Protein–RNA interactions for Protein: Q12198

YLL058W, Putative cystathionine gamma-synthase YLL058W, yeastyeast

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL058WQ12198 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.78■■□□□ 1.24
YLL058WQ12198 NSR1YGR159C 1245 nt22.4■■□□□ 1.18
YLL058WQ12198 NOP1YDL014W 984 nt22.33■■□□□ 1.17
YLL058WQ12198 YKL036CYKL036C 393 nt20.9■□□□□ 0.94
YLL058WQ12198 Q0297Q0297 156 nt19.67■□□□□ 0.74
YLL058WQ12198 YJL027CYJL027C 417 nt19.55■□□□□ 0.72
YLL058WQ12198 MDJ1YFL016C 1536 nt19.52■□□□□ 0.72
YLL058WQ12198 SRX1YKL086W 384 nt19.51■□□□□ 0.71
YLL058WQ12198 SCS3YGL126W 1143 nt19.17■□□□□ 0.66
YLL058WQ12198 YCR051WYCR051W 669 nt18.5■□□□□ 0.55
YLL058WQ12198 YOL085CYOL085C 342 nt18.08■□□□□ 0.48
YLL058WQ12198 PKP1YIL042C 1185 nt17.72■□□□□ 0.43
YLL058WQ12198 RPP1BYDL130W 321 nt17.63■□□□□ 0.41
YLL058WQ12198 SCJ1YMR214W 1134 nt17.45■□□□□ 0.38
YLL058WQ12198 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.44■□□□□ 0.38
YLL058WQ12198 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.44■□□□□ 0.38
YLL058WQ12198 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.44■□□□□ 0.38
YLL058WQ12198 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.44■□□□□ 0.38
YLL058WQ12198 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.44■□□□□ 0.38
YLL058WQ12198 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.44■□□□□ 0.38
YLL058WQ12198 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.44■□□□□ 0.38
YLL058WQ12198 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.44■□□□□ 0.38
YLL058WQ12198 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.44■□□□□ 0.38
YLL058WQ12198 DBP2YNL112W 1641 nt17.43■□□□□ 0.38
YLL058WQ12198 ATS1YAL020C 1002 nt17.24■□□□□ 0.35
YLL058WQ12198 CCC1YLR220W 969 nt17.22■□□□□ 0.35
YLL058WQ12198 PET122YER153C 765 nt16.78■□□□□ 0.28
YLL058WQ12198 SCR1SCR1 522 nt16.72■□□□□ 0.27
YLL058WQ12198 YBR190WYBR190W 312 nt16.61■□□□□ 0.25
YLL058WQ12198 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.59■□□□□ 0.25
YLL058WQ12198 RVS167YDR388W 1449 nt16.49■□□□□ 0.23
YLL058WQ12198 RRN5YLR141W 1092 nt16.33■□□□□ 0.2
YLL058WQ12198 RTC3YHR087W 336 nt16.22■□□□□ 0.19
YLL058WQ12198 YDJ1YNL064C 1230 nt16.09■□□□□ 0.17
YLL058WQ12198 RSB1YOR049C 1065 nt16.09■□□□□ 0.17
YLL058WQ12198 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.02■□□□□ 0.16
YLL058WQ12198 SHR5YOL110W 714 nt16■□□□□ 0.15
YLL058WQ12198 PST2YDR032C 597 nt15.92■□□□□ 0.14
YLL058WQ12198 GAR1YHR089C 618 nt15.62■□□□□ 0.09
YLL058WQ12198 YKL097CYKL097C 411 nt15.46■□□□□ 0.07
YLL058WQ12198 DEP1YAL013W 1218 nt15.37■□□□□ 0.05
YLL058WQ12198 URN1YPR152C 1398 nt15.32■□□□□ 0.04
YLL058WQ12198 YNL208WYNL208W 600 nt15.22■□□□□ 0.03
YLL058WQ12198 RPN10YHR200W 807 nt15.21■□□□□ 0.03
YLL058WQ12198 SHU1YHL006C 453 nt15.18■□□□□ 0.02
YLL058WQ12198 TIR1YER011W 765 nt15.1■□□□□ 0.01
YLL058WQ12198 OPI9YLR338W 858 nt15.05■□□□□ -0
YLL058WQ12198 SAH1YER043C 1350 nt14.84□□□□□ -0.03
YLL058WQ12198 SSA1YAL005C 1929 nt14.83□□□□□ -0.04
YLL058WQ12198 PUT4YOR348C 1884 nt14.81□□□□□ -0.04
YLL058WQ12198 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.8□□□□□ -0.04
YLL058WQ12198 YOR139CYOR139C 393 nt14.77□□□□□ -0.05
YLL058WQ12198 YJR018WYJR018W 363 nt14.65□□□□□ -0.06
YLL058WQ12198 PUN1YLR414C 792 nt14.63□□□□□ -0.07
YLL058WQ12198 ARE1YCR048W 1833 nt14.62□□□□□ -0.07
YLL058WQ12198 SRB2YHR041C 633 nt14.62□□□□□ -0.07
YLL058WQ12198 NPL3YDR432W 1245 nt14.59□□□□□ -0.07
YLL058WQ12198 YGR021WYGR021W 873 nt14.55□□□□□ -0.08
YLL058WQ12198 HOM6YJR139C 1080 nt14.49□□□□□ -0.09
YLL058WQ12198 YJR120WYJR120W 351 nt14.48□□□□□ -0.09
YLL058WQ12198 WWM1YFL010C 636 nt14.47□□□□□ -0.09
YLL058WQ12198 RPP2BYDR382W 333 nt14.46□□□□□ -0.09
YLL058WQ12198 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.44□□□□□ -0.1
YLL058WQ12198 MNP1YGL068W 585 nt14.43□□□□□ -0.1
YLL058WQ12198 YOL037CYOL037C 354 nt14.38□□□□□ -0.11
YLL058WQ12198 PTC2YER089C 1395 nt14.35□□□□□ -0.11
YLL058WQ12198 POA1YBR022W 534 nt14.34□□□□□ -0.11
YLL058WQ12198 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.29□□□□□ -0.12
YLL058WQ12198 RKM5YLR137W 1104 nt14.27□□□□□ -0.13
YLL058WQ12198 BDH2YAL061W 1254 nt14.23□□□□□ -0.13
YLL058WQ12198 SSA3YBL075C 1950 nt14.21□□□□□ -0.13
YLL058WQ12198 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.18□□□□□ -0.14
YLL058WQ12198 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.18□□□□□ -0.14
YLL058WQ12198 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.18□□□□□ -0.14
YLL058WQ12198 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.18□□□□□ -0.14
YLL058WQ12198 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.18□□□□□ -0.14
YLL058WQ12198 NAB2YGL122C 1578 nt14.14□□□□□ -0.15
YLL058WQ12198 BUD23YCR047C 828 nt14.12□□□□□ -0.15
YLL058WQ12198 LSM3YLR438C-A 270 nt14.12□□□□□ -0.15
YLL058WQ12198 INM2YDR287W 879 nt14.11□□□□□ -0.15
YLL058WQ12198 DAL1YIR027C 1383 nt14.02□□□□□ -0.17
YLL058WQ12198 BSC6YOL137W 1494 nt14□□□□□ -0.17
YLL058WQ12198 YLR281CYLR281C 468 nt14□□□□□ -0.17
YLL058WQ12198 YBL100CYBL100C 315 nt14□□□□□ -0.17
YLL058WQ12198 FIS1YIL065C 468 nt13.98□□□□□ -0.17
YLL058WQ12198 PUS2YGL063W 1113 nt13.95□□□□□ -0.18
YLL058WQ12198 FPR4YLR449W 1179 nt13.95□□□□□ -0.18
YLL058WQ12198 TRM9YML014W 840 nt13.89□□□□□ -0.19
YLL058WQ12198 WHI5YOR083W 888 nt13.89□□□□□ -0.19
YLL058WQ12198 PHO4YFR034C 939 nt13.88□□□□□ -0.19
YLL058WQ12198 FUN26YAL022C 1554 nt13.85□□□□□ -0.19
YLL058WQ12198 MOT3YMR070W 1473 nt13.75□□□□□ -0.21
YLL058WQ12198 CCT6YDR188W 1641 nt13.75□□□□□ -0.21
YLL058WQ12198 IMP2'YIL154C 1041 nt13.65□□□□□ -0.22
YLL058WQ12198 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.65□□□□□ -0.22
YLL058WQ12198 DSK2YMR276W 1122 nt13.65□□□□□ -0.22
YLL058WQ12198 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.61□□□□□ -0.23
YLL058WQ12198 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.61□□□□□ -0.23
YLL058WQ12198 FMP45YDL222C 930 nt13.6□□□□□ -0.23
YLL058WQ12198 YPR011CYPR011C 981 nt13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.9 ms