.04
VPS30Q02948 PUN1YLR414C 792 nt15.29■□□□□ 0.04
VPS30Q02948 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.26■□□□□ 0.03
VPS30Q02948 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.26■□□□□ 0.03
VPS30Q02948 SRB2YHR041C 633 nt15.24■□□□□ 0.03
VPS30Q02948 POA1YBR022W 534 nt15.21■□□□□ 0.03
VPS30Q02948 YJR120WYJR120W 351 nt15.14■□□□□ 0.01
VPS30Q02948 PTC2YER089C 1395 nt15.08■□□□□ 0
VPS30Q02948 YOR139CYOR139C 393 nt15.05■□□□□ -0
VPS30Q02948 RPP2BYDR382W 333 nt15.03■□□□□ -0
VPS30Q02948 WWM1YFL010C 636 nt15□□□□□ -0.01
VPS30Q02948 YGR021WYGR021W 873 nt14.95□□□□□ -0.02
VPS30Q02948 HOM6YJR139C 1080 nt14.93□□□□□ -0.02
VPS30Q02948 BUD23YCR047C 828 nt14.92□□□□□ -0.02
VPS30Q02948 MNP1YGL068W 585 nt14.9□□□□□ -0.02
VPS30Q02948 NPL3YDR432W 1245 nt14.86□□□□□ -0.03
VPS30Q02948 NAB2YGL122C 1578 nt14.85□□□□□ -0.03
VPS30Q02948 BSC6YOL137W 1494 nt14.83□□□□□ -0.03
VPS30Q02948 BDH2YAL061W 1254 nt14.78□□□□□ -0.04
VPS30Q02948 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.73□□□□□ -0.05
VPS30Q02948 INM2YDR287W 879 nt14.72□□□□□ -0.05
VPS30Q02948 RKM5YLR137W 1104 nt14.71□□□□□ -0.05
VPS30Q02948 DAL1YIR027C 1383 nt14.71□□□□□ -0.06
VPS30Q02948 YOL037CYOL037C 354 nt14.7□□□□□ -0.06
VPS30Q02948 FIS1YIL065C 468 nt14.68□□□□□ -0.06
VPS30Q02948 FPR4YLR449W 1179 nt14.67□□□□□ -0.06
VPS30Q02948 YBL100CYBL100C 315 nt14.63□□□□□ -0.07
VPS30Q02948 LSM3YLR438C-A 270 nt14.61□□□□□ -0.07
VPS30Q02948 PHO4YFR034C 939 nt14.57□□□□□ -0.08
VPS30Q02948 FUN26YAL022C 1554 nt14.47□□□□□ -0.09
VPS30Q02948 TRM9YML014W 840 nt14.46□□□□□ -0.09
VPS30Q02948 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.44□□□□□ -0.1
VPS30Q02948 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.44□□□□□ -0.1
VPS30Q02948 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.44□□□□□ -0.1
VPS30Q02948 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.44□□□□□ -0.1
VPS30Q02948 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.44□□□□□ -0.1
VPS30Q02948 YLR281CYLR281C 468 nt14.36□□□□□ -0.11
VPS30Q02948 CCT6YDR188W 1641 nt14.32□□□□□ -0.12
VPS30Q02948 WHI5YOR083W 888 nt14.29□□□□□ -0.12
VPS30Q02948 PUS2YGL063W 1113 nt14.28□□□□□ -0.12
VPS30Q02948 YPS1YLR120C 1710 nt14.21□□□□□ -0.13
VPS30Q02948 ALF1YNL148C 765 nt14.2□□□□□ -0.14
VPS30Q02948 YDR095CYDR095C 411 nt14.16□□□□□ -0.14
VPS30Q02948 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.16□□□□□ -0.14
VPS30Q02948 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.16□□□□□ -0.14
VPS30Q02948 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.12□□□□□ -0.15
VPS30Q02948 SSA4YER103W 1929 nt14.07□□□□□ -0.16
VPS30Q02948 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms