Protein–RNA interactions for Protein: P36164

TVP38, Golgi apparatus membrane protein TVP38, yeastyeast

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TVP38P36164 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.84■■□□□ 1.25
TVP38P36164 NSR1YGR159C 1245 nt22.46■■□□□ 1.19
TVP38P36164 NOP1YDL014W 984 nt22.31■■□□□ 1.16
TVP38P36164 YKL036CYKL036C 393 nt20.83■□□□□ 0.93
TVP38P36164 MDJ1YFL016C 1536 nt19.67■□□□□ 0.74
TVP38P36164 Q0297Q0297 156 nt19.59■□□□□ 0.73
TVP38P36164 YJL027CYJL027C 417 nt19.5■□□□□ 0.71
TVP38P36164 SRX1YKL086W 384 nt19.48■□□□□ 0.71
TVP38P36164 SCS3YGL126W 1143 nt19.07■□□□□ 0.64
TVP38P36164 YCR051WYCR051W 669 nt18.54■□□□□ 0.56
TVP38P36164 YOL085CYOL085C 342 nt18.02■□□□□ 0.48
TVP38P36164 PKP1YIL042C 1185 nt17.74■□□□□ 0.43
TVP38P36164 RPP1BYDL130W 321 nt17.59■□□□□ 0.41
TVP38P36164 DBP2YNL112W 1641 nt17.49■□□□□ 0.39
TVP38P36164 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.43■□□□□ 0.38
TVP38P36164 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.43■□□□□ 0.38
TVP38P36164 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.43■□□□□ 0.38
TVP38P36164 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.43■□□□□ 0.38
TVP38P36164 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.43■□□□□ 0.38
TVP38P36164 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.43■□□□□ 0.38
TVP38P36164 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.43■□□□□ 0.38
TVP38P36164 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.43■□□□□ 0.38
TVP38P36164 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.43■□□□□ 0.38
TVP38P36164 CCC1YLR220W 969 nt17.33■□□□□ 0.36
TVP38P36164 SCJ1YMR214W 1134 nt17.22■□□□□ 0.35
TVP38P36164 ATS1YAL020C 1002 nt17.14■□□□□ 0.33
TVP38P36164 PET122YER153C 765 nt16.77■□□□□ 0.28
TVP38P36164 YBR190WYBR190W 312 nt16.71■□□□□ 0.27
TVP38P36164 SCR1SCR1 522 nt16.69■□□□□ 0.26
TVP38P36164 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.6■□□□□ 0.25
TVP38P36164 RVS167YDR388W 1449 nt16.55■□□□□ 0.24
TVP38P36164 RTC3YHR087W 336 nt16.4■□□□□ 0.22
TVP38P36164 RRN5YLR141W 1092 nt16.34■□□□□ 0.21
TVP38P36164 RSB1YOR049C 1065 nt16.08■□□□□ 0.16
TVP38P36164 YDJ1YNL064C 1230 nt16.05■□□□□ 0.16
TVP38P36164 SHR5YOL110W 714 nt16.02■□□□□ 0.16
TVP38P36164 YER088W-BYER088W-B 147 nt16■□□□□ 0.15
TVP38P36164 PST2YDR032C 597 nt15.82■□□□□ 0.12
TVP38P36164 GAR1YHR089C 618 nt15.68■□□□□ 0.1
TVP38P36164 DEP1YAL013W 1218 nt15.51■□□□□ 0.07
TVP38P36164 URN1YPR152C 1398 nt15.42■□□□□ 0.06
TVP38P36164 YKL097CYKL097C 411 nt15.35■□□□□ 0.05
TVP38P36164 YNL208WYNL208W 600 nt15.27■□□□□ 0.04
TVP38P36164 RPN10YHR200W 807 nt15.26■□□□□ 0.03
TVP38P36164 TIR1YER011W 765 nt15.13■□□□□ 0.01
TVP38P36164 OPI9YLR338W 858 nt15.13■□□□□ 0.01
TVP38P36164 SHU1YHL006C 453 nt15.12■□□□□ 0.01
TVP38P36164 SAH1YER043C 1350 nt14.98□□□□□ -0.01
TVP38P36164 PUT4YOR348C 1884 nt14.94□□□□□ -0.02
TVP38P36164 SSA1YAL005C 1929 nt14.88□□□□□ -0.03
TVP38P36164 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.84□□□□□ -0.03
TVP38P36164 ARE1YCR048W 1833 nt14.76□□□□□ -0.05
TVP38P36164 YJR018WYJR018W 363 nt14.74□□□□□ -0.05
TVP38P36164 PUN1YLR414C 792 nt14.7□□□□□ -0.06
TVP38P36164 YOR139CYOR139C 393 nt14.66□□□□□ -0.06
TVP38P36164 SRB2YHR041C 633 nt14.65□□□□□ -0.06
TVP38P36164 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.58□□□□□ -0.08
TVP38P36164 POA1YBR022W 534 nt14.55□□□□□ -0.08
TVP38P36164 RPP2BYDR382W 333 nt14.53□□□□□ -0.08
TVP38P36164 NPL3YDR432W 1245 nt14.52□□□□□ -0.09
TVP38P36164 WWM1YFL010C 636 nt14.51□□□□□ -0.09
TVP38P36164 YGR021WYGR021W 873 nt14.5□□□□□ -0.09
TVP38P36164 YJR120WYJR120W 351 nt14.5□□□□□ -0.09
TVP38P36164 PTC2YER089C 1395 nt14.48□□□□□ -0.09
TVP38P36164 HOM6YJR139C 1080 nt14.45□□□□□ -0.1
TVP38P36164 MNP1YGL068W 585 nt14.43□□□□□ -0.1
TVP38P36164 BUD23YCR047C 828 nt14.31□□□□□ -0.12
TVP38P36164 YOL037CYOL037C 354 nt14.28□□□□□ -0.12
TVP38P36164 BDH2YAL061W 1254 nt14.26□□□□□ -0.13
TVP38P36164 NAB2YGL122C 1578 nt14.26□□□□□ -0.13
TVP38P36164 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.25□□□□□ -0.13
TVP38P36164 RKM5YLR137W 1104 nt14.24□□□□□ -0.13
TVP38P36164 INM2YDR287W 879 nt14.18□□□□□ -0.14
TVP38P36164 SSA3YBL075C 1950 nt14.16□□□□□ -0.14
TVP38P36164 BSC6YOL137W 1494 nt14.14□□□□□ -0.15
TVP38P36164 LSM3YLR438C-A 270 nt14.13□□□□□ -0.15
TVP38P36164 FPR4YLR449W 1179 nt14.13□□□□□ -0.15
TVP38P36164 DAL1YIR027C 1383 nt14.11□□□□□ -0.15
TVP38P36164 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.1□□□□□ -0.15
TVP38P36164 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.1□□□□□ -0.15
TVP38P36164 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.1□□□□□ -0.15
TVP38P36164 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.1□□□□□ -0.15
TVP38P36164 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.1□□□□□ -0.15
TVP38P36164 YBL100CYBL100C 315 nt14.08□□□□□ -0.16
TVP38P36164 FIS1YIL065C 468 nt14.03□□□□□ -0.16
TVP38P36164 TRM9YML014W 840 nt13.98□□□□□ -0.17
TVP38P36164 PHO4YFR034C 939 nt13.97□□□□□ -0.17
TVP38P36164 YLR281CYLR281C 468 nt13.95□□□□□ -0.18
TVP38P36164 PUS2YGL063W 1113 nt13.93□□□□□ -0.18
TVP38P36164 FUN26YAL022C 1554 nt13.92□□□□□ -0.18
TVP38P36164 WHI5YOR083W 888 nt13.88□□□□□ -0.19
TVP38P36164 CCT6YDR188W 1641 nt13.77□□□□□ -0.21
TVP38P36164 ALF1YNL148C 765 nt13.69□□□□□ -0.22
TVP38P36164 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.66□□□□□ -0.22
TVP38P36164 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.66□□□□□ -0.22
TVP38P36164 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.66□□□□□ -0.22
TVP38P36164 MOT3YMR070W 1473 nt13.62□□□□□ -0.23
TVP38P36164 DSK2YMR276W 1122 nt13.61□□□□□ -0.23
TVP38P36164 YPS1YLR120C 1710 nt13.59□□□□□ -0.23
TVP38P36164 FMP45YDL222C 930 nt13.56□□□□□ -0.24
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